Lompat ke isi

SARS-CoV-2: Perbedaan antara revisi

Sunting pranala
Dari Wikipedia bahasa Indonesia, ensiklopedia bebas
Jelajahi riwayat secara interaktif
← Revisi sebelumnyaRevisi selanjutnya →
Konten dihapus Konten ditambahkan
VisualTeks wiki
RianHS (bicara | kontrib)
Pengurus
21.426 suntingan
Tidak ada ringkasan suntingan
RianHS (bicara | kontrib)
Pengurus
21.426 suntingan
Tidak ada ringkasan suntingan
Baris 28: Baris 28:
== Wabah ==
== Wabah ==
{{Utama|Wabah koronavirus baru 2019–2020}}
{{Utama|Wabah koronavirus baru 2019–2020}}
Satu-satunya wabah yang diketahui berasal dari Pasar Ikan Huanan di Wuhan, Tiongkok. Virus kemudian menyebar ke [[Bangkok]]; [[Tokyo]]; [[Seoul]]; [[Beijing]]; [[Shanghai]]; [[Guangdong]]; Dayuan ([[Taiwan]]); Hong Kong;<ref>{{cite news |title=China coronavirus: Hong Kong widens criteria for suspected cases after second patient confirmed, as MTR cancels Wuhan train ticket sales|url=https://www.scmp.com/news/hong-kong/health-environment/article/3047310/china-coronavirus-hong-kong-widens-criteria|newspaper=South China Morning Post |accessdate=23 January 2020|date=23 January 2020 }}</ref> [[Makau]]; [[Amerika Serikat]];<ref>{{cite news |title=China Virus Spreads to U.S. With Health Officials on High Alert|url=https://www.bloomberg.com/news/articles/2020-01-21/china-virus-s-spread-puts-global-health-officials-on-high-alert |publisher=Bloomberg L.P. |accessdate=21 January 2020|date=21 January 2020 }}</ref> [[Vietnam]];<ref>{{Cite web|url=https://www.straitstimes.com/asia/se-asia/vietnam-confirms-two-cases-of-sars-like-coronavirus|title=Wuhan virus: Vietnam confirms 2 cases of Sars-like coronavirus|last=hermesauto|date=23 January 2020|website=The Straits Times|access-date=23 January 2020}}</ref> dan [[Singapura]].<ref>{{Cite web|url=https://www.straitstimes.com/singapore/health/singapore-confirms-first-case-of-wuhan-virus|title=Singapore confirms first case of Wuhan virus|last=hermesauto|date=23 January 2020|website=The Straits Times|language=en|access-date=23 January 2020}}</ref> Korban jiwa berjumlah 26 yang sebagian besar berada di Wuhan dan sekitarnya, dengan 904 kasus per 24 Januari 2020.<ref>{{Cite web|url=https://3g.dxy.cn/newh5/view/pneumonia|title=全国新型肺炎实时动态|website=dxy.cn|date=23 Januari 2020|language=zh}}</ref><ref>{{Cite web|url=http://wsjkw.gxzf.gov.cn/xxgks/yqxx/ssyqdt/2020/0124/67964.html|title=2020年1月23日广西新型冠状病毒感染的肺炎疫情情况|lang=zh|trans-title=Situasi epidemi dari infeksi virus korona baru di Guangxi pada 23 Januari 2020|date=23 Januari 2020}}</ref><ref>{{Cite web|url=http://www.hebwst.gov.cn/index.do?id=394917&templet=content&cid=14|title=我省确诊第2例新型冠状病毒感染的肺炎病例|lang=zh|trans-title=Kasus pneumonia kedua yang disebabkan oleh coronavirus baru dikonfirmasi di provinsi kami|date=23 Januari 2020}}</ref>
Satu-satunya wabah yang diketahui berasal dari Pasar Ikan Huanan di Wuhan, Tiongkok. Virus kemudian menyebar ke [[Bangkok]]; [[Tokyo]]; [[Seoul]]; [[Beijing]]; [[Shanghai]]; [[Guangdong]]; Dayuan ([[Taiwan]]); Hong Kong;<ref>{{cite news |title=China coronavirus: Hong Kong widens criteria for suspected cases after second patient confirmed, as MTR cancels Wuhan train ticket sales|url=https://www.scmp.com/news/hong-kong/health-environment/article/3047310/china-coronavirus-hong-kong-widens-criteria|newspaper=South China Morning Post |accessdate=23 Januari 2020|date=23 Januari 2020 }}</ref> [[Makau]]; [[Amerika Serikat]];<ref>{{cite news |title=China Virus Spreads to U.S. With Health Officials on High Alert|url=https://www.bloomberg.com/news/articles/2020-01-21/china-virus-s-spread-puts-global-health-officials-on-high-alert |publisher=Bloomberg L.P. |accessdate=21 Januari 2020|date=21 Januari 2020 }}</ref> [[Vietnam]];<ref>{{Cite web|url=https://www.straitstimes.com/asia/se-asia/vietnam-confirms-two-cases-of-sars-like-coronavirus|title=Wuhan virus: Vietnam confirms 2 cases of Sars-like coronavirus|last=hermesauto|date=23 Januari 2020|website=The Straits Times|access-date=23 Januari 2020}}</ref> dan [[Singapura]].<ref>{{Cite web|url=https://www.straitstimes.com/singapore/health/singapore-confirms-first-case-of-wuhan-virus|title=Singapore confirms first case of Wuhan virus|last=hermesauto|date=23 Januari 2020|website=The Straits Times|language=en|access-date=23 Januari 2020}}</ref> Korban jiwa berjumlah 26 yang sebagian besar berada di Wuhan dan sekitarnya, dengan 904 kasus per 24 Januari 2020.<ref>{{Cite web|url=https://3g.dxy.cn/newh5/view/pneumonia|title=全国新型肺炎实时动态|website=dxy.cn|date=23 Januari 2020|language=zh}}</ref><ref>{{Cite web|url=http://wsjkw.gxzf.gov.cn/xxgks/yqxx/ssyqdt/2020/0124/67964.html|title=2020年1月23日广西新型冠状病毒感染的肺炎疫情情况|lang=zh|trans-title=Situasi epidemi dari infeksi virus korona baru di Guangxi pada 23 Januari 2020|date=23 Januari 2020}}</ref><ref>{{Cite web|url=http://www.hebwst.gov.cn/index.do?id=394917&templet=content&cid=14|title=我省确诊第2例新型冠状病毒感染的肺炎病例|lang=zh|trans-title=Kasus pneumonia kedua yang disebabkan oleh coronavirus baru dikonfirmasi di provinsi kami|date=23 Januari 2020}}</ref>


