Rotavirus: Perbedaan antara revisi

Dari Wikipedia bahasa Indonesia, ensiklopedia bebas
Konten dihapus Konten ditambahkan
Tidak ada ringkasan suntingan
Tag: Suntingan visualeditor-wikitext
Baris 33: Baris 33:


=== Protein ===
=== Protein ===
[[Berkas:Rotavirus_Structure.png|al=A cut-up image of a single rotavirus particle showing the RNA moecules surrounded by the VP6 protein and this in turn surrounded by the VP7 protein. The V4 protein protrudes from the surface of the spherical particel.|jmpl|Sebuah diagram sederhana dari lokasi rotavirus protein struktural]]
[[Berkas:Rotavirus_Structure.png|al=A cut-up image of a single rotavirus particle showing the RNA moecules surrounded by the VP6 protein and this in turn surrounded by the VP7 protein. The V4 protein protrudes from the surface of the spherical particel.|jmpl|Sebuah diagram sederhana dari lokasi protein struktural rotavirus.]]
Terdapat enam protein virus (VP) yang membentuk partikel virus ([[Virus|virion]]). Protein ''struktural'' ini disebut VP1, VP2, VP3, VP4, VP6 dan VP7. Selain VP, terdapat enam non-struktural protein (NSP), yang hanya diproduksi pada sel-sel yang terinfeksi oleh rotavirus, yang disebut NSP1, NSP2, NSP3, NSP4, NSP5 dan NSP6.<ref name="pmid20684716" />
Terdapat enam protein virus (VP) yang membentuk partikel virus ([[Virus|virion]]). Protein ''struktural'' ini disebut VP1, VP2, VP3, VP4, VP6 dan VP7. Selain VP, terdapat enam non-struktural protein (NSP), yang hanya diproduksi pada sel-sel yang terinfeksi oleh rotavirus, yang disebut NSP1, NSP2, NSP3, NSP4, NSP5 dan NSP6.<ref name="pmid20684716" />


Baris 47: Baris 47:
VP3 merupakan bagian dari inti dalam virion dan merupakan enzim yang disebut [[Guanylyl transferase|guanilil transferase]]. Enzim ini mengkatalisis pembentukan [[topi 5'|topi ujung 5']] dalam [[Modifikasi pascatranskripsi|modifikasi pasca-transkripsi]] dari mRNA.<ref name="isbn0-12-375147-022">{{Cite book|vauthors=Angel J, Franco MA, Greenberg HB|year=2009|title=Desk Encyclopedia of Human and Medical Virology|location=Boston|publisher=Academic Press|isbn=978-0-12-375147-8|veditors=Mahy BW, Van Regenmortel MH|page=277}}</ref> Topi tersebut menstabilkan mRNA virus dengan melindunginya dari enzim nukelase, suatu enzim pendegradasi [[asam nukleat]].<ref name="pmid200256122">{{Cite journal|year=2009|title=Regulation of mRNA cap methylation|journal=The Biochemical Journal|volume=425|issue=2|pages=295–302|doi=10.1042/BJ20091352|pmc=2825737|pmid=20025612|vauthors=Cowling VH}}</ref>
VP3 merupakan bagian dari inti dalam virion dan merupakan enzim yang disebut [[Guanylyl transferase|guanilil transferase]]. Enzim ini mengkatalisis pembentukan [[topi 5'|topi ujung 5']] dalam [[Modifikasi pascatranskripsi|modifikasi pasca-transkripsi]] dari mRNA.<ref name="isbn0-12-375147-022">{{Cite book|vauthors=Angel J, Franco MA, Greenberg HB|year=2009|title=Desk Encyclopedia of Human and Medical Virology|location=Boston|publisher=Academic Press|isbn=978-0-12-375147-8|veditors=Mahy BW, Van Regenmortel MH|page=277}}</ref> Topi tersebut menstabilkan mRNA virus dengan melindunginya dari enzim nukelase, suatu enzim pendegradasi [[asam nukleat]].<ref name="pmid200256122">{{Cite journal|year=2009|title=Regulation of mRNA cap methylation|journal=The Biochemical Journal|volume=425|issue=2|pages=295–302|doi=10.1042/BJ20091352|pmc=2825737|pmid=20025612|vauthors=Cowling VH}}</ref>


VP4 adalah pada permukaan virion yang menonjol sebagai spike.<ref name="pmid16571811">{{Cite journal|year=2006|title=Rotavirus spike protein VP4 binds to and remodels actin bundles of the epithelial brush border into actin bodies|journal=Journal of Virology|volume=80|issue=8|pages=3947–56|doi=10.1128/JVI.80.8.3947-3956.2006|pmc=1440440|pmid=16571811}}</ref> Ia mengikat molekul-molekul pada permukaan sel yang disebut [[Reseptor (biokimia)|reseptor]] dan mendorong masuknya virus ke dalam sel.<ref name="pmid12234525">{{Cite journal|year=2002|title=Molecular biology of rotavirus cell entry|journal=Archives of Medical Research|volume=33|issue=4|pages=356–61|doi=10.1016/S0188-4409(02)00374-0|pmid=12234525}}</ref> VP4 telah diubah oleh [[protease]] enzim tripsin, yang ditemukan dalam usus, ke VP5* dan VP8* sebelum virus ini menular.<ref name="pmid15010218">{{Cite journal|year=2004|title=Emerging themes in rotavirus cell entry, genome organization, transcription and replication|journal=Virus Research|volume=101|issue=1|pages=67–81|doi=10.1016/j.virusres.2003.12.007|pmid=15010218}}</ref> VP4 menentukan cara [[Bakteri virulen|mematikan]] virus dan menentukan P-jenis virus.<ref name="pmid12167342">{{Cite journal|year=2002|title=Characterization of neutralization specificities of outer capsid spike protein VP4 of selected murine, lapine, and human rotavirus strains|journal=Virology|volume=299|issue=1|pages=64–71|doi=10.1006/viro.2002.1474|pmid=12167342}}</ref> Pada manusia ada hubungan antara golongan darah status sekretor dan kerentanan terhadap infeksi. Non-secretors tampaknya tahan terhadap infeksi oleh jenis P[4] dan P[8], yang menunjukkan bahwa golongan darah antigen reseptor ini genotipe.<ref name="pmid24523471">{{Cite journal|year=2014|title=Association between norovirus and rotavirus infection and histo-blood group antigen types in Vietnamese children|url=|journal=Journal of Clinical Microbiology|volume=52|issue=5|pages=1366–74|doi=10.1128/JCM.02927-13|pmc=3993640|pmid=24523471}}</ref>
VP4 berada di permukaan virion yang menonjol seperti paku.<ref name="pmid165718112">{{Cite journal|year=2006|title=Rotavirus spike protein VP4 binds to and remodels actin bundles of the epithelial brush border into actin bodies|journal=Journal of Virology|volume=80|issue=8|pages=3947–56|doi=10.1128/JVI.80.8.3947-3956.2006|pmc=1440440|pmid=16571811|vauthors=Gardet A, Breton M, Fontanges P, Trugnan G, Chwetzoff S}}</ref> VP4 berikatan dengan molekul pada permukaan sel ([[Reseptor (biokimia)|reseptor]]) dan mendorong masuknya virus ke dalam sel. <ref name="pmid122345252">{{Cite journal|year=2002|title=Molecular biology of rotavirus cell entry|journal=Archives of Medical Research|volume=33|issue=4|pages=356–61|doi=10.1016/S0188-4409(02)00374-0|pmid=12234525|vauthors=Arias CF, Isa P, Guerrero CA, Méndez E, Zárate S, López T, Espinosa R, Romero P, López S}}</ref> VP4 harus dimodifikasi oleh enzim [[protease]] tripsin, yang ditemukan di usus, menjadi VP5* dan VP8* sebelum virus menjadi infeksius.<ref name="pmid150102182">{{Cite journal|year=2004|title=Emerging themes in rotavirus cell entry, genome organization, transcription and replication|journal=Virus Research|volume=101|issue=1|pages=67–81|doi=10.1016/j.virusres.2003.12.007|pmid=15010218|vauthors=Jayaram H, Estes MK, Prasad BV}}</ref> VP4 menentukan seberapa [[Bakteri virulen|ganas]] virus dan menentukan tipe-P dari virus.<ref name="pmid121673422">{{Cite journal|year=2002|title=Characterization of neutralization specificities of outer capsid spike protein VP4 of selected murine, lapine, and human rotavirus strains|journal=Virology|volume=299|issue=1|pages=64–71|doi=10.1006/viro.2002.1474|pmid=12167342|vauthors=Hoshino Y, Jones RW, Kapikian AZ}}</ref> Pada manusia, ada hubungan antara golongan [[Golongan darah|darah]] ([[Sistem antigen Lewis|sistem antigen Lewis, sistem]] [[Sistem golongan darah ABO|golongan darah ABO]], dan [[Status sekretaris|status sekretor]]) dan kerentanan terhadap infeksi. Nonsekretor tampaknya resisten terhadap infeksi oleh tipe P[4] dan P[8], menunjukkan bahwa antigen golongan darah merupakan reseptor untuk genotipe ini.<ref name="pmid245234712">{{Cite journal|year=2014|title=Association between norovirus and rotavirus infection and histo-blood group antigen types in Vietnamese children|journal=Journal of Clinical Microbiology|volume=52|issue=5|pages=1366–74|doi=10.1128/JCM.02927-13|pmc=3993640|pmid=24523471|vauthors=Van Trang N, Vu HT, Le NT, Huang P, Jiang X, Anh DD}}</ref> Resistensi ini tergantung pada genotipe rotavirus.<ref name="pmid32192193">{{Cite journal|date=March 2020|title=The Impact of Human Genetic Polymorphisms on Rotavirus Susceptibility, Epidemiology, and Vaccine Take|url=|journal=Viruses|volume=12|issue=3|pages=|doi=10.3390/v12030324|pmc=7150750|pmid=32192193|vauthors=Sharma S, Hagbom M, Svensson L, Nordgren J}}</ref>


VP6 membentuk sebagian dari kapsid. Hal ini sangat [[antigen]]ik dan dapat digunakan untuk mengidentifikasi rotavirus spesies.<ref name="pmid9015109">{{Cite book|last=Bishop RF|title=Natural history of human rotavirus infection|work=Archives of Virology|volume=12|pages=119–28|year=1996|pmid=9015109|doi=10.1007/978-3-7091-6553-9_14|isbn=978-3-211-82875-5}}</ref> Protein ini digunakan dalam tes laboratorium untuk infeksi rotavirus A.<ref name="pmid6321549">{{Cite journal|year=1984|title=Enzyme-linked immunosorbent assays based on polyclonal and monoclonal antibodies for rotavirus detection|url=http://jcm.asm.org/cgi/reprint/19/2/248|format=PDF|journal=Journal of Clinical Microbiology|volume=19|issue=2|pages=248–54|pmc=271031|pmid=6321549}}</ref>
VP6 membentuk sebagian besar kapsid. VP6 sangat [[Antigen|antigenik]] dan dapat digunakan untuk mengidentifikasi spesies rotavirus.<ref name="pmid90151092">{{Cite book|last=Bishop RF|year=1996|title=Viral Gastroenteritis|work=Archives of Virology|isbn=978-3-211-82875-5|volume=12|pages=119–28|chapter=Natural history of human rotavirus infection|doi=10.1007/978-3-7091-6553-9_14|pmid=9015109}}</ref> Protein ini digunakan dalam tes laboratorium untuk infeksi rotavirus A.<ref name="pmid63215492">{{Cite journal|year=1984|title=Enzyme-linked immunosorbent assays based on polyclonal and monoclonal antibodies for rotavirus detection|url=http://jcm.asm.org/cgi/reprint/19/2/248|format=PDF|journal=Journal of Clinical Microbiology|volume=19|issue=2|pages=248–54|doi=10.1128/JCM.19.2.248-254.1984|pmc=271031|pmid=6321549|vauthors=Beards GM, Campbell AD, Cottrell NR, Peiris JS, Rees N, Sanders RC, Shirley JA, Wood HC, Flewett TH}}</ref>


VP7 adalah [[glikoprotein]] yang membentuk permukaan luar virion. VP7 menentukan serotipe G, terlepas dari struktur fungsinya. VP7 bersama dengan VP4, terlibat dalam [[Imunitas (medis)|imunitas]] terhadap infeksi.<ref name="pmid169130482">{{Cite book|vauthors=Pesavento JB, Crawford SE, Estes MK, Prasad BV|year=2006|title=Reoviruses: Entry, Assembly and Morphogenesis|location=New York|publisher=Springer|isbn=978-3-540-30772-3|veditors=Roy P|series=Current Topics in Microbiology and Immunology|volume=309|pages=189–219|chapter=Rotavirus proteins: structure and assembly|doi=10.1007/3-540-30773-7_7|pmid=16913048|chapter-url=https://semanticscholar.org/paper/a0e23f02a06e73a5822fc5819debf98b93f49371}}</ref>
VP7 adalah [[glikoprotein]] yang membentuk permukaan luar virion. Terlepas dari struktural fungsi, menentukan tipe G ketegangan dan, bersama dengan VP4, terlibat dalam kekebalan terhadap infeksi.<ref name="pmid16913048" />


==== Non-struktural protein virus ====
==== Protein non-struktural ====
NSP1, produk dari gen 5, adalah non-struktural RNA-protein yang mengikat.<ref>{{Cite journal|year=1993|title=Comparative analysis of the rotavirus NS53 gene: conservation of basic and cysteine-rich regions in the protein and possible stem-loop structures in the RNA|journal=Virology|volume=196|issue=1|pages=372–8|doi=10.1006/viro.1993.1492|pmid=8395125}}</ref> NSP1 juga menghambat [[interferon]] respon, bagian dari [[Sistem imun bawaan|sistem kekebalan tubuh bawaan]] yang melindungi sel-sel dari infeksi virus. NSP1 menyebabkan proteosome untuk menurunkan kunci menandakan komponen yang diperlukan untuk merangsang produksi interferon dalam sel yang terinfeksi dan untuk merespon interferon yang disekresikan oleh sel-sel yang berdekatan. Target untuk degradasi mencakup beberapa IRF faktor-faktor transkripsi yang diperlukan untuk transkripsi gen interferon.<ref name="pmid27009959">{{Cite journal|year=2016|title=The Rotavirus Interferon Antagonist NSP1: Many Targets, Many Questions|url=|journal=Journal of Virology|volume=90|issue=11|pages=5212–5|doi=10.1128/JVI.03068-15|pmc=4934742|pmid=27009959}}</ref>
NSP1, suatu produk gen 5, adalah protein pengikat RNA nonstruktural.<ref>{{Cite journal|year=1993|title=Comparative analysis of the rotavirus NS53 gene: conservation of basic and cysteine-rich regions in the protein and possible stem-loop structures in the RNA|journal=Virology|volume=196|issue=1|pages=372–8|doi=10.1006/viro.1993.1492|pmid=8395125|vauthors=Hua J, Mansell EA, Patton JT}}</ref> NSP1 juga mengeblok respons [[interferon]], bagian dari [[sistem imun bawaan]] yang melindungi sel dari infeksi virus. NSP1 memicu [[Proteasom|proteosom]] untuk menghancurkan komponen molekul sinyal yang diperlukan untuk merangsang produksi interferon dalam sel yang terinfeksi dan untuk merespons interferon yang disekresikan oleh sel yang berdekatan. Target degradasi mencakup beberapa faktor transkripsi [[Faktor regulasi interferon|IRF]] yang diperlukan untuk transkripsi gen interferon.<ref name="Arnold2016">{{Cite journal|year=2016|title=The Rotavirus Interferon Antagonist NSP1: Many Targets, Many Questions|journal=Journal of Virology|volume=90|issue=11|pages=5212–5|doi=10.1128/JVI.03068-15|pmc=4934742|pmid=27009959|vauthors=Arnold MM}}</ref>


