ChEBI

Dari Wikipedia bahasa Indonesia, ensiklopedia bebas
Lompat ke: navigasi, cari
ChEBI
Konten
Deskripsi Database kimia
Jenis data Chemical Entities of Biological Interest
Kontak
Pusat penelitian European Molecular Biology Laboratory
Laboratorium Bendera Britania Raya European Bioinformatics Institute
Kutipan utama [1]
Akses
Situs web ChEBI
URL pengunduhan Downloads
URL layanan web Web Service
Endpoint Sparql BIO2RDF
Perangkat
Web ChEBI Website
Lain-lain
Frekuensi rilis data bulanan
Kebijakan kurasi Manually curated

ChEBI adalah singkatan dalam bahasa Inggris dari Chemical Entities of Biological Interest (Entiti kimia yang mempunyai kaitan menarik dengan biologi),[1][2] yaitu suatu database dan ontologi entiti molekuler yang berfokus pada senyawa kimia 'kecil', yang merupakan bagian dari upaya Open Biomedical Ontologies. Istilah "entiti molekuler" ("molecular entity") merujuk kepada apapun, yang berupa "atom, molekul, ion, pasangan ion, radikal, ion radikal, kompleks, konformer, dsb. yang berbeda secdara konstitutional atau isotopik, dapat diidentifikasi sebagai suatu entiti yang bisa dibedakan secara terpisah".[3] Entiti molekuler ini dapat merupakan produk alamiah atau produk sintetik yang memiliki potensi bioaktivitas. Molekul-molekul yang secara langsung dikodekan oleh genom, misalnya asam nukleat, protein dan peptida diturunkan dari pemotongan (cleavage) proteolitik, menurut aturannya tidak dimasukkan ke dalam ChEBI.

ChEBI menggunakan nomenklatur IUPAC, yaitu simbolisme dan terminologi yang dipakai oleh International Union of Pure and Applied Chemistry (IUPAC) dan Nomenclature Committee dari International Union of Biochemistry and Molecular Biology (NC-IUBMB).

Skop dan Akses[sunting | sunting sumber]

Semua data dalam database adalah non-proprietary atau diturunkan dari suatu sumber non-proprietary. Jadi dapat diakses dan tersedia secara bebas bagi semua orang. Lagipula, setiap item data dapat dilacak penuh dan secara eksplisit dirujuk ke sumber asalnya.

Data ChEBI tersedia melalui suatu "public web interface", Web Service dan download.

Lihat pula[sunting | sunting sumber]

Referensi[sunting | sunting sumber]

  1. ^ a b De Matos, P.; Alcantara, R.; Dekker, A.; Ennis, M.; Hastings, J.; Haug, K.; Spiteri, I.; Turner, S.; Steinbeck, C. (2009). "Chemical Entities of Biological Interest: An update". Nucleic Acids Research 38 (Database issue): D249–54. PMC 2808869. PMID 19854951. doi:10.1093/nar/gkp886. 
  2. ^ Degtyarenko, K.; De Matos, P.; Ennis, M.; Hastings, J.; Zbinden, M.; McNaught, A.; Alcantara, R.; Darsow, M. et al. (2007). "ChEBI: A database and ontology for chemical entities of biological interest". Nucleic Acids Research 36 (Database issue): D344–50. PMC 2238832. PMID 17932057. doi:10.1093/nar/gkm791. 
  3. ^ IUPAC, Compendium of Chemical Terminology, 2nd ed. (the "Gold Book") (1997). Online corrected version:  (2006–) "molecular entity".

Pranala luar[sunting | sunting sumber]