== Patologi ==
== Patologi ==
=== Gejala saat pemeriksaan ===
=== Gejala saat pemeriksaan ===
Gejala yang dilaporkan termasuk demam pada 90% kasus,<ref name=Hui14Jan2020>Hui DS, I Azhar E, Madani TA, Ntoumi F, Kock R, Dar O, Ippolito G, Mchugh TD, Memish ZA, Drosten C, Zumla A, Petersen E. The continuing 2019-nCoV epidemic threat of novel coronaviruses to global health – The latest 2019 novel coronavirus outbreak in Wuhan, China. ''Int J Infect Dis''. 2020 Jan 14;91:264–266. {{pmid|31953166}} {{doi|10.1016/j.ijid.2020.01.009}} {{open access}}</ref> kelelahan dan batuk kering pada 80% kasus,<ref name=Hui14Jan2020/><ref name="wmhc2020-01-11">{{cite web|url=http://wjw.wuhan.gov.cn/front/web/showDetail/2020011109036|title=Experts explain the latest bulletin of unknown cause of viral pneumonia|date=11 January 2020|website=Wuhan Municipal Health Commission|access-date=11 January 2020|archive-url=https://web.archive.org/web/20200111031745/http://wjw.wuhan.gov.cn/front/web/showDetail/2020011109036|archive-date=11 January 2020|url-status=live}}</ref> dan sesak napas (20% kasus), dengan gangguan pernapasan (15% kasus).<ref name="wmhc2020-01-11" /> Sinar-X pada dada menunjukkan tanda-tanda di kedua paru-paru. Tanda-tanda vital umumnya stabil pada saat pasien masuk ke rumah sakit.<ref name="wmhc2020-01-11" /> Pemeriksaan darah umumnya menunjukkan leukopenia (penurunan [[sel darah putih]]) dan limfositopenia (penurunan [[limfosit]]).<ref name=Hui14Jan2020/>
Gejala yang dilaporkan termasuk demam pada 90% kasus,<ref name=Hui14Jan2020>Hui DS, I Azhar E, Madani TA, Ntoumi F, Kock R, Dar O, Ippolito G, Mchugh TD, Memish ZA, Drosten C, Zumla A, Petersen E. The continuing 2019-nCoV epidemic threat of novel coronaviruses to global health – The latest 2019 novel coronavirus outbreak in Wuhan, China. ''Int J Infect Dis''. 2020 Jan 14;91:264–266. {{pmid|31953166}} {{doi|10.1016/j.ijid.2020.01.009}} {{open access}}</ref> kelelahan dan batuk kering pada 80% kasus,<ref name=Hui14Jan2020/><ref name="wmhc2020-01-11">{{cite web|url=http://wjw.wuhan.gov.cn/front/web/showDetail/2020011109036|title=Experts explain the latest bulletin of unknown cause of viral pneumonia|date=11 Januari 2020|website=Wuhan Municipal Health Commission|access-date=11 Januari 2020|archive-url=https://web.archive.org/web/20200111031745/http://wjw.wuhan.gov.cn/front/web/showDetail/2020011109036|archive-date=11 Januari 2020|url-status=live}}</ref> dan sesak napas (20% kasus), dengan gangguan pernapasan (15% kasus).<ref name="wmhc2020-01-11" /> Sinar-X pada dada menunjukkan tanda-tanda di kedua paru-paru. Tanda-tanda vital umumnya stabil pada saat pasien masuk ke rumah sakit.<ref name="wmhc2020-01-11" /> Pemeriksaan darah umumnya menunjukkan leukopenia (penurunan [[sel darah putih]]) dan limfositopenia (penurunan [[limfosit]]).<ref name=Hui14Jan2020/>