NSP2 adalah RNA-binding protein yang terakumulasi dalam sitoplasma inklusi (viroplasms) dan diperlukan untuk replikasi genom.<ref name="pmid15010217">{{Cite journal|year=2004|title=Nonstructural proteins involved in genome packaging and replication of rotaviruses and other members of the Reoviridae|url=|journal=Virus Research|volume=101|issue=1|pages=57–66|doi=10.1016/j.virusres.2003.12.006|pmid=15010217}}</ref><ref>{{Cite journal|year=1994|title=The rotavirus RNA-binding protein NS35 (NSP2) forms 10S multimers and interacts with the viral RNA polymerase|journal=Virology|volume=202|issue=2|pages=803–13|doi=10.1006/viro.1994.1402|pmid=8030243}}</ref>
NSP2 adalah protein pengikat RNA yang terakumulasi dalam inklusi sitoplasma (viroplasma) dan diperlukan untuk replikasi genom.<ref name="pmid15010217">{{Cite journal|year=2004|title=Nonstructural proteins involved in genome packaging and replication of rotaviruses and other members of the Reoviridae|url=|journal=Virus Research|volume=101|issue=1|pages=57–66|doi=10.1016/j.virusres.2003.12.006|pmid=15010217}}</ref><ref>{{Cite journal|year=1994|title=The rotavirus RNA-binding protein NS35 (NSP2) forms 10S multimers and interacts with the viral RNA polymerase|journal=Virology|volume=202|issue=2|pages=803–13|doi=10.1006/viro.1994.1402|pmid=8030243}}</ref>


NSP3 terikat untuk virus mRNAs dalam sel yang terinfeksi dan hal ini bertanggung jawab untuk shutdown sintesis protein seluler.<ref>{{Cite journal|year=1993|title=Rotavirus protein NSP3 (NS34) is bound to the 3' end consensus sequence of viral mRNAs in infected cells|url=http://jvi.asm.org/cgi/reprint/67/6/3159|format=PDF|journal=Journal of Virology|volume=67|issue=6|pages=3159–65|pmc=237654|pmid=8388495}}</ref> NSP3 menginaktivasi dua terjemahan inisiasi faktor penting untuk sintesis protein dari tuan rumah mRNA. Pertama, NSP3 menyemburkan poly(A)-binding protein (PABP) dari inisiasi terjemahan faktor eIF4F. PABP diperlukan untuk efisien terjemahan dari transkrip dengan 3' poly(A) tail, yang ditemukan pada sebagian besar sel inang transkrip. Kedua, NSP3 menginaktivasi eIF2 dengan merangsang fosforilasi.<ref name="pmid26727111">{{Cite journal|year=2016|title=Challenging the Roles of NSP3 and Untranslated Regions in Rotavirus mRNA Translation|url=|journal=PLOS One|volume=11|issue=1|pages=e0145998|bibcode=2016PLoSO..1145998G|doi=10.1371/journal.pone.0145998|pmc=4699793|pmid=26727111}}</ref> Efisien terjemahan rotavirus mRNA, yang memiliki 3' poly(A) tail, tidak memerlukan salah satu dari faktor ini.<ref name="Lopez2012">{{Cite journal|year=2012|title=Rotavirus-host cell interactions: an arms race|journal=Current Opinion in Virology|volume=2|issue=4|pages=389–98|doi=10.1016/j.coviro.2012.05.001|pmid=22658208}}</ref>
NSP3 terikat pada mRNA virus dalam sel yang terinfeksi dan bertanggung jawab atas penghentian sintesis protein seluler.<ref>{{Cite journal|year=1993|title=Rotavirus protein NSP3 (NS34) is bound to the 3' end consensus sequence of viral mRNAs in infected cells|url=http://jvi.asm.org/cgi/reprint/67/6/3159|format=PDF|journal=Journal of Virology|volume=67|issue=6|pages=3159–65|doi=10.1128/JVI.67.6.3159-3165.1993|pmc=237654|pmid=8388495|vauthors=Poncet D, Aponte C, [[Jean Cohen|Cohen J]]}}</ref> NSP3 menonaktifkan dua faktor inisiasi translasi yang penting untuk sintesis protein dari mRNA inang. Pertama, NSP3 mengeluarkan [[protein pengikat poli(A)]] (PABP) dari faktor inisiasi translasi [[eIF4F]]. PABP diperlukan untuk transkripsi transkrip yang efisien dengan [[Poliadenilasi|ekor 3' poli(A)]], yang ditemukan pada sebagian besar transkrip sel inang. Kedua, NSP3 menonaktifkan [[eIF2]] dengan merangsang fosforilasinya.<ref name="pmid267271112">{{Cite journal|year=2016|title=Challenging the Roles of NSP3 and Untranslated Regions in Rotavirus mRNA Translation|journal=PLOS ONE|volume=11|issue=1|pages=e0145998|bibcode=2016PLoSO..1145998G|doi=10.1371/journal.pone.0145998|pmc=4699793|pmid=26727111|vauthors=Gratia M, Vende P, Charpilienne A, Baron HC, Laroche C, Sarot E, Pyronnet S, Duarte M, Poncet D}}</ref> Translasi mRNA rotavirus yang efisien, yang tidak memiliki ekor poli(A) 3', tidak memerlukan salah satu dari faktor-faktor ini.<ref name="Lopez20122">{{Cite journal|year=2012|title=Rotavirus-host cell interactions: an arms race|journal=Current Opinion in Virology|volume=2|issue=4|pages=389–98|doi=10.1016/j.coviro.2012.05.001|pmid=22658208|vauthors=López S, Arias CF}}</ref>


NSP4 adalah [[enterotoksin]] virus yang menyebabkan diare dan merupakan enterotoksin virus pertama yang ditemukan.<ref name="pmid191147722">{{Cite journal|year=2009|title=Rotavirus vaccines and pathogenesis: 2008|journal=Current Opinion in Gastroenterology|volume=25|issue=1|pages=36–43|doi=10.1097/MOG.0b013e328317c897|pmc=2673536|pmid=19114772|vauthors=Hyser JM, Estes MK}}</ref> NSP5 disandi oleh segmen genom 11 rotavirus A. Pada sel yang terinfeksi, virus NSP5 terakumulasi dalam viroplasma.<ref>{{Cite journal|year=1996|title=Phosphorylation generates different forms of rotavirus NSP5|journal=Journal of General Virology|volume=77|issue=9|pages=2059–65|doi=10.1099/0022-1317-77-9-2059|pmid=8811003|vauthors=Afrikanova I, Miozzo MC, Giambiagi S, Burrone O}}</ref> NSP6 adalah protein pengikat asam nukleat <ref>{{Cite journal|year=2007|title=Characterization of the NSP6 protein product of rotavirus gene 11|journal=Virus Research|volume=130|issue=1–2|pages=193–201|doi=10.1016/j.virusres.2007.06.011|pmid=17658646|vauthors=Rainsford EW, McCrae MA}}</ref> dan disandi oleh gen 11 dari luar fase [[rangka baca terbuka]] (ORF).<ref>{{Cite journal|year=2001|title=Nucleotide sequence analysis of rotavirus gene 11 from two tissue culture-adapted ATCC strains, RRV and Wa|journal=Virus Genes|volume=23|issue=3|pages=321–9|doi=10.1023/A:1012577407824|pmid=11778700|vauthors=Mohan KV, Atreya CD}}</ref>
NSP4 adalah virus [[Enterotoksin|enterotoksin juga]] yang menginduksi diare dan virus enterotoksin juga ditemukan.<ref name="pmid19114772">{{Cite journal|year=2009|title=Rotavirus vaccines and pathogenesis: 2008|url=http://meta.wkhealth.com/pt/pt-core/template-journal/lwwgateway/media/landingpage.htm?issn=0267-1379&volume=25&issue=1&spage=36|journal=Current Opinion in Gastroenterology|volume=25|issue=1|pages=36–43|doi=10.1097/MOG.0b013e328317c897|pmc=2673536|pmid=19114772}}</ref>

NSP5 disandikan oleh genom segmen 11 rotavirus A. Dalam sel yang terinfeksi virus NSP5 terakumulasi dalam viroplasm.<ref>{{Cite journal|year=1996|title=Phosphorylation generates different forms of rotavirus NSP5|url=http://vir.sgmjournals.org/cgi/reprint/77/9/2059|dead-url=yes|journal=Journal of General Virology|volume=77|issue=9|pages=2059–65|doi=10.1099/0022-1317-77-9-2059|pmid=8811003|archive-url=https://archive.is/20120526030014/http://vir.sgmjournals.org/cgi/reprint/77/9/2059|archive-date=26 May 2012}}</ref>

NSP6 adalah asam nukleat yang mengikat protein<ref>{{Cite journal|year=2007|title=Characterization of the NSP6 protein product of rotavirus gene 11|journal=Virus Research|volume=130|issue=1–2|pages=193–201|doi=10.1016/j.virusres.2007.06.011|pmid=17658646}}</ref> dan dikodekan oleh gen 11 dari out-of-fase [[Rangka baca terbuka|open reading frame]].<ref>{{Cite journal|year=2001|title=Nucleotide sequence analysis of rotavirus gene 11 from two tissue culture-adapted ATCC strains, RRV and Wa|journal=Virus Genes|volume=23|issue=3|pages=321–9|doi=10.1023/A:1012577407824|pmid=11778700}}</ref>
{| class="wikitable" border="1" style="text-align:center"
{| class="wikitable" border="1" style="text-align:center"
|+Rotavirus gen dan protein
|+Rotavirus gen dan protein
Baris 163: Baris 159:
|ssRNA dan dsRNA mengikat modulator NSP2, phosphoprotein
|ssRNA dan dsRNA mengikat modulator NSP2, phosphoprotein
|}
|}
Tabel ini didasarkan pada [[Simiiformes|simian]] strain rotavirus SA11. RNA-protein coding tugas berbeda dalam beberapa strain.
Tabel ini didasarkan pada strain rotavirus [[Simiiformes|simian]] SA11. Kode RNA-protein dapat berbeda dalam beberapa strain.


=== Replikasi ===
=== Replikasi ===
[[Berkas:Rotavirus_replication.png|jmpl|Sederhana gambar dari rotavirus siklus replikasi. Tahap ini adalah (1) perlekatan virus ke dalam sel inang, yang dimediasi oleh VP4 dan VP7 (2) penetrasi sel oleh virus dan uncoating virus kapsid (3) plus strand ssRNA sintesis ( ini bertindak sebagai mRNA) sintesis, yang dimediasi oleh VP1, VP3, dan VP2 (4) pembentukan viroplasm, virus RNA kemasan dan minus untai RNA sintesis dan pembentukan double-layered partikel virus (5) partikel virus pematangan dan pelepasan virion progeni.]]
[[Berkas:Rotavirus_replication.png|jmpl|Gambar sederhana dari siklus replikasi rotavirus. Tahapannya adalah (1) perlekatan virus ke sel inang, yang diperantarai oleh VP4 dan VP7, (2) penetrasi sel oleh virus dan uncoating kapsid virus (3) ditambah sintesis untai ssRNA (ini bertindak sebagai mRNA), yang dimediasi oleh VP1, VP3 dan VP2 (4) pembentukan viroplasma, pengemasan RNA virus dan sintesis RNA untai minus dan pembentukan partikel virus berlapis ganda (5) pematangan partikel virus dan pelepasan progeni virion.]]

Virus memasuki sel dengan [[Endositosis|reseptor yang dimediasi endositosis]] dan membentuk [[vesikel]] yang dikenal sebagai endosome. Protein dalam lapisan ketiga (VP7 dan VP4 spike) mengganggu membran endosome, menciptakan perbedaan dalam kalsium konsentrasi. Hal ini menyebabkan kerusakan VP7 trimer menjadi satu protein subunit, meninggalkan VP2 dan VP6 protein mantel sekitar virus dsRNA, membentuk double-layered partikel (DLP).<ref name="pmid20397068">{{Cite book|chapter=Rotavirus cell entry|series=Current Topics in Microbiology and Immunology|title=Cell Entry by Non-Enveloped Viruses|volume=343|pages=121–48|year=2010|pmid=20397068|doi=10.1007/82_2010_34|isbn=978-3-642-13331-2}}</ref>
Perlekatan virus ke sel inang diinisiasi oleh VP4, yang menempel pada molekul [[Glycans|glikan]], pada permukaan sel.<ref name="pmid31317495">{{Cite journal|date=2019|title=Structural Insights into Rotavirus Entry|journal=Advances in Experimental Medicine and Biology|volume=1215|pages=45–68|doi=10.1007/978-3-030-14741-9_3|isbn=978-3-030-14740-2|pmid=31317495|vauthors=Rodríguez JM, Luque D}}</ref> Virus memasuki sel melalui [[Endositosis|endositosis yang dimediasi reseptor]] dan membentuk [[vesikel]] yang dikenal sebagai [[endosom]]. Protein di lapisan ketiga (VP7 dan VP4 spike) mengganggu membran endosom, menciptakan perbedaan konsentrasi [[Kalsium dalam biologi|kalsium]]. Hal ini menyebabkan pemecahan [[Pemangkas (biokimia)|trimer]] VP7 menjadi subunit protein tunggal, meninggalkan lapisan protein VP2 dan VP6 di sekitar dsRNA virus, membentuk partikel berlapis ganda (''double-layered particle'', DLP).<ref name="pmid203970682">{{Cite book|vauthors=Baker M, Prasad BV|year=2010|title=Cell Entry by Non-Enveloped Viruses|isbn=978-3-642-13331-2|veditors=Johnson J|series=Current Topics in Microbiology and Immunology|volume=343|pages=121–48|chapter=Rotavirus cell entry|doi=10.1007/82_2010_34|pmid=20397068}}</ref>


Sebelas dsRNA helai tetap dalam perlindungan dari dua protein kerang dan virus RNA-dependent RNA polimerase menciptakan transkrip mRNA dari beruntai ganda virus genom. Oleh tersisa di inti, virus RNA menghindar bawaan host respon imun termasuk [[interferensi RNA]] yang dipicu oleh adanya double-stranded RNA.<ref name="pmid27009959" />
Sebelas untai dsRNA tetap dalam perlindungan dua cangkang protein dan RNA polimerase yang bergantung pada RNA virus, menghasilkan transkrip mRNA dari genom virus beruntai ganda. RNA virus tetap berada di inti dalam rangka menghindari respons imun inang bawaan termasuk [[interferensi RNA]] yang dipicu oleh adanya RNA untai ganda.<ref name="pmid270099592">{{Cite journal|year=2016|title=The Rotavirus Interferon Antagonist NSP1: Many Targets, Many Questions|journal=Journal of Virology|volume=90|issue=11|pages=5212–5|doi=10.1128/JVI.03068-15|pmc=4934742|pmid=27009959|vauthors=Arnold MM}}</ref>


