International Chemical Identifier

Dari Wikipedia bahasa Indonesia, ensiklopedia bebas
Lompat ke: navigasi, cari
InChI
Pengembang InChI Trust
Rilis perdana 15 April 2005 (2005-04-15)[1][2]
Rilis stabil
1.04 / September 2011; 6 tahun lalu (2011-09)
Status pengembangan Aktif
Sistem operasi Microsoft Windows and Unix-like
Serambi IA-32 and x86-64
Ukuran 4.3 MB
Ketersediaan bahasa Inggris
Lisensi IUPAC / InChI Trust Licence
Situs web http://www.iupac.org/home/publications/e-resources/inchi.html

IUPAC International Chemical Identifier (InChI) merupakan suatu identifier tekstual untuk bahan kimia, didesain sebagai standar dan cara pembacaan manusia untuk pengkodean informasi molekuler dan untuk membantu riset informasi tersebut dalam database dan web. Awalnya dikembangkan oleh IUPAC dan NIST selama tahun 2000–2005, format dan algoritmenya non-proprietary. Perkembangan selanjutnya standar ini telah didukung sejak tahun 2010 oleh yayasan nirlaba InChI Trust, di mana IUPAC adalah salah satu anggotanya. Versi terakhir adalah 1.04 yang dirilis pada bulan September 2011.

Format dan lapisan[sunting | sunting sumber]

InChI format
Jenis MIME chemical/x-inchi
Jenis format format berkas kimia

Setiap InChI dimulai dengan suatu string "InChI=" diikuti oleh nomor versi, saat ini "1". Ini diikuti oleh huruf "S" untuk "standard InChI". Informasi selebihnya disusun dalam struktur urutan lapisan (layer) dan sub-lapisan (sub-layer), di mana setiap lapisan memberikan satu jenis informasi tertentu. Lapisan-lapisan dan sub-lapisannya dipisahkan oleh delimiter "/" dan diawali dengan suatu huruf awalan khas (kecuali sub-lapisan rumus kimia dari lapisan utama). Enam lapisan dengan sub-lapisan penting adalah:

  1. Lapisan utama (Main layer)
    • Rumus kimia (tanpa awalan). Ini satu-satunya sub-layer yang harus ada pada setiap InChI.
    • Hubungan atom (awalan: "c" untuk "connection"). Atom-atom dalam rumus kimia (kecuali hidrogen) diberi nomor urut; sublayer ini memaparkan atom mana yang dihubungkan dengan ikatan-ikatan ke atom yang lain.
    • Atom Hidrogen (awalan: "h"). Memaparkan berapa atom hidrogen yang dihubungkan dengan masing-masing atom lain.
  2. Lapisan muatan
    • sublayer proton (awalan: "p" untuk "proton")
    • sublayer muatan ("charge"; awalan: "q")
  3. Lapisan stereokimia
    • ikatan ganda dan cumulene (awalan: "b")
    • tetrahedral stereochemistry atom-atom dan alena/allene (awalan: "t", "m")
    • jenis informasi stereokimia (awalan: "s")
  4. Isotopic layer (awalan: "i", "h", juga "b", "t", "m", "s" untuk stereokimia isotop)
  5. Fixed-H layer (awalan: "f"); contains some or all of the above types of layers except atom connections; may end with "o" sublayer; never included in standard InChI
  6. Reconnected layer (awalan: "r"); contains the whole InChI of a structure with reconnected metal atoms; never included in standard InChI

Format awalan-delimiter mempunyai keuntungan yaitu memudahkan pengguna memakai pencarian wildcard dalam menemukan identifier yang cocok hanya pada lapisan-lapisan tertentu.

Contoh[sunting | sunting sumber]

CH3CH2OH
etanol
InChI=1/C2H6O/c1-2-3/h3H,2H2,1H3

InChI=1S/C2H6O/c1-2-3/h3H,2H2,1H3 (standard InChI)

L-Ascorbic acid.svg
L-asam askorbat
InChI=1/C6H8O6/c7-1-2(8)5-3(9)4(10)6(11)12-5/h2,5,7-10H,1H2/t2-,5+/m0/s1

InChI=1S/C6H8O6/c7-1-2(8)5-3(9)4(10)6(11)12-5/h2,5,7-8,10-11H,1H2/t2-,5+/m0/s1 (standard InChI)

Pengadopsian[sunting | sunting sumber]

InChI telah diadopsi oleh banyak database besar dan kecil, termasuk ChemSpider dan PubChem. Namun, pengambilan ini tidak secara langsung, dan banyak database menunjukkan diskrepansi antara struktur kimia dan InChI yang dimuat, sehingga merupakan masalah bagi pengkaitan database.[3]

lihat pula[sunting | sunting sumber]

Referensi[sunting | sunting sumber]

  1. ^ "IUPAC International Chemical Identifier Project Page". IUPAC. Diakses tanggal 5 December 2012. 
  2. ^ DOI:10.1186/1758-2946-5-7
    Rujukan ini akan diselesaikan secara otomatis dalam beberapa menit. Anda dapat melewati antrian atau membuat secara manual
  3. ^ DOI:10.1186/1758-2946-4-35
    Rujukan ini akan diselesaikan secara otomatis dalam beberapa menit. Anda dapat melewati antrian atau membuat secara manual

Pranala luar[sunting | sunting sumber]

Dokumentasi dan presentasi[sunting | sunting sumber]

Software dan servis[sunting | sunting sumber]

  • NCI/CADD Chemical Identifier Resolver Generates and resolves InChI/InChIKeys and many other chemical identifiers
  • ChemSpider InChI resolver
  • Search Google for molecules (generates InChI from interactive chemical and searches Google for any pages with embedded InChIs). Requires Javascript enabled on browser
  • ChemSketch, free chemical structure drawing package that includes input and output in InCHI format
  • PubChem online molecule editor that supports SMILES/SMARTS and InChI
  • ChemSpider Services that allows generation of InChI and conversion of InChI to structure (also SMILES and generation of other properties)
  • MarvinSketch from ChemAxon, implementation to draw structures (or open other file formats) and output to InChI file format
  • BKchem implements its own InChI parser and uses the IUPAC implementation to generate InChI strings
  • CompoundSearch implements an InChI and InChI Key search of spectral libraries
  • JNI-InChI Java library that wraps the InChI library
  • the Chemistry Development Kit uses JNI-InChI to generate InChIs, can convert InChIs into structures, and generate tautomers based on the InChI algorithms
  • Bioclipse generates InChI and InChIKeys for drawn structures or opened files