=== Penularan ===
=== Penularan ===
Penularan dari manusia ke manusia dikonfirmasi di [[Guangdong]], Tiongkok, menurut [[Zhong Nanshan]], kepala tim komisi kesehatan yang menyelidiki wabah tersebut.<ref>{{Cite news|url=https://www.cbc.ca/news/health/coronavirus-human-to-human-1.5433187|title=China confirms human-to-human transmission of new coronavirus|date=20 January 2020|publisher=CBC News|access-date=21 January 2020|url-status=live}}</ref>
Penularan dari manusia ke manusia dikonfirmasi di [[Guangdong]], Tiongkok, menurut [[Zhong Nanshan]], kepala tim komisi kesehatan yang menyelidiki wabah tersebut.<ref>{{Cite news|url=https://www.cbc.ca/news/health/coronavirus-human-to-human-1.5433187|title=China confirms human-to-human transmission of new coronavirus|date=20 Januari 2020|publisher=CBC News|access-date=21 Januari 2020|url-status=live}}</ref>


=== Pengobatan ===
=== Pengobatan ===
Saat ini tidak ada pengobatan khusus untuk 2019-nCoV, tetapi [[obat antivirus]] yang ada dapat digunakan.<ref>{{Cite news|url=https://www.reuters.com/article/us-china-health-pneumonia-who-idUSKBN1ZD16J|title=WHO says new China coronavirus could spread, warns hospitals worldwide|date=14 January 2020|agency=Reuters|access-date=21 January 2020}}</ref>
Saat ini tidak ada pengobatan khusus untuk 2019-nCoV, tetapi [[obat antivirus]] yang ada dapat digunakan.<ref>{{Cite news|url=https://www.reuters.com/article/us-china-health-pneumonia-who-idUSKBN1ZD16J|title=WHO says new China coronavirus could spread, warns hospitals worldwide|date=14 Januari 2020|agency=Reuters|access-date=21 Januari 2020}}</ref>


== Reservoir ==
== Reservoir ==
Pada 22 Januari 2020, ''[[Journal of Medical Virology]]'' menerbitkan laporan analisis genom yang menjelaskan bahwa [[ular]] di wilayah Wuhan adalah "reservoir hewan liar yang paling mungkin" untuk virus ini, tetapi diperlukan lebih banyak penelitian.<ref name="BBC">[https://www.bbc.com/news/world-asia-china-51217455 BBC: China coronavirus: Fear grips Wuhan as lockdown begins]</ref><ref>[https://www.cnn.com/2020/01/22/health/snakes-wuhan-coronavirus-outbreak-conversation-partner/index.html CNN: Snakes could be the source of the Wuhan coronavirus outbreak]</ref> [[Rekombinasi homolog]] mungkin menyebabkan peristiwa ini <ref name="ji-wei-2020">{{cite journal |last1=Ji |first1=Wei |last2=Wang |first2=Wei |last3=Zhao |first3=Xiaofang |last4=Zai |first4=Junjie |last5=Li |first5=Xingguang |title=Homologous recombination within the spike glycoprotein of the newly identified coronavirus may boost cross‐species transmission from snake to human |journal=Journal of Medical Virology |date=22 January 2020 |doi=10.1002/jmv.25682 |pmid=31967321 }}</ref><ref>{{cite news |author1=Haitao Guo |author2=Guangxiang "George" Luo |author3=Shou-Jiang Gao |title=Snakes could be the original source of the new coronavirus outbreak in China |url=https://theconversation.com/snakes-could-be-the-original-source-of-the-new-coronavirus-outbreak-in-china-130364 |accessdate=22 January 2020 |work=The Conversation |date=22 January 2020}}</ref> Beberapa ilmuwan percaya bahwa penyakit ini berasal dari ''[[Bungarus multicinctus]]'', ular yang sangat berbisa yang dijual di pasar Wuhan.<ref>{{Cite web|url=https://www.scimex.org/newsfeed/expert-reaction-could-new-coronavirus-have-come-from-snakes|title=EXPERT REACTION: Could new coronavirus have come from snakes?|last=SCIMEX|date= 23 January 2020 |website=Scimex |access-date=23 January 2020}}</ref>
Pada 22 Januari 2020, ''[[Journal of Medical Virology]]'' menerbitkan laporan analisis genom yang menjelaskan bahwa [[ular]] di wilayah Wuhan adalah "reservoir hewan liar yang paling mungkin" untuk virus ini, tetapi diperlukan lebih banyak penelitian.<ref name="BBC">[https://www.bbc.com/news/world-asia-china-51217455 BBC: China coronavirus: Fear grips Wuhan as lockdown begins]</ref><ref>[https://www.cnn.com/2020/01/22/health/snakes-wuhan-coronavirus-outbreak-conversation-partner/index.html CNN: Snakes could be the source of the Wuhan coronavirus outbreak]</ref> [[Rekombinasi homolog]] mungkin menyebabkan peristiwa ini <ref name="ji-wei-2020">{{cite journal |last1=Ji |first1=Wei |last2=Wang |first2=Wei |last3=Zhao |first3=Xiaofang |last4=Zai |first4=Junjie |last5=Li |first5=Xingguang |title=Homologous recombination within the spike glycoprotein of the newly identified coronavirus may boost cross‐species transmission from snake to human |journal=Journal of Medical Virology |date=22 Januari 2020 |doi=10.1002/jmv.25682 |pmid=31967321 }}</ref><ref>{{cite news |author1=Haitao Guo |author2=Guangxiang "George" Luo |author3=Shou-Jiang Gao |title=Snakes could be the original source of the new coronavirus outbreak in China |url=https://theconversation.com/snakes-could-be-the-original-source-of-the-new-coronavirus-outbreak-in-china-130364 |accessdate=22 Januari 2020 |work=The Conversation |date=22 Januari 2020}}</ref> Beberapa ilmuwan percaya bahwa penyakit ini berasal dari ''[[Bungarus multicinctus]]'', ular yang sangat berbisa yang dijual di pasar Wuhan.<ref>{{Cite web|url=https://www.scimex.org/newsfeed/expert-reaction-could-new-coronavirus-have-come-from-snakes|title=EXPERT REACTION: Could new coronavirus have come from snakes?|last=SCIMEX|date= 23 Januari 2020 |website=Scimex |access-date=23 Januari 2020}}</ref>