Selama infeksi rotavirus menghasilkan mRNA untuk [[sintesis protein]] dan replikasi gen. Sebagian besar rotavirus protein menumpuk di viroplasm, di mana RNA replikasi dan DLPs dirakit. Di viroplasm arti positif virus Rna yang digunakan sebagai template untuk sintesis virus genom dsRNA dilindungi dari siRNA-induced RNase degradasi.<ref name="pmid15220450">{{Cite journal|year=2004|title=Rotavirus replication: plus-sense templates for double-stranded RNA synthesis are made in viroplasms|url=|journal=Journal of Virology|volume=78|issue=14|pages=7763–74|doi=10.1128/JVI.78.14.7763-7774.2004|pmc=434085|pmid=15220450}}</ref> Viroplasm terbentuk di sekitar inti sel sebagai awal dua jam setelah infeksi virus, dan terdiri dari viral pabrik-pabrik yang diduga dilakukan oleh dua virus protein nonstruktural: NSP5 dan NSP2. Penghambatan NSP5 oleh RNA interference ''in vitro'' hasil dalam penurunan tajam dalam replikasi rotavirus. Yang DLPs bermigrasi ke [[retikulum endoplasma]] mana mereka mendapatkan ketiga mereka, lapisan luar (yang dibentuk oleh VP7 dan VP4). Para keturunan virus dilepaskan dari dalam sel oleh [[lisis]].<ref name="pmid15010218" /><ref name="pmid15579070">{{Cite journal|year=2004|title=Replication and transcription of the rotavirus genome|url=|journal=Current Pharmaceutical Design|volume=10|issue=30|pages=3769–77|doi=10.2174/1381612043382620|pmid=15579070}}</ref><ref name="pmid20024520">{{Cite journal|year=2009|title=Molecular biology of rotavirus entry and replication|journal=The Scientific World Journal|volume=9|pages=1476–97|doi=10.1100/tsw.2009.158|pmc=5823125|pmid=20024520}}</ref>
Selama infeksi, rotavirus menghasilkan mRNA untuk [[Sintesis protein|biosintesis protein]] dan replikasi gen. Sebagian besar protein rotavirus terakumulasi dalam viroplasma, tempat RNA direplikasi dan DLP dirakit. Dalam viroplasma, RNA virus sense positif yang digunakan sebagai cetakan untuk sintesis dsRNA genom virus dilindungi terhadap degradasi RNase yang diinduksi siRNA.<ref name="pmid152204502">{{Cite journal|year=2004|title=Rotavirus replication: plus-sense templates for double-stranded RNA synthesis are made in viroplasms|journal=Journal of Virology|volume=78|issue=14|pages=7763–74|doi=10.1128/JVI.78.14.7763-7774.2004|pmc=434085|pmid=15220450|vauthors=Silvestri LS, Taraporewala ZF, Patton JT}}</ref> Viroplasma terbentuk setidaknya dua jam setelah setelah infeksi virus dan berlokasi di sekitar inti, terdiri dari pabrik virus yang diduga dibuat oleh dua protein nonstruktural virus: NSP5 dan NSP2. Penghambatan NSP5 oleh interferensi RNA ''in vitro'' menghasilkan penurunan tajam dalam replikasi rotavirus. DLP bermigrasi ke [[retikulum endoplasma]] tempat DLP mendapatkan lapisan luar ketiga (dibentuk oleh VP7 dan VP4). Progeni virus dilepaskan dari sel dengan [[lisis]].<ref name="pmid150102183">{{Cite journal|year=2004|title=Emerging themes in rotavirus cell entry, genome organization, transcription and replication|journal=Virus Research|volume=101|issue=1|pages=67–81|doi=10.1016/j.virusres.2003.12.007|pmid=15010218|vauthors=Jayaram H, Estes MK, Prasad BV}}</ref><ref name="pmid155790702">{{Cite journal|year=2004|title=Replication and transcription of the rotavirus genome|journal=Current Pharmaceutical Design|volume=10|issue=30|pages=3769–77|doi=10.2174/1381612043382620|pmid=15579070|vauthors=Patton JT, Vasquez-Del Carpio R, Spencer E}}</ref><ref name="pmid200245202">{{Cite journal|year=2009|title=Molecular biology of rotavirus entry and replication|journal=The Scientific World Journal|volume=9|pages=1476–97|doi=10.1100/tsw.2009.158|pmc=5823125|pmid=20024520|vauthors=Ruiz MC, Leon T, Diaz Y, Michelangeli F}}</ref>


== Transmisi ==
== Transmisi ==
[[Berkas:Multiple_rotavirus_particles.jpg|al=Many rotavirus particles packed together, which all look similar|ka|jmpl|Rotavirus dalam [[tinja]] anak yang terinfeksi]]
[[Berkas:Multiple_rotavirus_particles.jpg|al=Many rotavirus particles packed together, which all look similar|ka|jmpl|Rotavirus dalam [[tinja]] anak yang terinfeksi]]
Rotavirus ditularkan oleh fæcal-oral route, melalui kontak dengan tangan yang terkontaminasi, permukaan dan benda-benda,<ref name="pmid8393172">{{Cite journal|year=1993|title=Prevalence of rotavirus on high-risk fomites in day-care facilities|journal=Pediatrics|volume=92|issue=2|pages=202–5|pmid=8393172}}</ref> dan mungkin oleh pernapasan rute.<ref name="pmid11052397">{{Cite journal|last=Dennehy PH|year=2000|title=Transmission of rotavirus and other enteric pathogens in the home|journal=Pediatric Infectious Disease Journal|volume=19|issue=Suppl 10|pages=S103–5|doi=10.1097/00006454-200010001-00003|pmid=11052397}}</ref> Virus diare adalah sangat menular. Feses dari orang yang terinfeksi dapat mengandung lebih dari 10 triliun menular partikel per gram;<ref name="pmid9015109" /> kurang dari 100 di antaranya yang diperlukan untuk menularkan infeksi kepada orang lain.<ref name="pmid18838873">{{Cite journal|year=2009|title=Rotavirus vaccines: opportunities and challenges|url=http://www.landesbioscience.com/journals/hv/abstract.php?id=6924|journal=Human Vaccines|volume=5|issue=2|pages=57–69|doi=10.4161/hv.5.2.6924|pmid=18838873}}</ref>
Rotavirus ditularkan oleh fæcal-oral route, melalui kontak dengan tangan yang terkontaminasi, permukaan dan benda-benda,<ref name="pmid8393172">{{Cite journal|year=1993|title=Prevalence of rotavirus on high-risk fomites in day-care facilities|journal=Pediatrics|volume=92|issue=2|pages=202–5|pmid=8393172}}</ref> dan mungkin oleh pernapasan rute.<ref name="pmid11052397">{{Cite journal|last=Dennehy PH|year=2000|title=Transmission of rotavirus and other enteric pathogens in the home|journal=Pediatric Infectious Disease Journal|volume=19|issue=Suppl 10|pages=S103–5|doi=10.1097/00006454-200010001-00003|pmid=11052397}}</ref> Virus diare adalah sangat menular. Feses dari orang yang terinfeksi dapat mengandung lebih dari 10 triliun menular partikel per gram;<ref name="pmid9015109">{{Cite book|last=Bishop RF|year=1996|title=Natural history of human rotavirus infection|work=Archives of Virology|isbn=978-3-211-82875-5|volume=12|pages=119–28|doi=10.1007/978-3-7091-6553-9_14|pmid=9015109}}</ref> kurang dari 100 di antaranya yang diperlukan untuk menularkan infeksi kepada orang lain.<ref name="pmid18838873">{{Cite journal|year=2009|title=Rotavirus vaccines: opportunities and challenges|url=http://www.landesbioscience.com/journals/hv/abstract.php?id=6924|journal=Human Vaccines|volume=5|issue=2|pages=57–69|doi=10.4161/hv.5.2.6924|pmid=18838873}}</ref>


Rotavirus stabil di lingkungan dan telah ditemukan di [[Estuari|muara sungai]] sampel di tingkat 1-5 menular partikel per US&nbsp;galon, virus bertahan hidup di antara 9 dan 19 hari.<ref name="pmid6091548">{{Cite journal|year=1984|title=Isolation of enteroviruses from water, suspended solids, and sediments from Galveston Bay: survival of poliovirus and rotavirus adsorbed to sediments|url=http://aem.asm.org/cgi/reprint/48/2/404|format=PDF|journal=Applied and Environmental Microbiology|volume=48|issue=2|pages=404–9|pmc=241526|pmid=6091548}}</ref> Tindakan sanitasi yang memadai untuk menghilangkan [[bakteri]] dan parasit tampaknya tidak efektif dalam mengontrol rotavirus, seperti kejadian infeksi rotavirus di negara-negara dengan tinggi dan rendahnya standar kesehatan serupa.<ref name="pmid11052397" />
Rotavirus stabil di lingkungan dan telah ditemukan di [[Estuari|muara sungai]] sampel di tingkat 1-5 menular partikel per US&nbsp;galon, virus bertahan hidup di antara 9 dan 19 hari.<ref name="pmid6091548">{{Cite journal|year=1984|title=Isolation of enteroviruses from water, suspended solids, and sediments from Galveston Bay: survival of poliovirus and rotavirus adsorbed to sediments|url=http://aem.asm.org/cgi/reprint/48/2/404|format=PDF|journal=Applied and Environmental Microbiology|volume=48|issue=2|pages=404–9|pmc=241526|pmid=6091548}}</ref> Tindakan sanitasi yang memadai untuk menghilangkan [[bakteri]] dan parasit tampaknya tidak efektif dalam mengontrol rotavirus, seperti kejadian infeksi rotavirus di negara-negara dengan tinggi dan rendahnya standar kesehatan serupa.<ref name="pmid11052397" />
Baris 187: Baris 184:
Rotavirus menggandakan diri terutama di [[usus]],<ref name="pmid19457420">{{Cite journal|year=2009|title=Rotaviruses: from pathogenesis to vaccination|journal=Gastroenterology|volume=136|issue=6|pages=1939–51|doi=10.1053/j.gastro.2009.02.076|pmc=3690811|pmid=19457420}}</ref> dan menginfeksi enterosit dari vili dari [[usus halus]], menyebabkan perubahan struktural dan fungsional dari epitel.<ref name="pmid8050281">{{Cite book|chapter=Rotavirus pathology and pathophysiology|series=Current Topics in Microbiology and Immunology|title=Rotaviruses|volume=185|pages=255–83|year=1994|pmid=8050281|publisher=Springer|location=New York|isbn=9783540567615}}</ref> Ada bukti pada manusia, dan terutama pada hewan model ekstraintestinal penyebaran virus menular ke organ lain dan makrofag.<ref name="pmid16641274">{{Cite journal|year=2006|title=Rotavirus viremia and extraintestinal viral infection in the neonatal rat model|url=|journal=Journal of Virology|volume=80|issue=10|pages=4820–32|doi=10.1128/JVI.80.10.4820-4832.2006|pmc=1472071|pmid=16641274}}</ref>
Rotavirus menggandakan diri terutama di [[usus]],<ref name="pmid19457420">{{Cite journal|year=2009|title=Rotaviruses: from pathogenesis to vaccination|journal=Gastroenterology|volume=136|issue=6|pages=1939–51|doi=10.1053/j.gastro.2009.02.076|pmc=3690811|pmid=19457420}}</ref> dan menginfeksi enterosit dari vili dari [[usus halus]], menyebabkan perubahan struktural dan fungsional dari epitel.<ref name="pmid8050281">{{Cite book|chapter=Rotavirus pathology and pathophysiology|series=Current Topics in Microbiology and Immunology|title=Rotaviruses|volume=185|pages=255–83|year=1994|pmid=8050281|publisher=Springer|location=New York|isbn=9783540567615}}</ref> Ada bukti pada manusia, dan terutama pada hewan model ekstraintestinal penyebaran virus menular ke organ lain dan makrofag.<ref name="pmid16641274">{{Cite journal|year=2006|title=Rotavirus viremia and extraintestinal viral infection in the neonatal rat model|url=|journal=Journal of Virology|volume=80|issue=10|pages=4820–32|doi=10.1128/JVI.80.10.4820-4832.2006|pmc=1472071|pmid=16641274}}</ref>


Diare ini disebabkan oleh beberapa aktivitas virus.<ref name="pmid15367586">{{Cite journal|year=2004|title=Pathogenesis of intestinal and systemic rotavirus infection|url=|journal=Journal of Virology|volume=78|issue=19|pages=10213–20|doi=10.1128/JVI.78.19.10213-10220.2004|pmc=516399|pmid=15367586}}</ref> Malabsorpsi terjadi karena penghancuran sel-sel usus yang disebut enterosit. [[Enterotoksin]] rotavirus protein NSP4 menginduksi ion [[kalsium]] yang tergantung sekresi [[klorida]], mengganggu transporter [[Protein transpor natrium-glukosa|SGLT1 (natrium/glucose cotransporter 2)]] yang memperantarai reabsorpsi air, rupanya mengurangi aktivitas membran brush-border disakarida, dan mengaktifkan ion kalsium tergantung [[sekresi]] [[refleks]] dari sistem saraf enterik.<ref name="pmid19114772" /> Peningkatan konsentrasi ion kalsium dalam sitosol (yang diperlukan untuk perakitan keturunan virus) dicapai oleh NSP4 yang beraksi sebagai viroporin. Peningkatan ion kalsium menyebabkan [[autofagi]] yang terinfeksi enterosit.<ref name="pmid21151776">{{Cite journal|year=2010|title=Rotavirus disrupts calcium homeostasis by NSP4 viroporin activity|url=|journal=mBio|volume=1|issue=5|pages=|doi=10.1128/mBio.00265-10|pmc=2999940|pmid=21151776}}</ref>
Diare ini disebabkan oleh beberapa aktivitas virus.<ref name="pmid15367586">{{Cite journal|year=2004|title=Pathogenesis of intestinal and systemic rotavirus infection|url=|journal=Journal of Virology|volume=78|issue=19|pages=10213–20|doi=10.1128/JVI.78.19.10213-10220.2004|pmc=516399|pmid=15367586}}</ref> Malabsorpsi terjadi karena penghancuran sel-sel usus yang disebut enterosit. [[Enterotoksin]] rotavirus protein NSP4 menginduksi ion [[kalsium]] yang tergantung sekresi [[klorida]], mengganggu transporter [[Protein transpor natrium-glukosa|SGLT1 (natrium/glucose cotransporter 2)]] yang memperantarai reabsorpsi air, rupanya mengurangi aktivitas membran brush-border disakarida, dan mengaktifkan ion kalsium tergantung [[sekresi]] [[refleks]] dari sistem saraf enterik.<ref name="pmid19114772">{{Cite journal|year=2009|title=Rotavirus vaccines and pathogenesis: 2008|url=http://meta.wkhealth.com/pt/pt-core/template-journal/lwwgateway/media/landingpage.htm?issn=0267-1379&volume=25&issue=1&spage=36|journal=Current Opinion in Gastroenterology|volume=25|issue=1|pages=36–43|doi=10.1097/MOG.0b013e328317c897|pmc=2673536|pmid=19114772}}</ref> Peningkatan konsentrasi ion kalsium dalam sitosol (yang diperlukan untuk perakitan keturunan virus) dicapai oleh NSP4 yang beraksi sebagai viroporin. Peningkatan ion kalsium menyebabkan [[autofagi]] yang terinfeksi enterosit.<ref name="pmid21151776">{{Cite journal|year=2010|title=Rotavirus disrupts calcium homeostasis by NSP4 viroporin activity|url=|journal=mBio|volume=1|issue=5|pages=|doi=10.1128/mBio.00265-10|pmc=2999940|pmid=21151776}}</ref>


