Bernd Michael Rode

Bernd Michael Rode

Bernd Michael Rode (lahir 14 Juli 1946) adalah Profesor bidang Kimia berkebangsaan Austria di University of Innsbruck dan pendiri dari Austrian-South-East-Asian Academic University Network (ASEA-UNINET). Prof Rode sudah pensiun pada tahun 2011, namun sampai saat ini dia masih aktif dalam melakukan pengajaran, penelitian dan pembimbingan mahasiswa.

Biografi

Pada tahun 1964 Bernd Michael Rode lulus dari Akademisches Gymnasium Innsbruck (setara SMA) dan memulai studi bidang Kimia di University of Innsbruck. Pada tahun 1973 ia menerima gelar Ph.D. gelar dalam Kimia dengan predikat sub auspiciis praesidentis dari universitas yang sama.

Pada tahun yang sama, Prof. Rode memulai kariernya sebagai Asisten Profesor di Institut Anorganik dan Kimia Analitik di University of Innsbruck. Setelah sempat melakukan penelitian tamu di Jerman (University of Stuttgart dan University of Karlsruhe), dia diangkat menjadi Associate Professor pada tahun 1976. Prof. Rode kemudian diangkat menjadi Professor di dalam Institut Kimia Anorganik dan Teoretis di University of Innsbruck pada tahun 1979 setelah pada tahun sebelumnya melaksanakan 1 tahun penelitian tamu di University of Tokyo. Pada tahun 2006-2011 dia menjabat sebagai kepala Departemen Kimia Teoretis dan juga merangkap sebagai kepala Institute for General Inorganic and Theoretical Chemistry di University of Innsbruck.

Salah satu pencapaian terbesar dari Prof. Rode adalah pembentukan jaringan universitas ASEA-UNINET (Austrian South East Asian University Partnership Network) pada tahun 1994. Fondasi dari jaringan ini dibentuk dari kontak informal antara University of Innsbruck dan beberapa universitas di Thailand pada akhir dekade 1970. Pada dekade berikutnya (1980), kerjasama antara University of Innsbruck, University of Vienna, University of Agricultural Vienna, Chulalongkorn University, Mahidol University, Kasetsart Unviersity dan Chiang Mai University secara resmi ditandatangani. Untuk memperluas target kerjasama bilateral tersebut menuju kerjasama multilateral, Prof. Rode mengundang universitas-universitas dari Austria, Indonesia, Thailand dan Vietnam untuk berpartisipasi di dalam ASEA-UNINET Plenary Meeting yang pertama di Ho Chi Minh City, Vietnam pada bulan Desember 1994. Di dalam pertemuan tersebut, jaringan yang terbentuk terdiri atas 25 universitas dari Austria, Thailand, Indonesia dan Vietnam. Sampai dengan Juni 2014, tercatat lebih dari 70 universitas dari 16 negara di eropa dan asia tenggara berpartisipasi di dalam jaringan ASEA-UNINET.

Selain dari aktivitasnya di dunia ilmiah dan jaringan universitas, Prof. Rode menerima amanah menjadi wakil presiden dari United Nations Comission on Science and Technology for Development (UNCSTD) periode 1998-2001 dan 2005-2008, mewakili Uni Eropa, Amerika Serikat, Kanada dan Australia. Pada tahun 2004, dia menjadi orang Austria pertama yang menjadi Presiden dari UNCSTD tersebut.

Penghargaan

Prof. Rode mendapatkan berbagai penghargaan atas komitmennya kepada Negara-negara di asia. Beberapa di antara penghargaan tersebut adalah gelar Doktor Honoris Causa dari Chulalongkorn Unviersity, Bangkok (1995), King Mongkut’s Institute of Technology, Ladkrabang, Bangkok (1998) dan Universitas Gadjah Mada, Jogjakarta (2000). Pada tahun 2007, dia mendapatkan gelar Knight Grand Cross (First Class) dari Raja Thailand, penghargaan tertinggi dari Kerajaan Thailand, untuk aktivitas dan pencapaiannya untuk memperkuat kolaborasi ilmiah antara eropa dan asia. Pada tahun 2008, Cornelius University Bratislava memberikan gelar Doktor Honoris Causa untuk penemuannya di dalam studi kimia kuantum terkait dengan molecule and super molecule systems of ion solvation and molecular modelling of biomolecules and medicaments.

Daftar penghargaan dan tanda jasa penting

• 1985 Goldenes Ehrenzeichen, Republik Austria
• 1994 Austrian Decoration for Science and Art, Republik Austria
• 1997 Honorary Member, Asosiasi Kimia Slowakia
• 2003 Cross of Merits, Negara bagian Tyrol, Austria
• 2004 Cross of Merits, Austria
• 2007 Cross of Honours in Science and Arts first class, Republik Austria
• 2008 Jan-Weber-Medal of the Slovak Pharmaceutical Society
• 2010 Sitara-e-Qaid-i-Azam, Tanda jasa dari Pemerintah Pakistan
• 2011 Knight Grand Cross (First Class of the The Most Exalted Order of the White Elephant), Kerajaan Thailand

Berdasarkan Theoretical Chemistry Genealogy Project, Bernd Michael Rode adalah adalah pembimbing mahasiswa doctor yang paling sukses di antara Negara-negara berbahasa jerman untuk bidang kimia teoretis. Dalam kurun waktu 35 tahun (1976-2011), dia sukses membimbing tidak kurang dari 62 mahasiswa dalam menyelesaikan studi doktornya. Banyak di antara mahasiswa tersebut yang berasal dari Asia tenggara karena kedekatannya dengan Negara-negara di area tersebut.