Berita di ''[[Nature (journal)|Nature]]'' mengkritik artikel ''Journal of Medical Virology'' dengan menyatakan bahwa ular sangat tidak mungkin menjadi reservoir, dan lebih cenderung pada [[mamalia]].<ref>{{cite journal|url=https://www.nature.com/articles/d41586-020-00180-8 |title=Why snakes probably aren't spreading the new China virus |authors=Ewen Callaway, David Cyranoski |journal=Nature |date=23 January 2020 |doi=10.1038/d41586-020-00180-8}}</ref> Banyak virolog juga sangat meragukan peranan ular sebagai inang perantara.<ref>https://www.wired.com/story/wuhan-coronavirus-snake-flu-theory/</ref>
Berita di ''[[Nature (journal)|Nature]]'' mengkritik artikel ''Journal of Medical Virology'' dengan menyatakan bahwa ular sangat tidak mungkin menjadi reservoir, dan lebih cenderung pada [[mamalia]].<ref>{{cite journal|url=https://www.nature.com/articles/d41586-020-00180-8 |title=Why snakes probably aren't spreading the new China virus |authors=Ewen Callaway, David Cyranoski |journal=Nature |date=23 Januari 2020 |doi=10.1038/d41586-020-00180-8}}</ref> Banyak virolog juga sangat meragukan peranan ular sebagai inang perantara.<ref>https://www.wired.com/story/wuhan-coronavirus-snake-flu-theory/</ref>


Artikel pracetak yang dipublikasikan pada 23 Januari 2020 di jurnal [[bioRxiv]] yang ditulis oleh peneliti dari Institut Virologi Wuhan, Rumah Sakit Wuhan Jinyintan, Universitas Akademi Sains Tiongkok dan Pusat Pengendalian dan Pencegahan Penyakit menyatakan bahwa virus korona ini kemungkinan berasal dari kelelawar, karena analisis mereka menunjukkan bahwa nCoV-2019 96% identik di tingkat genom keseluruhan dengan koronavirus [[kelelawar]].<ref name="bioRxivBatOrigin">{{cite web |title=Discovery of a novel coronavirus associated with the recent pneumonia outbreak in humans and its potential bat origin |url=https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2020.01.22.914952v2 |website=bioRxiv |publisher=[[bioRxiv]] |accessdate=January 24, 2020|date=January 23, 2020}}</ref>
Artikel pracetak yang dipublikasikan pada 23 Januari 2020 di jurnal [[bioRxiv]] yang ditulis oleh peneliti dari Institut Virologi Wuhan, Rumah Sakit Wuhan Jinyintan, Universitas Akademi Sains Tiongkok dan Pusat Pengendalian dan Pencegahan Penyakit menyatakan bahwa virus korona ini kemungkinan berasal dari [[kelelawar]], karena analisis mereka menunjukkan bahwa nCoV-2019 96% identik di tingkat genom keseluruhan dengan koronavirus kelelawar.<ref name="bioRxivBatOrigin">{{cite web |title=Discovery of a novel coronavirus associated with the recent pneumonia outbreak in humans and its potential bat origin |url=https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2020.01.22.914952v2 |website=bioRxiv |publisher=[[bioRxiv]] |accessdate=Januari 24, 2020|date=23 Januari 2020}}</ref>