NSP4 juga disekresikan. Ini ekstraseluler bentuk, yang dimodifikasi oleh [[Protease|enzim-enzim protease]] dalam usus, adalah enterotoksin juga yang bertindak pada sel yang tidak terinfeksi melalui integrin reseptor, yang pada gilirannya menyebabkan peningkatan kalsium intraseluler konsentrasi ion, sekretori diare dan autofagi.<ref name="pmid16731945">{{Cite journal|year=2006|title=Rotavirus NSP4 induces a novel vesicular compartment regulated by calcium and associated with viroplasms|url=|journal=Journal of Virology|volume=80|issue=12|pages=6061–71|doi=10.1128/JVI.02167-05|pmc=1472611|pmid=16731945}}</ref>
NSP4 juga disekresikan. Ini ekstraseluler bentuk, yang dimodifikasi oleh [[Protease|enzim-enzim protease]] dalam usus, adalah enterotoksin juga yang bertindak pada sel yang tidak terinfeksi melalui integrin reseptor, yang pada gilirannya menyebabkan peningkatan kalsium intraseluler konsentrasi ion, sekretori diare dan autofagi.<ref name="pmid16731945">{{Cite journal|year=2006|title=Rotavirus NSP4 induces a novel vesicular compartment regulated by calcium and associated with viroplasms|url=|journal=Journal of Virology|volume=80|issue=12|pages=6061–71|doi=10.1128/JVI.02167-05|pmc=1472611|pmid=16731945}}</ref>

Revisi per 16 Maret 2022 13.45

Rotavirus

Rekonstruksi visual rotavirus dengan bantuan komputer
Penyakitmuntah dan Gastroenteritis
Taksonomi
SuperdomainBiota
DomainVirus
FamiliReoviridae
SubfamiliSedoreovirinae
GenusRotavirus
Tipe taksonomiRotavirus A
Species
  • Rotavirus A
  • Rotavirus B
  • Rotavirus C
  • Rotavirus D
  • Rotavirus E
  • Rotavirus F
  • Rotavirus G
  • Rotavirus H
  • Rotavirus I

Rotavirus adalah genus dari virus RNA untai ganda dalam famili Reoviridae. Rotavirus adalah penyebab paling sering dari penyakit diare di kalangan bayi dan anak-anak, sedangkan pada orang dewasa jarang terinfeksi.[1] Hampir setiap anak di dunia terinfeksi rotavirus setidaknya sekali pada masa balita.[2] Imunitas berkembang seiring dengan terjadinya infeksi, sehingga infeksi yang terjadi setelahnya tidak parah.[3] Terdapat sembilan spesies dari genus ini, yaitu A, B, C, D, E, F, G, H dan I. Rotavirus A, spesies yang paling umum, menyebabkan lebih dari 90% infeksi rotavirus pada manusia.

Virus ini ditularkan melalui jalur transmisi fekal-oral. Virus ini juga menginfeksi dan merusak sel-sel yang melapisi usus halus dan menyebabkan gastroenteritis (yang sering disebut sebagai "flu perut" walaupun tidak berhubungan dengan influenza). Rotavirus ditemukan pada 1973 oleh Ruth Bishop dan rekan-rekannya melalui gambaran mikrografi elektron,[4] dan telah menyumbang sekitar sepertiga dari kasus rawat inap untuk diare parah pada bayi dan anak-anak,[5] tetapi tampak terabaikan secara historis dan dianggap tidak terlalu besar dalam bidang kesehatan masyarakat, khususnya di negara-negara berkembang.[6] Selain berdampak pada kesehatan manusia, rotavirus juga menginfeksi hewan, dan merupakan patogen hewan ternak.[7]

Enteritis karena rotavirus pada pada anak-anak bersifat mudah ditangani, Namun pada 2013, rotavirus menyebabkan 37 persen kematian anak-anak akibat diare dan 215.000 kematian di seluruh dunia,[8] dan hampir dua juta lebih mengalami sakit parah.[6] Sebagian besar dari kematian ini terjadi di negara-negara berkembang.[9] Di Amerika Serikat, sebelum dimulainya program vaksinasi rotavirus pada tahun 2000-an, rotavirus menyebabkan sekitar 2,7 juta kasus gastroenteritis parah pada anak-anak; hampir 60.000 memerlukan rawat inap, dan sekitar 37 kematian setiap tahun.[10] Setelah dimulainya vaksinasi rotavirus, angka rawat inap di rumah sakit menurun secara signifikan.[11][12] Kampanye kesehatan masyarakat untuk memerangi rotavirus berfokus pada penyediaan terapi rehidrasi oral untuk anak-anak yang terinfeksi, dan vaksinasi untuk mencegah penyakit.[13] Jumlah kejadian dan tingkat keparahan dari infeksi rotavirus telah menurun secara signifikan di negara-negara yang telah menambahkan vaksin rotavirus dalam kebijakan imunisasi rutin bagi anak-anak.[14][15][16]

Virologi

Tipe rotavirus

Terdapat sembilan spesies dari rotavirus, yaitu A, B, C, D, E, F, G, H dan I.[17] Manusia terutama terinfeksi oleh spesies rotavirus A. Spesies A–E menyebabkan penyakit pada hewan lain,[18] spesies E dan H pada babi, D, F dan G pada burung dan I pada kucing.[19][20][21] Pada Rotavirus A terdapat beberapa galur yang berbeda, disebut sebagai serotipe.[22] Seperti virus influenza, sistem klasifikasi ganda digunakan berdasarkan pada dua protein yang terletak di permukaan virus. Glikoprotein VP7 mendefinisikan serotipe G, dan VP4 merupakan protein yang sensitif terhadap protease, mendefinisikan serotipe P.[23] Karena dua gen yang menentukan tipe G dan tipe P dapat diteruskan secara terpisah kepada progeni virus, beberapa kombinasi yang berbeda dapat ditemukan.[23] Seluruh sistem genotipe genom telah dibuat untuk rotavirus A dan digunakan untuk menentukan asal dari galur-galur atipikal (tidak biasa).[24] Prevalensi masing-masing tipe-G dan tipe-P bervariasi antar-negara dan tahun.[25]

Strukur

Genom rotavirus terdiri dari 11 molekul RNA heliks ganda yang unik mencakup 18.555 nukleotida secara keseluruhan. Setiap heliks (segmen) merupakan sebuah gen, diberi nomor 1 hingga 11 dengan ukuran yang mengecil. Setiap gen mengkode satu protein, kecuali gen 9, yang mengkode dua protein.[26] RNA dikelilingi oleh protein kapsid berbentuk ikosahedral tiga lapis. Partikel virus berdiameter hingga 76,5 nmr[27][28] dan tidak berselubung.

Protein

A cut-up image of a single rotavirus particle showing the RNA moecules surrounded by the VP6 protein and this in turn surrounded by the VP7 protein. The V4 protein protrudes from the surface of the spherical particel.
Sebuah diagram sederhana dari lokasi protein struktural rotavirus.

Terdapat enam protein virus (VP) yang membentuk partikel virus (virion). Protein struktural ini disebut VP1, VP2, VP3, VP4, VP6 dan VP7. Selain VP, terdapat enam non-struktural protein (NSP), yang hanya diproduksi pada sel-sel yang terinfeksi oleh rotavirus, yang disebut NSP1, NSP2, NSP3, NSP4, NSP5 dan NSP6.[18]

Setidaknya enam dari dua belas protein yang dikodekan oleh genom rotavirus, berikatan dengan RNA.[29] Peran protein ini dalam replikasi rotavirus tidak sepenuhnya dipahami; fungsi protein dikaitkan dengan: (i) sintesis RNA dan pengemasan dalam virion, (ii) transportasi mRNA ke tempat replikasi genom, dan (iii) translasi mRNA dan regulasi ekspresi gen.[30]

Protein struktural

An electron micrograph of many rotavirus particles, two of which have several smaller, black spheres which appear to be attached to them
Mikrograf elektron dari emas nanopartikel yang terpasang untuk rotavirus. Gelap kecil melingkar benda nanopartikel emas yang dilapisi dengan antibodi monoklonal spesifik untuk rotavirus protein VP6.

VP1 terletak di inti partikel virus dan merupakan enzim RNA polimerase yang bergantung pada RNA.[31] Pada sel yang terinfeksi, enzim ini menghasilkan transkrip mRNA untuk sintesis protein virus dan menghasilkan salinan segmen RNA genom rotavirus untuk partikel virus yang baru diproduksi.[32]

VP2 membentuk lapisan inti virion dan mengikat genom RNA.[33]

VP3 merupakan bagian dari inti dalam virion dan merupakan enzim yang disebut guanilil transferase. Enzim ini mengkatalisis pembentukan topi ujung 5' dalam modifikasi pasca-transkripsi dari mRNA.[34] Topi tersebut menstabilkan mRNA virus dengan melindunginya dari enzim nukelase, suatu enzim pendegradasi asam nukleat.[35]

VP4 berada di permukaan virion yang menonjol seperti paku.[36] VP4 berikatan dengan molekul pada permukaan sel (reseptor) dan mendorong masuknya virus ke dalam sel. [37] VP4 harus dimodifikasi oleh enzim protease tripsin, yang ditemukan di usus, menjadi VP5* dan VP8* sebelum virus menjadi infeksius.[38] VP4 menentukan seberapa ganas virus dan menentukan tipe-P dari virus.[39] Pada manusia, ada hubungan antara golongan darah (sistem antigen Lewis, sistem golongan darah ABO, dan status sekretor) dan kerentanan terhadap infeksi. Nonsekretor tampaknya resisten terhadap infeksi oleh tipe P[4] dan P[8], menunjukkan bahwa antigen golongan darah merupakan reseptor untuk genotipe ini.[40] Resistensi ini tergantung pada genotipe rotavirus.[41]

VP6 membentuk sebagian besar kapsid. VP6 sangat antigenik dan dapat digunakan untuk mengidentifikasi spesies rotavirus.[42] Protein ini digunakan dalam tes laboratorium untuk infeksi rotavirus A.[43]

VP7 adalah glikoprotein yang membentuk permukaan luar virion. VP7 menentukan serotipe G, terlepas dari struktur fungsinya. VP7 bersama dengan VP4, terlibat dalam imunitas terhadap infeksi.[44]

Protein non-struktural

NSP1, suatu produk gen 5, adalah protein pengikat RNA nonstruktural.[45] NSP1 juga mengeblok respons interferon, bagian dari sistem imun bawaan yang melindungi sel dari infeksi virus. NSP1 memicu proteosom untuk menghancurkan komponen molekul sinyal yang diperlukan untuk merangsang produksi interferon dalam sel yang terinfeksi dan untuk merespons interferon yang disekresikan oleh sel yang berdekatan. Target degradasi mencakup beberapa faktor transkripsi IRF yang diperlukan untuk transkripsi gen interferon.[46]

NSP2 adalah protein pengikat RNA yang terakumulasi dalam inklusi sitoplasma (viroplasma) dan diperlukan untuk replikasi genom.[47][48]

NSP3 terikat pada mRNA virus dalam sel yang terinfeksi dan bertanggung jawab atas penghentian sintesis protein seluler.[49] NSP3 menonaktifkan dua faktor inisiasi translasi yang penting untuk sintesis protein dari mRNA inang. Pertama, NSP3 mengeluarkan protein pengikat poli(A) (PABP) dari faktor inisiasi translasi eIF4F. PABP diperlukan untuk transkripsi transkrip yang efisien dengan ekor 3' poli(A), yang ditemukan pada sebagian besar transkrip sel inang. Kedua, NSP3 menonaktifkan eIF2 dengan merangsang fosforilasinya.[50] Translasi mRNA rotavirus yang efisien, yang tidak memiliki ekor poli(A) 3', tidak memerlukan salah satu dari faktor-faktor ini.[51]

NSP4 adalah enterotoksin virus yang menyebabkan diare dan merupakan enterotoksin virus pertama yang ditemukan.[52] NSP5 disandi oleh segmen genom 11 rotavirus A. Pada sel yang terinfeksi, virus NSP5 terakumulasi dalam viroplasma.[53] NSP6 adalah protein pengikat asam nukleat [54] dan disandi oleh gen 11 dari luar fase rangka baca terbuka (ORF).[55]

Rotavirus gen dan protein
RNA Segmen (Gen) Ukuran (pasang basa) Protein Berat molekul kDa Lokasi Salinan per partikel Fungsi
1 3302 VP1 125 Di simpul dari inti 12 RNA-dependent RNA polymerase
2 2690 VP2 102 Bentuk-bentuk batin shell core 120 RNA binding
3 2591 VP3 88 Di simpul dari inti 12 methyltransferase mRNA pembatasan enzim
4 2362 VP4 87 Permukaan spike 180 Sel lampiran, virulensi
5 1611 NSP1 59 Nonstruktural 0 5'RNA mengikat, interferon antagonis
6 1356 VP6 45 Dalam Kapsid 780 Struktural dan spesies-spesifik antigen
7 1104 NSP3 37 Nonstruktural 0 Meningkatkan virus mRNA aktivitas dan shut-off sintesis protein seluler
8 1059 NSP2 35 Nonstruktural 0 NTPase terlibat dalam RNA kemasan
9 1062 VP71 VP72 38 dan 34 Permukaan 780 Struktural dan netralisasi antigen
10 751 NSP4 20 Nonstruktural 0 Enterotoksin juga
11 667 NSP5 NSP6 22 Nonstruktural 0 ssRNA dan dsRNA mengikat modulator NSP2, phosphoprotein

Tabel ini didasarkan pada strain rotavirus simian SA11. Kode RNA-protein dapat berbeda dalam beberapa strain.

Replikasi

Gambar sederhana dari siklus replikasi rotavirus. Tahapannya adalah (1) perlekatan virus ke sel inang, yang diperantarai oleh VP4 dan VP7, (2) penetrasi sel oleh virus dan uncoating kapsid virus (3) ditambah sintesis untai ssRNA (ini bertindak sebagai mRNA), yang dimediasi oleh VP1, VP3 dan VP2 (4) pembentukan viroplasma, pengemasan RNA virus dan sintesis RNA untai minus dan pembentukan partikel virus berlapis ganda (5) pematangan partikel virus dan pelepasan progeni virion.

