CRISPR

Dari Wikipedia bahasa Indonesia, ensiklopedia bebas
Lompat ke: navigasi, cari
Diagram mekanisme pertahanan antiviral prokariota CRISPR.[1]

CRISPR (Bahasa Inggris: Clustered regularly interspaced short palindromic repeats, dilafalkan crisper[2]) adalah bagian dari DNA prokariota yang mengandung urutan dasar pendek, berulang. Dalam suatu pengulangan palindrom, urutan nukleotida adalah sama dalam kedua arah. Setiap pengulangan diikuti oleh bagian pendek DNA pengatur jarak dari paparan sebelumnya oleh DNA asing (yakni suatu virus atau plasmid).[3] Kelompok kecil dari gen cas (CRISPR-associated system) terletak di samping urutan CRISPR.

CRISPR/sistem Cas adalah suatu sistem kekebalan prokariota yang memberikan perlawanan terhadap elemen genetik asing seperti yang hadir dalam plasmid dan bakteriofag[4][5][6] yang menyediakan bentuk sistem kekebalan tiruan. RNA menyimpan urutan pengatur jarak yang membantu protein Cas mengenali dan memotong DNA eksogen. Protein Cas yang dipandu RNA lainnya memotong RNA asing.[7] CRISPR ditemukan dalam sekitar 40% dari genom bakteri yang telah disekuensing dan 90% arkea yang telah disekuensing.[8][note 1]

Versi sederhana CRISPR/Cas yang disebut CRISPR/Cas9 telah digunakan untuk memodifikasi genom. Genom sel dapat dipotong ke tempat yang diinginkan, sehingga gen yang ada dapat dihilangkan dan yang baru ditambahkan.[9][10][11] Teknik ini dapat digunakan untuk berbagai macam hal, dari kedokteran hingga peningkatan mutu bibit.[12][13]

Lihat juga[sunting | sunting sumber]

Catatan[sunting | sunting sumber]

  1. ^ 71/79 Archaea, 463/1008 Bacteria CRISPRdb, Date: 19.6.2010 Archived May 16, 2015, at the Wayback Machine.

Referensi[sunting | sunting sumber]

  1. ^ Horvath P, Barrangou R (January 2010). "CRISPR/Cas, the immune system of bacteria and archaea". Science 327 (5962): 167–70. Bibcode:2010Sci...327..167H. PMID 20056882. doi:10.1126/Science.1179555. 
  2. ^ Sawyer E (9 February 2013). "Editing Genomes with the Bacterial Immune System". Scitable. Nature Publishing Group. Diakses tanggal 6 April 2015. 
  3. ^ Marraffini LA, Sontheimer EJ (March 2010). "CRISPR interference: RNA-directed adaptive immunity in bacteria and archaea". Nature Reviews Genetics 11 (3): 181–90. PMC 2928866. PMID 20125085. doi:10.1038/nrg2749. 
  4. ^ Redman M, King A, Watson C, King D (August 2016). "What is CRISPR/Cas9?". Archives of Disease in Childhood. Education and Practice Edition 101 (4): 213–5. PMID 27059283. doi:10.1136/archdischild-2016-310459. 
  5. ^ Barrangou R, Fremaux C, Deveau H, Richards M, Boyaval P, Moineau S, Romero DA, Horvath P (March 2007). "CRISPR provides acquired resistance against viruses in prokaryotes". Science 315 (5819): 1709–12. Bibcode:2007Sci...315.1709B. PMID 17379808. doi:10.1126/science.1138140.  (perlu mendaftar)
  6. ^ Marraffini LA, Sontheimer EJ (December 2008). "CRISPR interference limits horizontal gene transfer in staphylococci by targeting DNA". Science 322 (5909): 1843–5. Bibcode:2008Sci...322.1843M. PMC 2695655. PMID 19095942. doi:10.1126/science.1165771. 
  7. ^ Mohanraju P, Makarova KS, Zetsche B, Zhang F, Koonin EV, van der Oost J (2016). "Diverse evolutionary roots and mechanistic variations of the CRISPR-Cas systems". Science 353 (6299): aad5147. PMID 27493190. doi:10.1126/science.aad5147. 
  8. ^ Grissa I, Vergnaud G, Pourcel C (May 2007). "The CRISPRdb database and tools to display CRISPRs and to generate dictionaries of spacers and repeats". BMC Bioinformatics 8: 172. PMC 1892036. PMID 17521438. doi:10.1186/1471-2105-8-172. 
  9. ^ Ledford, Heidi (3 June 2015). "CRISPR, the disruptor". News Feature. Nature 522 (7554). 
  10. ^ Snyder B (21 August 2014). "New technique accelerates genome editing process". research news @ Vanderbilt. Nashville, Tennessee: Vanderbilt University. 
  11. ^ Hendel A, Bak RO, Clark JT, Kennedy AB, Ryan DE, Roy S, Steinfeld I, Lunstad BD, Kaiser RJ, Wilkens AB, Bacchetta R, Tsalenko A, Dellinger D, Bruhn L, Porteus MH (September 2015). "Chemically modified guide RNAs enhance CRISPR-Cas genome editing in human primary cells". Nature Biotechnology 33 (9): 985–9. PMC 4729442. PMID 26121415. doi:10.1038/nbt.3290. 
  12. ^ Ledford H (March 2016). "CRISPR: gene editing is just the beginning". Nature 531 (7593): 156–9. PMID 26961639. doi:10.1038/531156a. 
  13. ^ Maxmen A (August 2015). "The Genesis Engine". WIRED. Diakses tanggal 2016-06-05. 

Bacaan lebih lanjut[sunting | sunting sumber]

Pranala luar[sunting | sunting sumber]