== Filogenetik dan taksonomi ==
Virus ini berasal dari genus ''[[betacoronavirus]]'' dalam keluarga [[koronavirus]]. Penyakit yang disebabkan keluarga virus korona dapat berkisar dari [[pilek]] biasa hingga penyakit yang lebih parah seperti [[sindrom pernapasan Timur Tengah]] (MERS) dan [[sindrom pernapasan akut berat]] (SARS). Virus korona adalah keluarga virus yang luas, tetapi hanya enam (229E, NL63, OC43, HKU1, MERS-CoV, dan SARS-CoV) yang sebelumnya diketahui menginfeksi manusia; 2019-nCoV merupakan jenis ketujuh yang menginfeksi manusia.

Urutan genom betacoronavirus Wuhan menunjukkan kesamaan dengan betacoronavirus yang ditemukan pada kelelawar. Namun, virus ini secara genetik berbeda dari coronavirus lain seperti coronavirus terkait SARS dan MERS.<ref name=":1" /> Seperti SARS-CoV, virus ini merupakan anggota dari Beta-CoV garis keturunan B<ref>{{cite web |title=Phylogeny of SARS-like betacoronaviruses |url=https://nextstrain.org/groups/blab/sars-like-cov |website=nextstrain |accessdate=18 Januari 2020}}</ref><ref name=Hui14Jan2020>Hui DS, I Azhar E, Madani TA, Ntoumi F, Kock R, Dar O, Ippolito G, Mchugh TD, Memish ZA, Drosten C, Zumla A, Petersen E. The continuing 2019-nCoV epidemic threat of novel coronaviruses to global health – The latest 2019 novel coronavirus outbreak in Wuhan, China. ''Int J Infect Dis''. 2020 Jan 14;91:264–266. {{pmid|31953166}} {{doi|10.1016/j.ijid.2020.01.009}} {{open access}}</ref> (yaitu subgenus ''[[Sarbecovirus]]''<ref name="Wong2019">Antonio C. P. Wong, Xin Li, Susanna K. P. Lau, Patrick C. Y. Woo: [https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC6409556/ Global Epidemiology of Bat Coronaviruses], in: Viruses. 2019 Feb; 11(2): 174, [[doi:10.3390/v11020174]]</ref>).
Delapan belas<ref>{{Cite web|url=https://nextstrain.org/ncov|title=Genomic epidemiology of novel coronavirus (nCoV) using data generated by Fudan University, China CDC, Chinese Academy of Medical Sciences, Chinese Academy of Sciences, Zhejiang Provincial Center for Disease Control and Prevention and the Thai National Institute of Health shared via GISAID|last=Trevor Bedford and Richard Neher|website=nextstrain.org|url-status=live|access-date=22 Januari 2020}}</ref> genom virus korona baru ini telah diisolasi dan dilaporkan termasuk BetaCoV/Wuhan/IVDC-HB-01/2019, BetaCoV/Wuhan/IVDC-HB-04/2020, BetaCoV/Wuhan/IVDC-HB-05/2019, BetaCoV/Wuhan/WIV04/2019, dan BetaCoV/Wuhan/IPBCAMS-WH-01/2019 dari [[Chinese Center for Disease Control and Prevention|CDC Tiongkok]], Institut Biologi Patogen, dan Rumah Sakit Wuhan Jinyintan.<ref name=":1" /><ref>{{cite web|url=http://virological.org/t/initial-genome-release-of-novel-coronavirus/319|title=Initial genome release of novel coronavirus|date=11 Januari 2020|website=Virological|access-date=12 Januari 2020}}</ref><ref>{{Cite journal|date=17 Januari 2020|title=Wuhan seafood market pneumonia virus isolate Wuhan-Hu-1, complete genome|url=http://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/MN908947.3|publisher=ncbi.nlm.nih.gov}}</ref> Panjang urutan [[RNA]] yang dimilikinya sekitar 30 kbp.<ref name=":1" /> Model struktural komparatif dari protease koronavirus 2019-nCoV tersedia dari Innophore GmbH, dengan beberapa percobaan obat melawan inhibitor protease virus telah dilakukan.<ref>{{cite web |last1=Gruber |first1=Christian |last2=Steinkellner |first2=Georg |title=Wuhan coronavirus 2019-nCoV - what we can find out on a structural bioinformatics level |url=https://innophore.com/2019-ncov/ |website=Innophore Enzyme Discovery |publisher=Innophore GmbH |date=23 Januari 2020}}</ref>