Perlekatan virus ke sel inang diinisiasi oleh VP4, yang menempel pada molekul glikan, pada permukaan sel.[56] Virus memasuki sel melalui endositosis yang dimediasi reseptor dan membentuk vesikel yang dikenal sebagai endosom. Protein di lapisan ketiga (VP7 dan VP4 spike) mengganggu membran endosom, menciptakan perbedaan konsentrasi kalsium. Hal ini menyebabkan pemecahan trimer VP7 menjadi subunit protein tunggal, meninggalkan lapisan protein VP2 dan VP6 di sekitar dsRNA virus, membentuk partikel berlapis ganda (double-layered particle, DLP).[57]

Sebelas untai dsRNA tetap dalam perlindungan dua cangkang protein dan RNA polimerase yang bergantung pada RNA virus, menghasilkan transkrip mRNA dari genom virus beruntai ganda. RNA virus tetap berada di inti dalam rangka menghindari respons imun inang bawaan termasuk interferensi RNA yang dipicu oleh adanya RNA untai ganda.[58]

Selama infeksi, rotavirus menghasilkan mRNA untuk biosintesis protein dan replikasi gen. Sebagian besar protein rotavirus terakumulasi dalam viroplasma, tempat RNA direplikasi dan DLP dirakit. Dalam viroplasma, RNA virus sense positif yang digunakan sebagai cetakan untuk sintesis dsRNA genom virus dilindungi terhadap degradasi RNase yang diinduksi siRNA.[59] Viroplasma terbentuk setidaknya dua jam setelah setelah infeksi virus dan berlokasi di sekitar inti, terdiri dari pabrik virus yang diduga dibuat oleh dua protein nonstruktural virus: NSP5 dan NSP2. Penghambatan NSP5 oleh interferensi RNA in vitro menghasilkan penurunan tajam dalam replikasi rotavirus. DLP bermigrasi ke retikulum endoplasma tempat DLP mendapatkan lapisan luar ketiga (dibentuk oleh VP7 dan VP4). Progeni virus dilepaskan dari sel dengan lisis.[60][61][62]

Transmisi

Many rotavirus particles packed together, which all look similar
Rotavirus dalam tinja anak yang terinfeksi

Rotavirus ditularkan oleh fæcal-oral route, melalui kontak dengan tangan yang terkontaminasi, permukaan dan benda-benda,[63] dan mungkin oleh pernapasan rute.[64] Virus diare adalah sangat menular. Feses dari orang yang terinfeksi dapat mengandung lebih dari 10 triliun menular partikel per gram;[65] kurang dari 100 di antaranya yang diperlukan untuk menularkan infeksi kepada orang lain.[3]

Rotavirus stabil di lingkungan dan telah ditemukan di muara sungai sampel di tingkat 1-5 menular partikel per US galon, virus bertahan hidup di antara 9 dan 19 hari.[66] Tindakan sanitasi yang memadai untuk menghilangkan bakteri dan parasit tampaknya tidak efektif dalam mengontrol rotavirus, seperti kejadian infeksi rotavirus di negara-negara dengan tinggi dan rendahnya standar kesehatan serupa.[64]

Rotaviral enteritis adalah ringan sampai penyakit berat yang ditandai oleh mual, muntah, diare berair dan low-grade fever. Setelah anak terinfeksi oleh virus, ada masa inkubasi sekitar dua hari sebelum gejala muncul.[67] Periode penyakit akut. Gejala sering mulai dengan muntah yang diikuti oleh empat sampai delapan hari berlimpah diare. Dehidrasi lebih sering terjadi pada infeksi rotavirus daripada kebanyakan orang disebabkan oleh bakteri patogen, dan merupakan penyebab paling umum dari kematian yang terkait dengan infeksi rotavirus.[68]

Rotavirus Merupakan infeksi dapat terjadi sepanjang hidup: pertama biasanya menghasilkan gejala, tetapi setelah infeksi biasanya ringan atau tanpa gejala,[65][69] sebagai sistem kekebalan tubuh memberikan beberapa perlindungan.[70] Akibatnya, gejala tingkat infeksi tertinggi pada anak di bawah usia dua tahun dan menurun secara progresif terhadap 45 tahun.[71] Gejala yang paling parah cenderung terjadi pada anak-anak enam bulan sampai dua tahun, orang tua, dan orang dengan defisiensi imun. Karena kekebalan yang diperoleh pada masa kanak-kanak, kebanyakan orang dewasa tidak rentan terhadap rotavirus; gastroenteritis pada orang dewasa biasanya memiliki penyebab lain dari rotavirus, tetapi tanpa gejala infeksi pada orang dewasa dapat mempertahankan transmisi infeksi di masyarakat.[72] Ada beberapa bukti yang menunjukkan golongan darah status sekretor dan dominan bakteri dalam usus dapat berdampak pada kerentanan terhadap infeksi oleh rotavirus.[73]

Mekanisme penyakit

The micrograph at the top shows a damaged cell with a destroyed surface. The micrograph at the bottom shows a healthy cell with its surface intact.
Mikrograf elektron dari rotavirus terinfeksi enterocyte (atas) dibandingkan dengan yang tidak terinfeksi sel (bawah). Bar = kira-kira. 500 nm

Rotavirus menggandakan diri terutama di usus,[74] dan menginfeksi enterosit dari vili dari usus halus, menyebabkan perubahan struktural dan fungsional dari epitel.[75] Ada bukti pada manusia, dan terutama pada hewan model ekstraintestinal penyebaran virus menular ke organ lain dan makrofag.[76]

Diare ini disebabkan oleh beberapa aktivitas virus.[77] Malabsorpsi terjadi karena penghancuran sel-sel usus yang disebut enterosit. Enterotoksin rotavirus protein NSP4 menginduksi ion kalsium yang tergantung sekresi klorida, mengganggu transporter SGLT1 (natrium/glucose cotransporter 2) yang memperantarai reabsorpsi air, rupanya mengurangi aktivitas membran brush-border disakarida, dan mengaktifkan ion kalsium tergantung sekresi refleks dari sistem saraf enterik.[78] Peningkatan konsentrasi ion kalsium dalam sitosol (yang diperlukan untuk perakitan keturunan virus) dicapai oleh NSP4 yang beraksi sebagai viroporin. Peningkatan ion kalsium menyebabkan autofagi yang terinfeksi enterosit.[79]

NSP4 juga disekresikan. Ini ekstraseluler bentuk, yang dimodifikasi oleh enzim-enzim protease dalam usus, adalah enterotoksin juga yang bertindak pada sel yang tidak terinfeksi melalui integrin reseptor, yang pada gilirannya menyebabkan peningkatan kalsium intraseluler konsentrasi ion, sekretori diare dan autofagi.[80]

Muntah, yang merupakan karakteristik dari rotaviral enteritis, ini disebabkan oleh virus yang menginfeksi sel-sel enterokromaffin pada lapisan saluran pencernaan. Infeksi merangsang produksi (serotonin. Ini mengaktifkan vagal aferen saraf, yang pada gilirannya mengaktifkan sel-sel batang otak yang mengendalikan refleks muntah.[81]

Sehat enterosit mengeluarkan laktase dalam usus kecil; intoleransi susu karena defisiensi laktase adalah gejala dari infeksi rotavirus,[82] yang dapat bertahan selama berminggu-minggu.[83] Kambuhnya diare ringan sering mengikuti reintroduksi dari susu ke makanan anak, karena fermentasi bakteri dari disakarida laktosa dalam usus.[84]

Respons imun

Respons khusus

Rotavirus memperoleh kedua B dan sel T respon imun. Antibodi rotavirus VP4 dan VP7 protein yang menetralkan virus infektivitas in vitro dan in vivo.[85] Spesifik antibodi kelas IgM, IgA dan IgG juga diproduksi, yang telah ditunjukkan untuk melindungi terhadap infeksi rotavirus oleh passive transfer antibodi pada hewan.[86] Ibu trans-plasenta IgG mungkin memainkan peran dalam melindungi neonatus dari infeksi rotavirus, tetapi di sisi lain dapat mengurangi efikasi vaksin.[87]

Respons bawaan

Setelah infeksi oleh rotavirus ada yang cepat imun bawaan respon yang melibatkan jenis I dan III interferon dan sitokin (terutama Th1 dan Th2 [88]) yang menghambat replikasi virus dan merekrut makrofag, dan sel-sel pembunuh alami terhadap sel-sel yang terinfeksi rotavirus.[89] Rotavirus dsRNA mengaktifkan reseptor pengenalan pola seperti tol-seperti reseptor yang merangsang produksi interferon.[90] Rotavirus protein NSP1 melawan efek dari tipe 1 interferon dengan cara menekan aktivitas interferon regulasi protein IRF3, IRF5 dan IRF7.[90]

Penanda perlindungan

Kadar IgG dan IgA dalam darah, dan IgA di usus berkorelasi dengan perlindungan dari infeksi.[91] Rotavirus spesifik serum IgG dan IgA tinggi titer (misalnya >1:200) telah mengklaim untuk menjadi pelindung dan terdapat korelasi yang signifikan antara IgA dan titer vaksin rotavirus khasiat.[92]

Diagnosis dan deteksi

Diagnosis dari infeksi rotavirus biasanya mengikuti diagnosis gastroenteritis sebagai penyebab diare yang parah. Sebagian besar anak-anak dirawat di rumah sakit dengan gastroenteritis diuji untuk rotavirus A.[93][94] Spesifik diagnosis dari infeksi rotavirus A dibuat dengan menemukan virus di tinja oleh enzim immunoassay. Ada beberapa lisensi test kit di pasar yang sensitif, spesifik dan dapat mendeteksi semua serotipe dari rotavirus A.[95] metode Lain, seperti mikroskop elektron dan PCR (polymerase chain reaction), yang digunakan dalam penelitian laboratorium.[96] Reverse transcription-polymerase chain reaction (RT-PCR) dapat mendeteksi dan mengidentifikasi semua spesies dan serotipe manusia rotavirus.[97]

Pengobatan dan prognosis

Pengobatan akut infeksi rotavirus adalah nonspesifik dan melibatkan manajemen dari gejala dan, yang paling penting, manajemen dehidrasi.[13] Jika tidak diobati, anak-anak bisa mati dari yang dihasilkan dehidrasi berat.[98] Tergantung pada tingkat keparahan diare, pengobatan terdiri dari terapi rehidrasi oral, di mana anak diberi tambahan air untuk minum yang mengandung jumlah tertentu garam dan gula.[99] Pada tahun 2004, Organisasi Kesehatan Dunia (WHO) dan UNICEF merekomendasikan penggunaan rendah osmolaritas larutan rehidrasi oral dan zinc suplemen sebagai dua cabang pengobatan diare akut.[100] Beberapa infeksi yang cukup serius untuk menjamin rawat inap di mana cairan yang diberikan oleh terapi intravena atau intubasi nasogastrik, dan anak elektrolit dan gula darah dipantau.[93] Probiotik telah terbukti mengurangi durasi diare rotavirus,[101] dan menurut European Society for Pediatric Gastroenterology "intervensi yang efektif mencakup administrasi tertentu probiotik seperti Lactobacillus rhamnosus atau Saccharomyces boulardii, diosmectite atau racecadotril."[102] Rotavirus infeksi jarang menimbulkan komplikasi lain dan untuk dikelola dengan baik anak prognosis yang sangat baik.[103]

Thiazolides adalah kelas dari antivirus yang mungkin efektif dalam mengobati rotavirus, menurut studi.[104][105][106] Perawatan ini tidak disetujui untuk rotavirus oleh FDA dan penggunaannya merupakan off-label pengobatan.[106]

Pencegahan

Rotavirus sangat menular dan tidak dapat diobati dengan antibiotik atau obat-obatan lainnya. Karena peningkatan sanitasi tidak mengurangi prevalensi rotaviral penyakit, dan tingkat hospitalisations tetap tinggi meskipun penggunaan oral rehidrasi obat-obatan, utama kesehatan masyarakat intervensi adalah vaksinasi.[2] Pada tahun 1998, sebuah vaksin rotavirus memiliki ijin untuk digunakan di Amerika Serikat. Uji klinis di Amerika Serikat, Finlandia, dan Venezuela telah menemukan itu untuk menjadi 80% sampai 100% efektif untuk mencegah diare yang parah yang disebabkan oleh rotavirus A, dan peneliti telah terdeteksi tidak signifikan secara statistik serius efek samping.[107][108] Produsen, bagaimanapun, menarik diri dari pasar pada tahun 1999, setelah ditemukan bahwa vaksin mungkin telah berkontribusi terhadap peningkatan risiko untuk intususepsi, jenis obstruksi usus, dalam satu dari setiap 12,000 vaksinasi bayi.[109] Pengalaman memicu perdebatan sengit tentang risiko relatif dan manfaat dari vaksin rotavirus.[110] Pada tahun 2006, dua vaksin baru terhadap rotavirus A infeksi yang terbukti aman dan efektif pada anak-anak,[111] dan pada tahun 2009, WHO merekomendasikan bahwa vaksin rotavirus termasuk dalam semua program imunisasi nasional.[112]

Insiden dan keparahan dari infeksi rotavirus telah menurun secara signifikan di negara-negara yang telah bertindak atas rekomendasi ini.[14][113][114] 2014 tinjauan tersedia data percobaan klinis dari negara-negara yang secara rutin menggunakan vaksin rotavirus di nasional imunisasi program menemukan bahwa vaksin rotavirus telah mengurangi rotavirus hospitalisations oleh 49-92 persen dan semua penyebab diare hospitalisations oleh 17-55 persen.[115] Di Meksiko, yang pada tahun 2006 adalah yang pertama di antara negara-negara di dunia untuk memperkenalkan vaksin rotavirus, diare penyakit tingkat kematian yang menurun selama tahun 2009 rotavirus musim dengan lebih dari 65 persen di antara anak-anak usia dua dan bawah.[116] Di Nikaragua, yang pada tahun 2006 menjadi negara berkembang pertama yang memperkenalkan vaksin rotavirus, yang parah infeksi rotavirus berkurang 40 persen dan kunjungan ruang gawat darurat oleh setengah.[117] Di Amerika Serikat, vaksinasi rotavirus sejak tahun 2006 telah menyebabkan tetes di rotavirus terkait hospitalisations sebanyak 86 persen. Vaksin ini juga dapat mencegah penyakit non-vaksinasi anak-anak dengan membatasi jumlah beredar infeksi.[118] Di negara-negara berkembang di Afrika dan Asia, di mana mayoritas dari rotavirus kematian terjadi, sejumlah besar keselamatan dan uji khasiat serta recent post-pendahuluan dampak dan efektivitas studi Rotarix dan RotaTeq telah menemukan bahwa vaksin secara dramatis mengurangi penyakit yang parah pada bayi.[16][119][120][121] Pada September 2013, vaksin itu ditawarkan kepada semua anak-anak di INGGRIS, berusia antara dua dan tiga bulan, dan diharapkan untuk mengurangi separuh kasus-kasus infeksi berat dan mengurangi jumlah anak-anak yang dirawat di rumah sakit karena infeksi oleh 70 persen.[122] Di Eropa, rawat inap tingkat setelah infeksi oleh rotavirus telah mengalami penurunan sebesar 65% menjadi 84% setelah pengenalan vaksin.[123] Secara global, vaksinasi telah mengurangi penerimaan rumah sakit dan kunjungan ke gawat darurat dengan rata-rata 67%.[124]

Vaksin Rotavirus yang berlisensi di lebih dari 100 negara, dan lebih dari 80 negara telah memperkenalkan rutin vaksinasi rotavirus, hampir setengah dengan dukungan dari Gavi, Vaksin Aliansi.[125] Untuk membuat vaksin rotavirus yang tersedia, mudah diakses, dan terjangkau di semua negara, khususnya low - and middle-income negara-negara di Afrika dan Asia di mana mayoritas dari rotavirus kematian terjadi, JALAN (sebelumnya Program Teknologi Tepat guna di bidang Kesehatan), WHO, US Centers for Disease Control dan Pencegahan, dan Gavi telah bermitra dengan lembaga-lembaga penelitian dan pemerintah untuk menghasilkan dan menyebarkan bukti, harga yang lebih rendah, dan mempercepat pengenalan.[126]

Epidemiologi

Variasi musiman rotavirus Sebuah infeksi di Inggris: tingkat infeksi puncak selama bulan-bulan musim dingin.[127]