== Referensi ==
== Referensi ==

Revisi per 24 Januari 2020 12.16

SARS-CoV-2
Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus Edit nilai pada Wikidata

Edit nilai pada Wikidata
Rekaman
Edit nilai pada Wikidata
Komposisi genom virus ICTVpositive-sense single-stranded RNA virus (en) Terjemahkan Edit nilai pada Wikidata
Penemu atau penciptaZhang Jixian Edit nilai pada Wikidata
PenyakitPandemi koronavirus 2019–2020 dan Covid-19 Edit nilai pada Wikidata
Jumlah genom29.903 Edit nilai pada Wikidata
Taksonomi
KerajaanOrthornavirae
FilumPisuviricota
KelasPisoniviricetes
OrdoNidovirales
FamiliCoronaviridae
GenusBetacoronavirus
SpesiesSevere acute respiratory syndrome-related coronavirus Edit nilai pada Wikidata
Tata nama
Asal namaSARS-CoV Edit nilai pada Wikidata
Sinonim takson
  • Wuhan coronavirus
  • Wuhan seafood market pneumonia virus
SARS-CoV-2 di Tiongkok
SARS-CoV-2

Wuhan, China, the primary location of the only recorded outbreak
Informasi genomik
Susunan genom (klik untuk memperbesar)
ID genom NCBIMN908947
Jumlah genom30,473 bases
Tahun penyelesaian2020

Virus korona baru, dilambangkan 2019-nCoV oleh Organisasi Kesehatan Dunia (WHO) (Hanzi: 2019新型冠狀病毒)[1][2] dan juga dikenal sebagai virus korona wuhan (Hanzi sederhana: 武汉冠状病毒; Hanzi tradisional: 武漢冠狀病毒), dan virus pneumonia pasar makanan laut wuhan (Wuhan seafood market pneumonia virus),[3] adalah salah satu anggota virus korona. Dugaan kasus pertama dilaporkan ke WHO pada tanggal 31 Desember 2019[4] dengan gejala penyakit pertama muncul tiga pekan sebelumnya pada 8 Desember 2019.[5] Genom virus ini telah diurutkan setelah sampel dengan pengujian asam nukleat positif dari pasien dengan pneumonia selama wabah koronavirus baru 2019–2020.[6][7][8]

Wabah

Artikel utama: Wabah koronavirus baru 2019–2020

Satu-satunya wabah yang diketahui berasal dari Pasar Ikan Huanan di Wuhan, Tiongkok. Virus kemudian menyebar ke Bangkok; Tokyo; Seoul; Beijing; Shanghai; Guangdong; Dayuan (Taiwan); Hong Kong;[9] Makau; Amerika Serikat;[10] Vietnam;[11] dan Singapura.[12] Korban jiwa berjumlah 26 yang sebagian besar berada di Wuhan dan sekitarnya, dengan 904 kasus per 24 Januari 2020.[13][14][15]

Patologi

Gejala saat pemeriksaan

Gejala yang dilaporkan termasuk demam pada 90% kasus,[16] kelelahan dan batuk kering pada 80% kasus,[16][17] dan sesak napas (20% kasus), dengan gangguan pernapasan (15% kasus).[17] Sinar-X pada dada menunjukkan tanda-tanda di kedua paru-paru. Tanda-tanda vital umumnya stabil pada saat pasien masuk ke rumah sakit.[17] Pemeriksaan darah umumnya menunjukkan leukopenia (penurunan sel darah putih) dan limfositopenia (penurunan limfosit).[16]

Penularan

Penularan dari manusia ke manusia dikonfirmasi di Guangdong, Tiongkok, menurut Zhong Nanshan, kepala tim komisi kesehatan yang menyelidiki wabah tersebut.[18]

Pengobatan

Saat ini tidak ada pengobatan khusus untuk 2019-nCoV, tetapi obat antivirus yang ada dapat digunakan.[19]

Reservoir

Pada 22 Januari 2020, Journal of Medical Virology menerbitkan laporan analisis genom yang menjelaskan bahwa ular di wilayah Wuhan adalah "reservoir hewan liar yang paling mungkin" untuk virus ini, tetapi diperlukan lebih banyak penelitian.[20][21] Rekombinasi homolog mungkin menyebabkan peristiwa ini [22][23] Beberapa ilmuwan percaya bahwa penyakit ini berasal dari Bungarus multicinctus, ular yang sangat berbisa yang dijual di pasar Wuhan.[24]

Berita di Nature mengkritik artikel Journal of Medical Virology dengan menyatakan bahwa ular sangat tidak mungkin menjadi reservoir, dan lebih cenderung pada mamalia.[25] Banyak virolog juga sangat meragukan peranan ular sebagai inang perantara.[26]