Rotavirus A, yang menyumbang lebih dari 90% dari rotavirus gastroenteritis pada manusia,[128] adalah endemik di seluruh dunia. Setiap tahun rotavirus menyebabkan jutaan kasus diare di negara berkembang, hampir 2 juta yang mengakibatkan rawat inap.[129] Pada tahun 2013, diperkirakan sebanyak 215.000 anak-anak muda dari lima meninggal dari infeksi rotavirus, 90 persen di antaranya berada di negara-negara berkembang.[6] Hampir setiap anak telah terinfeksi dengan rotavirus pada usia lima.[130] Rotavirus adalah satu penyebab diare yang parah pada bayi dan anak-anak, yang bertanggung jawab untuk sekitar sepertiga dari kasus-kasus yang memerlukan rawat inap,[131] dan menyebabkan 37% kematian disebabkan diare dan 5% dari semua kematian pada anak-anak muda dari lima.[132] Anak laki-laki dua kali lebih mungkin sebagai perempuan harus dirawat di rumah sakit karena infeksi rotavirus.[133][134] Dalam pra-era vaksinasi, infeksi rotavirus terjadi terutama selama dingin, musim kering.[135][136] Jumlah kasus yang disebabkan oleh kontaminasi makanan adalah tidak diketahui.[137]

Wabah rotavirus Yang diare yang dirawat di rumah sakit umum di antara bayi, anak-anak yang menghadiri penitipan pusat, dan orang-orang tua di panti jompo.[72][138] Wabah yang disebabkan oleh terkontaminasi air kota terjadi di Colorado pada tahun 1981.[139] Selama tahun 2005, yang terbesar yang tercatat epidemi diare terjadi di Nikaragua. Ini luar biasa besar dan berat wabah dikaitkan dengan mutasi pada rotavirus Sebuah genom, mungkin membantu virus melarikan diri lazim kekebalan dalam populasi.[140] Serupa wabah besar yang terjadi di Brazil pada tahun 1977.[141]

Rotavirus B, juga disebut dewasa diare rotavirus atau ADRV, telah menyebabkan epidemi besar diare yang parah, yang mempengaruhi ribuan orang dari segala usia di Cina. Ini epidemi ini terjadi sebagai akibat dari limbah kontaminasi air minum.[142][143] Rotavirus B infeksi juga terjadi di India pada tahun 1998; penyebab ketegangan itu bernama CAL. Tidak seperti ADRV, CAL saring adalah endemik.[144][145] Untuk saat ini, epidemi yang disebabkan oleh rotavirus B telah dibatasi ke daratan Cina, dan survei menunjukkan kurangnya kekebalan terhadap spesies ini di Amerika Serikat.[146] Rotavirus C telah dikaitkan dengan langka dan sporadis kasus diare pada anak-anak, dan wabah kecil terjadi dalam keluarga.[147]

Hewan lain

Rotavirus menginfeksi banyak spesies hewan di seluruh dunia dan menjadi penyebab utama diare, baik yang liar maupun dipelihara.[7] Sebagai patogen hewan ternak, terutama pada anak sapi dan anak babi, rotavirus menyebabkan kerugian ekonomi bagi petani karena biaya pengobatan yang berhubungan dengan tingginya morbiditas dan mortalitas.[148] Ini rotavirus adalah potensi reservoir untuk pertukaran genetik dengan manusia rotavirus.[148] Ada bukti bahwa rotavirus hewan dapat menginfeksi manusia, baik dengan transmisi langsung dari virus atau dengan menyumbangkan satu atau beberapa segmen RNA untuk reassortants dengan manusia strain.[149][150][151]

Sejarah

Salah satu Flewett asli mikrograf elektron menunjukkan satu partikel rotavirus. Ketika diperiksa oleh negatif patri mikroskop elektron, rotavirus sering menyerupai roda.

Pada tahun 1943, Jacob Light dan Horace Hodes membuktikan bahwa disaring agen di feses anak-anak dengan infeksi diare juga disebabkan gerusan (ternak diare) pada sapi.[152] Tiga dekade kemudian, diawetkan sampel dari agen yang terbukti rotavirus.[153] Pada tahun-tahun selanjutnya, virus pada tikus[154] terbukti terkait dengan virus yang menyebabkan gerusan.[155] Pada tahun 1973, Ruth Bishop dan rekan-rekan dijelaskan terkait virus ditemukan pada anak-anak dengan gastroenteritis.[4]

Pada tahun 1974, Thomas Henry Flewett mengusulkan nama rotavirus setelah mengamati bahwa, bila dilihat melalui mikroskop elektron, partikel rotavirus terlihat seperti roda (rota dalam bahasa Latin)[156][157] nama itu secara resmi diakui oleh Komite Internasional Taksonomi Virus empat tahun kemudian.[158] Pada tahun 1976, virus terkait yang diidentifikasi pada beberapa spesies hewan.[155] Virus-virus ini, semua menyebabkan gastroenteritis akut, yang diakui sebagai patogen kolektif yang mempengaruhi manusia dan hewan di seluruh dunia.[156] Rotavirus serotype yang pertama kali dijelaskan pada tahun 1980,[159] dan pada tahun berikutnya, rotavirus dari manusia pertama tumbuh dalam kultur sel yang berasal dari ginjal monyet, dengan menambahkan tripsin (enzim yang ditemukan dalam duodenum dari mamalia dan sekarang dikenal menjadi penting untuk rotavirus untuk meniru) ke media kultur.[160] Kemampuan untuk tumbuh rotavirus dalam budaya mempercepat laju penelitian, dan pada pertengahan 1980-an kandidat pertama vaksin sedang dievaluasi.[161]