Artikel pracetak yang dipublikasikan pada 23 Januari 2020 di jurnal bioRxiv yang ditulis oleh peneliti dari Institut Virologi Wuhan, Rumah Sakit Wuhan Jinyintan, Universitas Akademi Sains Tiongkok dan Pusat Pengendalian dan Pencegahan Penyakit menyatakan bahwa virus korona ini kemungkinan berasal dari kelelawar, karena analisis mereka menunjukkan bahwa nCoV-2019 96% identik di tingkat genom keseluruhan dengan koronavirus kelelawar.[27]

Filogenetik dan taksonomi

Virus ini berasal dari genus betacoronavirus dalam keluarga koronavirus. Penyakit yang disebabkan keluarga virus korona dapat berkisar dari pilek biasa hingga penyakit yang lebih parah seperti sindrom pernapasan Timur Tengah (MERS) dan sindrom pernapasan akut berat (SARS). Virus korona adalah keluarga virus yang luas, tetapi hanya enam (229E, NL63, OC43, HKU1, MERS-CoV, dan SARS-CoV) yang sebelumnya diketahui menginfeksi manusia; 2019-nCoV merupakan jenis ketujuh yang menginfeksi manusia.

Urutan genom betacoronavirus Wuhan menunjukkan kesamaan dengan betacoronavirus yang ditemukan pada kelelawar. Namun, virus ini secara genetik berbeda dari coronavirus lain seperti coronavirus terkait SARS dan MERS.[8] Seperti SARS-CoV, virus ini merupakan anggota dari Beta-CoV garis keturunan B[28][16] (yaitu subgenus Sarbecovirus[29]). Delapan belas[30] genom virus korona baru ini telah diisolasi dan dilaporkan termasuk BetaCoV/Wuhan/IVDC-HB-01/2019, BetaCoV/Wuhan/IVDC-HB-04/2020, BetaCoV/Wuhan/IVDC-HB-05/2019, BetaCoV/Wuhan/WIV04/2019, dan BetaCoV/Wuhan/IPBCAMS-WH-01/2019 dari CDC Tiongkok, Institut Biologi Patogen, dan Rumah Sakit Wuhan Jinyintan.[8][31][32] Panjang urutan RNA yang dimilikinya sekitar 30 kbp.[8] Model struktural komparatif dari protease koronavirus 2019-nCoV tersedia dari Innophore GmbH, dengan beberapa percobaan obat melawan inhibitor protease virus telah dilakukan.[33]

Referensi

  1. ^ "Surveillance case definitions for human infection with novel coronavirus (nCoV)". who.int. Diakses tanggal 21 Januari 2020. 
  2. ^ "Novel coronavirus (2019-nCoV), Wuhan, China". cdc.gov. cdc.gov. 10 Januari 2020. Diakses tanggal 16 Januari 2020. 
  3. ^ Zhang, Y.-Z.; et al. (12 Januari 2020). "Wuhan seafood market pneumonia virus isolate Wuhan-Hu-1, complete genome". GenBank. Bethesda MD. Diakses tanggal 13 Januari 2020. 
  4. ^ "Pneumonia of unknown cause – China. Disease outbreak news". World Health Organization. 5 Januari 2020. Diarsipkan dari versi asli tanggal 7 Januari 2020. Diakses tanggal 6 Januari 2020. 
  5. ^ Schnirring, Lisa (14 Januari 2020). "Report: Thailand's coronavirus patient didn't visit outbreak market". CIDRAP (dalam bahasa Inggris). Diarsipkan dari versi asli tanggal 14 Januari 2020. Diakses tanggal 15 Januari 2020. 
  6. ^ "中国疾病预防控制中心". chinacdc.cn. Diakses tanggal 9 Januari 2020. 
  7. ^ "New-type coronavirus causes pneumonia in Wuhan: expert". Xinhua. Diakses tanggal 9 Januari 2020. 
  8. ^ a b c d "CoV2020". platform.gisaid.org. Diakses tanggal 12 Januari 2020. 
  9. ^ "China coronavirus: Hong Kong widens criteria for suspected cases after second patient confirmed, as MTR cancels Wuhan train ticket sales". South China Morning Post. 23 Januari 2020. Diakses tanggal 23 Januari 2020. 
  10. ^ "China Virus Spreads to U.S. With Health Officials on High Alert". Bloomberg L.P. 21 Januari 2020. Diakses tanggal 21 Januari 2020. 
  11. ^ hermesauto (23 Januari 2020). "Wuhan virus: Vietnam confirms 2 cases of Sars-like coronavirus". The Straits Times. Diakses tanggal 23 Januari 2020. 
  12. ^ hermesauto (23 Januari 2020). "Singapore confirms first case of Wuhan virus". The Straits Times (dalam bahasa Inggris). Diakses tanggal 23 Januari 2020. 
  13. ^ "全国新型肺炎实时动态". dxy.cn (dalam bahasa Tionghoa). 23 Januari 2020. 
  14. ^ "2020年1月23日广西新型冠状病毒感染的肺炎疫情情况" [Situasi epidemi dari infeksi virus korona baru di Guangxi pada 23 Januari 2020] (dalam bahasa Tionghoa). 23 Januari 2020. 
  15. ^ "我省确诊第2例新型冠状病毒感染的肺炎病例" [Kasus pneumonia kedua yang disebabkan oleh coronavirus baru dikonfirmasi di provinsi kami] (dalam bahasa Tionghoa). 23 Januari 2020. 
  16. ^ a b c d Hui DS, I Azhar E, Madani TA, Ntoumi F, Kock R, Dar O, Ippolito G, Mchugh TD, Memish ZA, Drosten C, Zumla A, Petersen E. The continuing 2019-nCoV epidemic threat of novel coronaviruses to global health – The latest 2019 novel coronavirus outbreak in Wuhan, China. Int J Infect Dis. 2020 Jan 14;91:264–266. PMID 31953166 DOI:10.1016/j.ijid.2020.01.009 publikasi akses terbuka - bebas untuk dibuka
  17. ^ a b c "Experts explain the latest bulletin of unknown cause of viral pneumonia". Wuhan Municipal Health Commission. 11 Januari 2020. Diarsipkan dari versi asli tanggal 11 Januari 2020. Diakses tanggal 11 Januari 2020. 
  18. ^ "China confirms human-to-human transmission of new coronavirus". CBC News. 20 Januari 2020. Diakses tanggal 21 Januari 2020. 
  19. ^ "WHO says new China coronavirus could spread, warns hospitals worldwide". Reuters. 14 Januari 2020. Diakses tanggal 21 Januari 2020. 
  20. ^ BBC: China coronavirus: Fear grips Wuhan as lockdown begins
  21. ^ CNN: Snakes could be the source of the Wuhan coronavirus outbreak
  22. ^ Ji, Wei; Wang, Wei; Zhao, Xiaofang; Zai, Junjie; Li, Xingguang (22 Januari 2020). "Homologous recombination within the spike glycoprotein of the newly identified coronavirus may boost cross‐species transmission from snake to human". Journal of Medical Virology. doi:10.1002/jmv.25682. PMID 31967321. 
  23. ^ Haitao Guo; Guangxiang "George" Luo; Shou-Jiang Gao (22 Januari 2020). "Snakes could be the original source of the new coronavirus outbreak in China". The Conversation. Diakses tanggal 22 Januari 2020. 
  24. ^ SCIMEX (23 Januari 2020). "EXPERT REACTION: Could new coronavirus have come from snakes?". Scimex. Diakses tanggal 23 Januari 2020. 
  25. ^ Ewen Callaway, David Cyranoski (23 Januari 2020). "Why snakes probably aren't spreading the new China virus". Nature. doi:10.1038/d41586-020-00180-8. 
  26. ^ https://www.wired.com/story/wuhan-coronavirus-snake-flu-theory/
  27. ^ "Discovery of a novel coronavirus associated with the recent pneumonia outbreak in humans and its potential bat origin". bioRxiv. bioRxiv. 23 Januari 2020. Diakses tanggal Januari 24, 2020. 
  28. ^ "Phylogeny of SARS-like betacoronaviruses". nextstrain. Diakses tanggal 18 Januari 2020. 
  29. ^ Antonio C. P. Wong, Xin Li, Susanna K. P. Lau, Patrick C. Y. Woo: Global Epidemiology of Bat Coronaviruses, in: Viruses. 2019 Feb; 11(2): 174, doi:10.3390/v11020174
  30. ^ Trevor Bedford and Richard Neher. "Genomic epidemiology of novel coronavirus (nCoV) using data generated by Fudan University, China CDC, Chinese Academy of Medical Sciences, Chinese Academy of Sciences, Zhejiang Provincial Center for Disease Control and Prevention and the Thai National Institute of Health shared via GISAID". nextstrain.org. Diakses tanggal 22 Januari 2020. 
  31. ^ "Initial genome release of novel coronavirus". Virological. 11 Januari 2020. Diakses tanggal 12 Januari 2020. 
  32. ^ "Wuhan seafood market pneumonia virus isolate Wuhan-Hu-1, complete genome". ncbi.nlm.nih.gov. 17 Januari 2020. 
  33. ^ Gruber, Christian; Steinkellner, Georg (23 Januari 2020). "Wuhan coronavirus 2019-nCoV - what we can find out on a structural bioinformatics level". Innophore Enzyme Discovery. Innophore GmbH. 

Pranala luar

Wikimedia Commons memiliki media mengenai SARS-CoV-2.
Lihat entri Wuhan pneumonia di kamus bebas Wiktionary.
Diperoleh dari "https://id.wikipedia.org/w/index.php?title=SARS-CoV-2&oldid=16478611"