Referensi

  1. ^ Dennehy PH (2015). "Rotavirus Infection: A Disease of the Past?". Infectious Disease Clinics of North America. 29 (4): 617–35. doi:10.1016/j.idc.2015.07.002. PMID 26337738. 
  2. ^ a b Bernstein DI (2009). "Rotavirus overview". The Pediatric Infectious Disease Journal. 28 (Suppl 3): S50–3. doi:10.1097/INF.0b013e3181967bee. PMID 19252423. 
  3. ^ a b "Rotavirus vaccines: opportunities and challenges". Human Vaccines. 5 (2): 57–69. 2009. doi:10.4161/hv.5.2.6924. PMID 18838873. 
  4. ^ a b Bishop R (2009). "Discovery of rotavirus: Implications for child health". Journal of Gastroenterology and Hepatology. 24 (Suppl 3): S81–5. doi:10.1111/j.1440-1746.2009.06076.x. PMID 19799704. 
  5. ^ World Health Organization (2015). "Global Rotavirus Sentinel Hospital Surveillance Network" (PDF). 
  6. ^ a b c Simpson E, Wittet S, Bonilla J, Gamazina K, Cooley L, Winkler JL (2007). "Use of formative research in developing a knowledge translation approach to rotavirus vaccine introduction in developing countries". BMC Public Health. 7: 281. doi:10.1186/1471-2458-7-281. PMC 2173895alt=Dapat diakses gratis. PMID 17919334. 
  7. ^ a b Fenner's Veterinary Virology (edisi ke-4th). Boston: Academic Press. 2010. hlm. 288. ISBN 978-0-12-375158-4. 
  8. ^ Tate JE, Burton AH, Boschi-Pinto C, Parashar UD (May 2016). "Global, Regional, and National Estimates of Rotavirus Mortality in Children <5 Years of Age, 2000-2013". Clinical Infectious Diseases. 62 Suppl 2 (Suppl 2): S96–S105. doi:10.1093/cid/civ1013. PMID 27059362. 
  9. ^ World Health Organization (2008). "Global networks for surveillance of rotavirus gastroenteritis, 2001–2008" (PDF). Weekly Epidemiological Record. 83 (47): 421–8. Diakses tanggal 3 May 2012. 
  10. ^ Fischer TK, Viboud C, Parashar U, Malek M, Steiner C, Glass R, Simonsen L (April 2007). "Hospitalizations and deaths from diarrhea and rotavirus among children <5 years of age in the United States, 1993-2003". The Journal of Infectious Diseases. 195 (8): 1117–25. doi:10.1086/512863. PMID 17357047. 
  11. ^ Leshem E, Moritz RE, Curns AT, Zhou F, Tate JE, Lopman BA, Parashar UD (July 2014). "Rotavirus vaccines and health care utilization for diarrhea in the United States (2007-2011)". Pediatrics. 134 (1): 15–23. doi:10.1542/peds.2013-3849. PMID 24913793. 
  12. ^ Tate JE, Cortese MM, Payne DC, Curns AT, Yen C, Esposito DH, et al. (January 2011). "Uptake, impact, and effectiveness of rotavirus vaccination in the United States: review of the first 3 years of postlicensure data". The Pediatric Infectious Disease Journal. 30 (1 Suppl): S56–60. doi:10.1097/INF.0b013e3181fefdc0. PMID 21183842. 
  13. ^ a b Diggle L (2007). "Rotavirus diarrhea and future prospects for prevention". British Journal of Nursing. 16 (16): 970–4. doi:10.12968/bjon.2007.16.16.27074. PMID 18026034. 
  14. ^ a b "Summary of effectiveness and impact of rotavirus vaccination with the oral pentavalent rotavirus vaccine: a systematic review of the experience in industrialized countries". Human Vaccines. 7 (7): 734–48. 2011. doi:10.4161/hv.7.7.15511. PMID 21734466. 
  15. ^ Jiang V, Jiang B, Tate J, Parashar UD, Patel MM (July 2010). "Performance of rotavirus vaccines in developed and developing countries". Human Vaccines. 6 (7): 532–42. doi:10.4161/hv.6.7.11278. PMC 3322519alt=Dapat diakses gratis. PMID 20622508. 
  16. ^ a b Parashar UD, Johnson H, Steele AD, Tate JE (May 2016). Parashar UD, Tate JE, ed. "Health Impact of Rotavirus Vaccination in Developing Countries: Progress and Way Forward". Clinical Infectious Diseases. 62 Suppl 2 (Suppl 2): S91–5. doi:10.1093/cid/civ1015. PMID 27059361. 
  17. ^ "Virus Taxonomy: 2017 Release". International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV). 
  18. ^ a b "Genetic and antigenic diversity of human rotaviruses: potential impact on vaccination programs". The Journal of Infectious Diseases. 202 Suppl (Suppl 1): S43–8. September 2010. doi:10.1086/653548. PMID 20684716. 
  19. ^ "Porcine rotavirus closely related to novel group of human rotaviruses". Emerging Infectious Diseases. 17 (8): 1491–3. August 2011. doi:10.3201/eid1708.101466. PMC 3381553alt=Dapat diakses gratis. PMID 21801631. 
  20. ^ "Widespread rotavirus H in commercially raised pigs, United States". Emerging Infectious Diseases. 20 (7): 1195–8. July 2014. doi:10.3201/eid2007.140034. PMC 4073875alt=Dapat diakses gratis. PMID 24960190. 
  21. ^ "Rotavirus I in feces of a cat with diarrhea". Virus Genes. 53 (3): 487–490. June 2017. doi:10.1007/s11262-017-1440-4. PMID 28255929. 
  22. ^ "The ever-changing landscape of rotavirus serotypes". The Pediatric Infectious Disease Journal. 28 (3 Suppl): S60–2. March 2009. doi:10.1097/INF.0b013e3181967c29. PMID 19252426. 
  23. ^ a b "Rotavirus diversity and evolution in the post-vaccine world". Discovery Medicine. 13 (68): 85–97. January 2012. PMC 3738915alt=Dapat diakses gratis. PMID 22284787. 
  24. ^ "Unbiased whole-genome deep sequencing of human and porcine stool samples reveals circulation of multiple groups of rotaviruses and a putative zoonotic infection". Virus Evolution. 2 (2): vew027. July 2016. doi:10.1093/ve/vew027. PMC 5522372alt=Dapat diakses gratis. PMID 28748110. 
  25. ^ "Temporal and geographical distributions of human rotavirus serotypes, 1983 to 1988". Journal of Clinical Microbiology. 27 (12): 2827–33. December 1989. PMC 267135alt=Dapat diakses gratis. PMID 2556435. 
  26. ^ "Rotavirus gene structure and function". Microbiological Reviews. 53 (4): 410–49. 1989. PMC 372748alt=Dapat diakses gratis. PMID 2556635. 
  27. ^ "Rotavirus proteins: structure and assembly". Reoviruses: Entry, Assembly and Morphogenesis. Current Topics in Microbiology and Immunology. 309. New York: Springer. 2006. hlm. 189–219. doi:10.1007/3-540-30773-7_7. ISBN 978-3-540-30772-3. PMID 16913048. 
  28. ^ "Structure of rotavirus". Rotaviruses. Current Topics in Microbiology and Immunology. 185. New York: Springer. 1994. hlm. 9–29. ISBN 9783540567615. PMID 8050286. 
  29. ^ Patton JT (1995). "Structure and function of the rotavirus RNA-binding proteins". The Journal of General Virology. 76 (11): 2633–44. doi:10.1099/0022-1317-76-11-2633. PMID 7595370. 
  30. ^ Patton JT (2001). "Rotavirus RNA replication and gene expression". Gastroenteritis Viruses. Novartis Foundation Symposium. Novartis Foundation Symposia. 238. hlm. 64–77; discussion 77–81. doi:10.1002/0470846534.ch5. ISBN 9780470846537. PMID 11444036. 
  31. ^ Vásquez-del Carpió R, Morales JL, Barro M, Ricardo A, Spencer E (2006). "Bioinformatic prediction of polymerase elements in the rotavirus VP1 protein". Biological Research. 39 (4): 649–59. doi:10.4067/S0716-97602006000500008. PMID 17657346. 
  32. ^ Trask SD, Ogden KM, Patton JT (2012). "Interactions among capsid proteins orchestrate rotavirus particle functions". Current Opinion in Virology. 2 (4): 373–9. doi:10.1016/j.coviro.2012.04.005. PMC 3422376alt=Dapat diakses gratis. PMID 22595300. 
  33. ^ Taraporewala ZF, Patton JT (2004). "Nonstructural proteins involved in genome packaging and replication of rotaviruses and other members of the Reoviridae". Virus Research. 101 (1): 57–66. doi:10.1016/j.virusres.2003.12.006. PMID 15010217. 
  34. ^ Angel J, Franco MA, Greenberg HB (2009). Mahy BW, Van Regenmortel MH, ed. Desk Encyclopedia of Human and Medical Virology. Boston: Academic Press. hlm. 277. ISBN 978-0-12-375147-8. 
  35. ^ Cowling VH (2009). "Regulation of mRNA cap methylation". The Biochemical Journal. 425 (2): 295–302. doi:10.1042/BJ20091352. PMC 2825737alt=Dapat diakses gratis. PMID 20025612. 
  36. ^ Gardet A, Breton M, Fontanges P, Trugnan G, Chwetzoff S (2006). "Rotavirus spike protein VP4 binds to and remodels actin bundles of the epithelial brush border into actin bodies". Journal of Virology. 80 (8): 3947–56. doi:10.1128/JVI.80.8.3947-3956.2006. PMC 1440440alt=Dapat diakses gratis. PMID 16571811. 
  37. ^ Arias CF, Isa P, Guerrero CA, Méndez E, Zárate S, López T, Espinosa R, Romero P, López S (2002). "Molecular biology of rotavirus cell entry". Archives of Medical Research. 33 (4): 356–61. doi:10.1016/S0188-4409(02)00374-0. PMID 12234525. 
  38. ^ Jayaram H, Estes MK, Prasad BV (2004). "Emerging themes in rotavirus cell entry, genome organization, transcription and replication". Virus Research. 101 (1): 67–81. doi:10.1016/j.virusres.2003.12.007. PMID 15010218. 
  39. ^ Hoshino Y, Jones RW, Kapikian AZ (2002). "Characterization of neutralization specificities of outer capsid spike protein VP4 of selected murine, lapine, and human rotavirus strains". Virology. 299 (1): 64–71. doi:10.1006/viro.2002.1474. PMID 12167342. 
  40. ^ Van Trang N, Vu HT, Le NT, Huang P, Jiang X, Anh DD (2014). "Association between norovirus and rotavirus infection and histo-blood group antigen types in Vietnamese children". Journal of Clinical Microbiology. 52 (5): 1366–74. doi:10.1128/JCM.02927-13. PMC 3993640alt=Dapat diakses gratis. PMID 24523471. 
  41. ^ Sharma S, Hagbom M, Svensson L, Nordgren J (March 2020). "The Impact of Human Genetic Polymorphisms on Rotavirus Susceptibility, Epidemiology, and Vaccine Take". Viruses. 12 (3). doi:10.3390/v12030324. PMC 7150750alt=Dapat diakses gratis. PMID 32192193. 
  42. ^ Bishop RF (1996). "Natural history of human rotavirus infection". Viral Gastroenteritis. Archives of Virology. 12. hlm. 119–28. doi:10.1007/978-3-7091-6553-9_14. ISBN 978-3-211-82875-5. PMID 9015109. 
  43. ^ Beards GM, Campbell AD, Cottrell NR, Peiris JS, Rees N, Sanders RC, Shirley JA, Wood HC, Flewett TH (1984). "Enzyme-linked immunosorbent assays based on polyclonal and monoclonal antibodies for rotavirus detection" (PDF). Journal of Clinical Microbiology. 19 (2): 248–54. doi:10.1128/JCM.19.2.248-254.1984. PMC 271031alt=Dapat diakses gratis. PMID 6321549. 
  44. ^ Pesavento JB, Crawford SE, Estes MK, Prasad BV (2006). "Rotavirus proteins: structure and assembly". Dalam Roy P. Reoviruses: Entry, Assembly and Morphogenesis. Current Topics in Microbiology and Immunology. 309. New York: Springer. hlm. 189–219. doi:10.1007/3-540-30773-7_7. ISBN 978-3-540-30772-3. PMID 16913048. 
  45. ^ Hua J, Mansell EA, Patton JT (1993). "Comparative analysis of the rotavirus NS53 gene: conservation of basic and cysteine-rich regions in the protein and possible stem-loop structures in the RNA". Virology. 196 (1): 372–8. doi:10.1006/viro.1993.1492. PMID 8395125. 
  46. ^ Arnold MM (2016). "The Rotavirus Interferon Antagonist NSP1: Many Targets, Many Questions". Journal of Virology. 90 (11): 5212–5. doi:10.1128/JVI.03068-15. PMC 4934742alt=Dapat diakses gratis. PMID 27009959. 
  47. ^ "Nonstructural proteins involved in genome packaging and replication of rotaviruses and other members of the Reoviridae". Virus Research. 101 (1): 57–66. 2004. doi:10.1016/j.virusres.2003.12.006. PMID 15010217. 
  48. ^ "The rotavirus RNA-binding protein NS35 (NSP2) forms 10S multimers and interacts with the viral RNA polymerase". Virology. 202 (2): 803–13. 1994. doi:10.1006/viro.1994.1402. PMID 8030243. 
  49. ^ Poncet D, Aponte C, Cohen J (1993). "Rotavirus protein NSP3 (NS34) is bound to the 3' end consensus sequence of viral mRNAs in infected cells" (PDF). Journal of Virology. 67 (6): 3159–65. doi:10.1128/JVI.67.6.3159-3165.1993. PMC 237654alt=Dapat diakses gratis. PMID 8388495. 
  50. ^ Gratia M, Vende P, Charpilienne A, Baron HC, Laroche C, Sarot E, Pyronnet S, Duarte M, Poncet D (2016). "Challenging the Roles of NSP3 and Untranslated Regions in Rotavirus mRNA Translation". PLOS ONE. 11 (1): e0145998. Bibcode:2016PLoSO..1145998G. doi:10.1371/journal.pone.0145998. PMC 4699793alt=Dapat diakses gratis. PMID 26727111. 
  51. ^ López S, Arias CF (2012). "Rotavirus-host cell interactions: an arms race". Current Opinion in Virology. 2 (4): 389–98. doi:10.1016/j.coviro.2012.05.001. PMID 22658208. 
  52. ^ Hyser JM, Estes MK (2009). "Rotavirus vaccines and pathogenesis: 2008". Current Opinion in Gastroenterology. 25 (1): 36–43. doi:10.1097/MOG.0b013e328317c897. PMC 2673536alt=Dapat diakses gratis. PMID 19114772. 
  53. ^ Afrikanova I, Miozzo MC, Giambiagi S, Burrone O (1996). "Phosphorylation generates different forms of rotavirus NSP5". Journal of General Virology. 77 (9): 2059–65. doi:10.1099/0022-1317-77-9-2059. PMID 8811003. 
  54. ^ Rainsford EW, McCrae MA (2007). "Characterization of the NSP6 protein product of rotavirus gene 11". Virus Research. 130 (1–2): 193–201. doi:10.1016/j.virusres.2007.06.011. PMID 17658646. 
  55. ^ Mohan KV, Atreya CD (2001). "Nucleotide sequence analysis of rotavirus gene 11 from two tissue culture-adapted ATCC strains, RRV and Wa". Virus Genes. 23 (3): 321–9. doi:10.1023/A:1012577407824. PMID 11778700. 
  56. ^ Rodríguez JM, Luque D (2019). "Structural Insights into Rotavirus Entry". Advances in Experimental Medicine and Biology. 1215: 45–68. doi:10.1007/978-3-030-14741-9_3. ISBN 978-3-030-14740-2. PMID 31317495. 
  57. ^ Baker M, Prasad BV (2010). "Rotavirus cell entry". Dalam Johnson J. Cell Entry by Non-Enveloped Viruses. Current Topics in Microbiology and Immunology. 343. hlm. 121–48. doi:10.1007/82_2010_34. ISBN 978-3-642-13331-2. PMID 20397068. 
  58. ^ Arnold MM (2016). "The Rotavirus Interferon Antagonist NSP1: Many Targets, Many Questions". Journal of Virology. 90 (11): 5212–5. doi:10.1128/JVI.03068-15. PMC 4934742alt=Dapat diakses gratis. PMID 27009959. 
  59. ^ Silvestri LS, Taraporewala ZF, Patton JT (2004). "Rotavirus replication: plus-sense templates for double-stranded RNA synthesis are made in viroplasms". Journal of Virology. 78 (14): 7763–74. doi:10.1128/JVI.78.14.7763-7774.2004. PMC 434085alt=Dapat diakses gratis. PMID 15220450. 
  60. ^ Jayaram H, Estes MK, Prasad BV (2004). "Emerging themes in rotavirus cell entry, genome organization, transcription and replication". Virus Research. 101 (1): 67–81. doi:10.1016/j.virusres.2003.12.007. PMID 15010218. 
  61. ^ Patton JT, Vasquez-Del Carpio R, Spencer E (2004). "Replication and transcription of the rotavirus genome". Current Pharmaceutical Design. 10 (30): 3769–77. doi:10.2174/1381612043382620. PMID 15579070. 
  62. ^ Ruiz MC, Leon T, Diaz Y, Michelangeli F (2009). "Molecular biology of rotavirus entry and replication". The Scientific World Journal. 9: 1476–97. doi:10.1100/tsw.2009.158. PMC 5823125alt=Dapat diakses gratis. PMID 20024520. 
  63. ^ "Prevalence of rotavirus on high-risk fomites in day-care facilities". Pediatrics. 92 (2): 202–5. 1993. PMID 8393172. 
  64. ^ a b Dennehy PH (2000). "Transmission of rotavirus and other enteric pathogens in the home". Pediatric Infectious Disease Journal. 19 (Suppl 10): S103–5. doi:10.1097/00006454-200010001-00003. PMID 11052397. 
  65. ^ a b Bishop RF (1996). Natural history of human rotavirus infection. Archives of Virology. 12. hlm. 119–28. doi:10.1007/978-3-7091-6553-9_14. ISBN 978-3-211-82875-5. PMID 9015109. 
  66. ^ "Isolation of enteroviruses from water, suspended solids, and sediments from Galveston Bay: survival of poliovirus and rotavirus adsorbed to sediments" (PDF). Applied and Environmental Microbiology. 48 (2): 404–9. 1984. PMC 241526alt=Dapat diakses gratis. PMID 6091548. 
  67. ^ "Rotavirus vaccine, live, oral, tetravalent (RotaShield)". Pediatric Nursing. 25 (2): 203–4, 207. 1999. PMID 10532018. 
  68. ^ "Rotavirus". Baillière's Clinical Gastroenterology. 4 (3): 609–25. 1990. doi:10.1016/0950-3528(90)90052-I. PMID 1962726. 
  69. ^ "Rotavirus vaccines: current prospects and future challenges". The Lancet. 368 (9532): 323–32. 2006. doi:10.1016/S0140-6736(06)68815-6. PMID 16860702. 
  70. ^ Offit PA (2001). Gastroenteritis viruses. New York: Wiley. hlm. 106–124. ISBN 978-0-471-49663-2. 
  71. ^ "Epidemiology of Group A Rotaviruses: Surveillance and Burden of Disease Studies". Rotaviruses: Methods and Protocols. Methods in Molecular Medicine. 34. Totowa, NJ: Humana Press. 2000. hlm. 217–38. doi:10.1385/1-59259-078-0:217. ISBN 978-0-89603-736-6. PMID 21318862. 
  72. ^ a b "Rotavirus infection in adults". The Lancet Infectious Diseases. 4 (2): 91–9. 2004. doi:10.1016/S1473-3099(04)00928-4. PMID 14871633. 
  73. ^ "Relevance of secretor status genotype and microbiota composition in susceptibility to rotavirus and norovirus infections in humans". Scientific Reports. 7: 45559. 2017. Bibcode:2017NatSR...745559R. doi:10.1038/srep45559. PMC 5372083alt=Dapat diakses gratis. PMID 28358023. 
  74. ^ "Rotaviruses: from pathogenesis to vaccination". Gastroenterology. 136 (6): 1939–51. 2009. doi:10.1053/j.gastro.2009.02.076. PMC 3690811alt=Dapat diakses gratis. PMID 19457420. 
  75. ^ "Rotavirus pathology and pathophysiology". Rotaviruses. Current Topics in Microbiology and Immunology. 185. New York: Springer. 1994. hlm. 255–83. ISBN 9783540567615. PMID 8050281. 
  76. ^ "Rotavirus viremia and extraintestinal viral infection in the neonatal rat model". Journal of Virology. 80 (10): 4820–32. 2006. doi:10.1128/JVI.80.10.4820-4832.2006. PMC 1472071alt=Dapat diakses gratis. PMID 16641274. 
  77. ^ "Pathogenesis of intestinal and systemic rotavirus infection". Journal of Virology. 78 (19): 10213–20. 2004. doi:10.1128/JVI.78.19.10213-10220.2004. PMC 516399alt=Dapat diakses gratis. PMID 15367586. 
  78. ^ "Rotavirus vaccines and pathogenesis: 2008". Current Opinion in Gastroenterology. 25 (1): 36–43. 2009. doi:10.1097/MOG.0b013e328317c897. PMC 2673536alt=Dapat diakses gratis. PMID 19114772. 
  79. ^ "Rotavirus disrupts calcium homeostasis by NSP4 viroporin activity". mBio. 1 (5). 2010. doi:10.1128/mBio.00265-10. PMC 2999940alt=Dapat diakses gratis. PMID 21151776. 
  80. ^ "Rotavirus NSP4 induces a novel vesicular compartment regulated by calcium and associated with viroplasms". Journal of Virology. 80 (12): 6061–71. 2006. doi:10.1128/JVI.02167-05. PMC 1472611alt=Dapat diakses gratis. PMID 16731945. 
  81. ^ "Towards a human rotavirus disease model". Current Opinion in Virology. 2 (4): 408–18. 2012. doi:10.1016/j.coviro.2012.05.006. PMID 22722079. 
  82. ^ Farnworth ER (2008). "The evidence to support health claims for probiotics". The Journal of Nutrition. 138 (6): 1250S–4S. doi:10.1093/jn/138.6.1250S. PMID 18492865. 
  83. ^ "Health aspects of probiotics". IDrugs : The Investigational Drugs Journal. 6 (6): 573–80. 2003. PMID 12811680. 
  84. ^ Arya SC (1984). "Rotaviral infection and intestinal lactase level". Journal of Infectious Diseases. 150 (5): 791. doi:10.1093/infdis/150.5.791. PMID 6436397. 
  85. ^ "Mechanisms of protection against rotavirus infection and disease". The Pediatric Infectious Disease Journal. 28 (Suppl 3): S57–9. 2009. doi:10.1097/INF.0b013e3181967c16. PMID 19252425. 
  86. ^ "IgY antibodies protect against human Rotavirus induced diarrhea in the neonatal gnotobiotic piglet disease model". PLOS One. 7 (8): e42788. 2012. Bibcode:2012PLoSO...742788V. doi:10.1371/journal.pone.0042788. PMC 3411843alt=Dapat diakses gratis. PMID 22880110. 
  87. ^ "Contribution of Maternal Immunity to Decreased Rotavirus Vaccine Performance in Low- and Middle-Income Countries". Clinical and Vaccine Immunology : CVI. 24 (1). 2017. doi:10.1128/CVI.00405-16. PMC 5216432alt=Dapat diakses gratis. PMID 27847365. 
  88. ^ "Cytokines in the management of rotavirus infection: A systematic review of in vivo studies". Cytokine. 96: 152–60. 2017. doi:10.1016/j.cyto.2017.04.013. PMID 28414969. 
  89. ^ "Innate cellular responses to rotavirus infection". The Journal of General Virology. 94 (6): 1151–60. 2013. doi:10.1099/vir.0.051276-0. PMID 23486667. 
  90. ^ a b "Intestinal Innate Antiviral Immunity and Immunobiotics: Beneficial Effects against Rotavirus Infection". Frontiers in Immunology. 7: 563. 2016. doi:10.3389/fimmu.2016.00563. PMC 5136547alt=Dapat diakses gratis. PMID 27994593. 
  91. ^ Rotaviruses: immunological determinants of protection against infection and disease. Advances in Virus Research. 44. 1994. hlm. 161–202. doi:10.1016/S0065-3527(08)60329-2. ISBN 9780120398447. PMID 7817873. 
  92. ^ "A systematic review of anti-rotavirus serum IgA antibody titer as a potential correlate of rotavirus vaccine efficacy". The Journal of Infectious Diseases. 208 (2): 284–94. 2013. doi:10.1093/infdis/jit166. PMID 23596320. 
  93. ^ a b "Routine laboratory testing data for surveillance of rotavirus hospitalizations to evaluate the impact of vaccination". The Pediatric Infectious Disease Journal. 26 (10): 914–9. 2007. doi:10.1097/INF.0b013e31812e52fd. PMID 17901797. 
  94. ^ The Pediatric ROTavirus European CommitTee (PROTECT) (2006). "The paediatric burden of rotavirus disease in Europe". Epidemiology and Infection. 134 (5): 908–16. doi:10.1017/S0950268806006091. PMC 2870494alt=Dapat diakses gratis. PMID 16650331. 
  95. ^ Desk Encyclopedia of Human and Medical Virology. Boston: Academic Press. 2009. hlm. 278. ISBN 978-0-12-375147-8. 
  96. ^ Gastroenteritis viruses. New York: Wiley. 2001. hlm. 14. ISBN 978-0-471-49663-2. 
  97. ^ "Rotavirus typing methods and algorithms". Reviews in Medical Virology. 14 (2): 71–82. 2004. doi:10.1002/rmv.411. PMID 15027000. 
  98. ^ "Treatment of infectious diarrhea in children". Paediatric Drugs. 5 (3): 151–65. 2003. doi:10.2165/00128072-200305030-00002. PMID 12608880. 
  99. ^ Sachdev HP (1996). "Oral rehydration therapy". Journal of the Indian Medical Association. 94 (8): 298–305. PMID 8855579. 
  100. ^ World Health Organization, UNICEF. "Joint Statement: Clinical Management of Acute Diarrhoea" (PDF). Diakses tanggal 3 May 2012. 
  101. ^ "Efficacy of probiotic use in acute rotavirus diarrhea in children: A systematic review and meta-analysis". Caspian Journal of Internal Medicine. 6 (4): 187–95. 2015. PMC 4649266alt=Dapat diakses gratis. PMID 26644891. 
  102. ^ "European Society for Pediatric Gastroenterology, Hepatology, and Nutrition/European Society for Pediatric Infectious Diseases evidence-based guidelines for the management of acute gastroenteritis in children in Europe: update 2014". Journal of Pediatric Gastroenterology and Nutrition. 59 (1): 132–52. 2014. doi:10.1097/MPG.0000000000000375. PMID 24739189. 
  103. ^ Ramig RF (2007). "Systemic rotavirus infection". Expert Review of Anti-infective Therapy. 5 (4): 591–612. doi:10.1586/14787210.5.4.591. PMID 17678424. 
  104. ^ "Thiazolides, a new class of antiviral agents effective against rotavirus infection, target viral morphogenesis, inhibiting viroplasm formation". Journal of Virology. 87 (20): 11096–106. October 2013. doi:10.1128/JVI.01213-13. PMC 3807293alt=Dapat diakses gratis. PMID 23926336. 
  105. ^ "Thiazolides, a new class of antiviral agents effective against rotavirus infection, target viral morphogenesis, inhibiting viroplasm formation". Journal of Virology. 87 (20): 11096–106. October 2013. doi:10.1128/JVI.01213-13. PMID 23926336. 
  106. ^ a b Baroudi, Roula; Grace, Edward; Flaugher, Marquetta. "Anemia associated with Alinia monotherapy when used longer than FDA-approved duration". Healio.com. Diakses tanggal 2019-02-10. 
  107. ^ "Rotavirus vaccine for the prevention of rotavirus gastroenteritis among children. Recommendations of the Advisory Committee on Immunization Practices (ACIP)". MMWR. Recommendations and Reports : Morbidity and Mortality Weekly Report. Recommendations and Reports. 48 (RR-2): 1–20. 1999. PMID 10219046. 
  108. ^ Kapikian AZ (2001). A rotavirus vaccine for prevention of severe diarrhoea of infants and young children: development, utilization and withdrawal. Novartis Foundation Symposium. Novartis Foundation Symposia. 238. hlm. 153–71; discussion 171–9. doi:10.1002/0470846534.ch10. ISBN 9780470846537. PMID 11444025. 
  109. ^ Bines JE (2005). "Rotavirus vaccines and intussusception risk". Current Opinion in Gastroenterology. 21 (1): 20–5. PMID 15687880. 
  110. ^ Bines J (2006). "Intussusception and rotavirus vaccines". Vaccine. 24 (18): 3772–6. doi:10.1016/j.vaccine.2005.07.031. PMID 16099078. 
  111. ^ Dennehy PH (2008). "Rotavirus vaccines: an overview". Clinical Microbiology Reviews. 21 (1): 198–208. doi:10.1128/CMR.00029-07. PMC 2223838alt=Dapat diakses gratis. PMID 18202442. 
  112. ^ "Global impact of rotavirus vaccines". Expert Review of Vaccines. 9 (4): 395–407. 2010. doi:10.1586/erv.10.17. PMID 20370550. 
  113. ^ "Performance of rotavirus vaccines in developed and developing countries". Human Vaccines. 6 (7): 532–42. July 2010. doi:10.4161/hv.6.7.11278. PMC 3322519alt=Dapat diakses gratis. PMID 20622508. 
  114. ^ "Health Impact of Rotavirus Vaccination in Developing Countries: Progress and Way Forward". Clinical Infectious Diseases. 62 Suppl 2 (Suppl 2): S91–5. May 2016. doi:10.1093/cid/civ1015. PMID 27059361. 
  115. ^ "Rotavirus Vaccines in Routine Use". Clinical Infectious Diseases. 59 (9): 1291–1301. 2014. doi:10.1093/cid/ciu564. PMID 25048849. 
  116. ^ "Effect of Rotavirus Vaccination on Death From Childhood Diarrhea in Mexico". The New England Journal of Medicine. 362 (4): 299–305. 2010. doi:10.1056/NEJMoa0905211. PMID 20107215. 
  117. ^ "Duration of protection of pentavalent rotavirus vaccination in Nicaragua". Pediatrics. 130 (2): e365–72. 2012. doi:10.1542/peds.2011-3478. PMID 22753550. 
  118. ^ "Real World Impact of Rotavirus Vaccination". Pediatric Infectious Disease Journal. 30 (1): S1–5. 2011. doi:10.1097/INF.0b013e3181fefa1f. PMID 21183833. Diakses tanggal 8 May 2012. 
  119. ^ Neuzil KM, Armah GE, Parashar UD, Steele AD (2010). "Rotavirus Infection in Africa: Epidemiology, Burden of Disease, and Strain Diversity". Journal of Infectious Diseases. 202 (Suppl 1): S1–S265. doi:10.1086/653545. PMID 20684687. 
  120. ^ "Rotavirus in Asia: Updates on Disease Burden, Genotypes and Vaccine Introduction". Vaccine. 27 (Suppl 5): F1–F138. 2009. 
  121. ^ World Health Organization (2009). "Rotavirus vaccines: an update" (PDF). Weekly Epidemiological Record. 51–52 (84): 533–40. Diakses tanggal 8 May 2012. 
  122. ^ "New vaccine to help protect babies against rotavirus". UK Department of Health. 10 November 2012. Diakses tanggal 10 November 2012. 
  123. ^ "Effectiveness and impact of rotavirus vaccines in Europe, 2006–2014". Vaccine. 33 (18): 2097–107. 2015. doi:10.1016/j.vaccine.2015.03.016. PMID 25795258. 
  124. ^ "Global Impact of Rotavirus Vaccination on Childhood Hospitalizations and Mortality from Diarrhea". The Journal of Infectious Diseases. 215 (11): 1666–72. 2017. doi:10.1093/infdis/jix186. PMC 5543929alt=Dapat diakses gratis. PMID 28430997. 
  125. ^ "Rotavirus Deaths & Rotavirus Vaccine Introduction Maps – ROTA Council". rotacouncil.org. Diarsipkan dari versi asli tanggal 12 July 2016. Diakses tanggal 29 July 2016. 
  126. ^ Moszynski P (2011). "GAVI rolls out vaccines against child killers to more countries". BMJ. 343: d6217. doi:10.1136/bmj.d6217. PMID 21957215. 
  127. ^ "Rotavirus vaccination programme for infants". www.gov.uk. Public Health England. 26 July 2013. 
  128. ^ "Rotavirus gastroenteritis". Advances in Therapy. 22 (5): 476–87. 2005. doi:10.1007/BF02849868. PMID 16418157. 
  129. ^ "Use of formative research in developing a knowledge translation approach to rotavirus vaccine introduction in developing countries". BMC Public Health. 7: 281. 2007. doi:10.1186/1471-2458-7-281. PMC 2173895alt=Dapat diakses gratis. PMID 17919334. 
  130. ^ "Rotavirus and severe childhood diarrhea". Emerging Infectious Diseases. 12 (2): 304–6. 2006. doi:10.3201/eid1202.050006. PMC 3373114alt=Dapat diakses gratis. PMID 16494759. 
  131. ^ "Rotavirus vaccines and health care utilization for diarrhea in the United States (2007-2011)". Pediatrics. 134 (1): 15–23. July 2014. doi:10.1542/peds.2013-3849. PMID 24913793. 
  132. ^ "2008 estimate of worldwide rotavirus-associated mortality in children younger than 5 years before the introduction of universal rotavirus vaccination programmes: a systematic review and meta-analysis". The Lancet Infectious Diseases. 12 (2): 136–41. 2012. doi:10.1016/S1473-3099(11)70253-5. PMID 22030330. 
  133. ^ "Economics of rotavirus gastroenteritis and vaccination in Europe: what makes sense?". Pediatric Infectious Disease Journal. 25 (Suppl 1): S48–55. 2006. doi:10.1097/01.inf.0000197566.47750.3d. PMID 16397429. 
  134. ^ "Hospital admissions attributable to rotavirus infection in England and Wales". Journal of Infectious Diseases. 174 (Suppl 1): S12–8. 1996. doi:10.1093/infdis/174.Supplement_1.S12. PMID 8752285. 
  135. ^ "Temperature-dependent transmission of rotavirus in Great Britain and The Netherlands". Proceedings of the Royal Society B: Biological Sciences. 277 (1683): 933–42. 2010. doi:10.1098/rspb.2009.1755. PMC 2842727alt=Dapat diakses gratis. PMID 19939844. 
  136. ^ "Seasonality of rotavirus disease in the tropics: a systematic review and meta-analysis". International Journal of Epidemiology. 38 (6): 1487–96. 2009. doi:10.1093/ije/dyn260. PMC 2800782alt=Dapat diakses gratis. PMID 19056806. 
  137. ^ "Seasonality and diversity of Group A rotaviruses in Europe". Acta Paediatrica. 88 (Suppl 426): 14–9. 1999. doi:10.1111/j.1651-2227.1999.tb14320.x. PMID 10088906. 
  138. ^ "Control of the spread of viruses in a long-term care facility using hygiene protocols". American Journal of Infection Control. 43 (7): 702–6. 2015. doi:10.1016/j.ajic.2015.03.012. PMID 25944726. 
  139. ^ "A community waterborne gastroenteritis outbreak: evidence for rotavirus as the agent". American Journal of Public Health. 74 (3): 263–5. 1984. doi:10.2105/AJPH.74.3.263. PMC 1651463alt=Dapat diakses gratis. PMID 6320684. 
  140. ^ "Mutated G4P[8] rotavirus associated with a nationwide outbreak of gastroenteritis in Nicaragua in 2005". Journal of Clinical Microbiology. 45 (3): 990–7. 2007. doi:10.1128/JCM.01992-06. PMC 1829148alt=Dapat diakses gratis. PMID 17229854. 
  141. ^ "An outbreak of rotavirus diarrhea among a non-immune, isolated South American Indian community". American Journal of Epidemiology. 113 (6): 703–10. 1981. doi:10.1093/oxfordjournals.aje.a113151. PMID 6263087. 
  142. ^ "Waterborne outbreak of rotavirus diarrhea in adults in China caused by a novel rotavirus". The Lancet. 323 (8387): 1139–42. 1984. doi:10.1016/S0140-6736(84)91391-6. PMID 6144874. 
  143. ^ "Investigation of an outbreak of adult diarrhea rotavirus in China". Journal of Infectious Diseases. 160 (6): 948–53. 1989. doi:10.1093/infdis/160.6.948. PMID 2555422. 
  144. ^ "Group B rotaviruses similar to strain CAL-1, have been circulating in Western India since 1993". Epidemiology and Infection. 132 (4): 745–9. 2004. doi:10.1017/S0950268804002171. PMC 2870156alt=Dapat diakses gratis. PMID 15310177. 
  145. ^ "Genetic analysis of group B human rotaviruses detected in Bangladesh in 2000 and 2001". Journal of Medical Virology. 72 (1): 149–55. 2004. doi:10.1002/jmv.10546. PMID 14635024. 
  146. ^ "Seroepidemiology of adult diarrhea rotavirus in China, 1977 to 1987". Journal of Clinical Microbiology. 27 (10): 2180–3. 1989. PMC 266989alt=Dapat diakses gratis. PMID 2479654. 
  147. ^ "First detection of group C rotavirus in children with acute gastroenteritis in South Korea". Clinical Microbiology and Infection. 17 (2): 244–7. 2011. doi:10.1111/j.1469-0691.2010.03270.x. PMID 20491826. 
  148. ^ a b "Zoonotic aspects of rotaviruses". Veterinary Microbiology. 140 (3–4): 246–55. 2010. doi:10.1016/j.vetmic.2009.08.028. PMID 19781872. 
  149. ^ "Rotaviruses: diversity and zoonotic potential—a brief review". Berliner und Munchener Tierarztliche Wochenschrift. 120 (3–4): 108–12. 2007. PMID 17416132. 
  150. ^ "The zoonotic potential of rotavirus". The Journal of Infection. 48 (4): 289–302. 2004. doi:10.1016/j.jinf.2004.01.018. PMID 15066329. 
  151. ^ "Zoonotic transmission of rotavirus: surveillance and control". Expert Review of Anti-infective Therapy. 13 (11): 1337–50. 2015. doi:10.1586/14787210.2015.1089171. PMID 26428261. 
  152. ^ "Studies on Epidemic Diarrhea of the New-born: Isolation of a Filtrable Agent Causing Diarrhea in Calves". American Journal of Public Health and the Nation's Health. 33 (12): 1451–4. 1943. doi:10.2105/AJPH.33.12.1451. PMC 1527675alt=Dapat diakses gratis. PMID 18015921. 
  153. ^ "Diarrhea in gnotobiotic calves caused by the reovirus-like agent of human infantile gastroenteritis" (PDF). Infection and Immunity. 14 (2): 471–4. 1976. PMC 420908alt=Dapat diakses gratis. PMID 184047. 
  154. ^ "The growth of the virus of epidemic diarrhoea of infant mice (EDIM) in organ cultures of intestinal epithelium". British Journal of Experimental Pathology. 52 (4): 442–5. 1971. PMC 2072337alt=Dapat diakses gratis. PMID 4998842. 
  155. ^ a b "Morphological and antigenic relationships between viruses (rotaviruses) from acute gastroenteritis in children, calves, piglets, mice, and foals" (PDF). Infection and Immunity. 14 (3): 804–10. 1976. PMC 420956alt=Dapat diakses gratis. PMID 965097. 
  156. ^ a b "The rotaviruses". Archives of Virology. 57 (1): 1–23. 1978. doi:10.1007/BF01315633. PMID 77663. 
  157. ^ "Relation between viruses from acute gastroenteritis of children and newborn calves". The Lancet. 304 (7872): 61–3. 1974. doi:10.1016/S0140-6736(74)91631-6. PMID 4137164. 
  158. ^ Matthews RE (1979). "Third report of the International Committee on Taxonomy of Viruses. Classification and nomenclature of viruses". Intervirology. 12 (3–5): 129–296. doi:10.1159/000149081. PMID 43850. 
  159. ^ "The antigenic diversity of rotaviruses: significance to epidemiology and vaccine strategies". European Journal of Epidemiology. 4 (1): 1–11. 1988. doi:10.1007/BF00152685. PMID 2833405. 
  160. ^ "Sequential passages of human rotavirus in MA-104 cells". Microbiology and Immunology. 25 (10): 1025–35. 1981. doi:10.1111/j.1348-0421.1981.tb00109.x. PMID 6273696. 
  161. ^ "Rotarix: a rotavirus vaccine for the world". Clinical Infectious Diseases. 48 (2): 222–8. 2009. doi:10.1086/595702. PMID 19072246. 

Pranala luar

Klasifikasi
Sumber luar