Aktivitas Riset

Pencapaian ilmiah dari Prof. Rode tertuang di dalam 7 buah buku (monograph), lebih dari 440 publikasi jurnal internasional dan 30 buku bersama. Berdasarkan ISI Thomson’s Web of Science citation report, kontribusi ilmiah dari Prof. Rode dikutip lebih dari 8300 kali (per Mei 2014) dengan Hirsch-index 41.

Fokus bidang penelitian dari Prof Rode adalah Kimia Teoretis dan Komputasi serta Kimia Bioanorganik. Secara rinci publikasi Prof Rode menekankan pada aspek-aspek berikut:

• Perhitungan kimia kuantum untuk sistem molekuler dan supermoleculer
• Simulasi Ab initio Monte Carlo dan simulasi Dinamika Molekuler untuk sistem cairan / pelarut,
• Struktur larutan elektrolit,
• Kajian Ultrafast Dinamika zat terlarut,
• Pemodelan biomolekul dan obat-obatan,
• QSAR / QSPR,
• Evolusi peptida / protein dan Asal usul kehidupan

Kimia Teoretis

Contoh dari simulasi hybrid QM/MM Sn(II) encer yang dilakukan oleh Rode et al. Atom oksigen dari molekul pertama ditampilkan dalam warna merah. Pengaruh dari pasangan elektron tunggal dari Sn (II) pada struktur hidrasi terlihat jelas .

Walaupun kegiatan penelitian awal Prof Rode bergerak di bidang kimia anorganik, dia kemudian mengembangkan keahliannya pada bidang kimia teoretis dan komputasi yang saat ini sedang berkembang sangat pesat. Kebanyakan dari penelitian Prof. Rode pada awalnya difokuskan pada perhitungan kimia kuantum dari berbagai sistem kimia. Akan tetapi, belakangan ini penelitian dia lebih difokuskan pada penerapan teknik simulasi kimia seperti Monte-Carlo (MC) dan Dinamika Molekuler (MD), terutama dalam konteks kimia larutan.

Kontribusi penting dari penelitian yang telah dilakukan oleh Prof Rode adalah pengembangan dan penerapan teknik simulasi hibrida mekanik kuantum/mekanika molekuler (QM / MM) yang berfokus pada kimia larutan. Pada tahun 2004 teknik QM/MM berhasil ditingkatkan menjadi teknik simulasi baru yang dikenal sebagai Mekanika Kuantum Medan Muatan (QMCF) Dinamika Molekuler (MD) yang secara eksplisit ditujukan untuk penelitian sistem terlarut telah dikembangkan sebelumnya oleh kelompok penelitian Prof Rode. Akhir-akhir ini penerapan teknik simulasi QMCF MD memungkinkan simulasi yang akurat untuk ion dan spesies organik serta kompleks koordinasi dalam larutan berair.

Kimia Evolusi

Selain fokus pada bidang kimia teoretis dan komputasi, Prof Rode juga melakukan penelitian di bidang bioanorganik, terutama kajian abiogenesis. Pada akhir tahun 1980-an, Prof Rode bersama rekan-rekannya menemukan reaksi pembentukan peptida dengan menginduksikan garam (SIPF) sebagai rute sintesis sederhana dari peptida menggunakan monomor asam amino dalam kondisi prebiotik. Selain menggunakan enzim sebagai katalis, reaksi SIPF menggunakan logam transisi yang bertindak sebagai katalis untuk mendorong pembentukan peptida pada kondisi larutan NaCl konsentrasi tinggi dan tembaga (II) yang mana menunjukkan aktivitas katalitik tertinggi. Biasanya, eksperimen mengenai siklus penguapan telah dilakukan untuk meniru siklus penguapan pada siang atau malam hari di pantai dan di laguna sehingga menghasilkan larutan super jenuh. Karena solusi super jenuh ini memiliki kecenderungan untuk melarut dengan sendirinya, maka termodinamika dan kinetika reaksi yang tidak menguntungkan pembentukan peptida dapat terjadi. Penelitian yang dilakukan oleh Prof Rode menyelidiki sifat-sifat reaksi SIPF dalam berbagai kondisi, terutama menekankan pada kemungkinan hubungan sifat-sifat reaksi SIPF tersebut dengan biohomochirality. Lebih lanjut, Prof Rode juga melakukan percobaan Miller-Urey, yang mana memasukkan pandangan baru tentang komposisi udara primordial. Hal ini menunjukkan bahwa peptida juga bisa terbentuk dalam suasana udara netral (CO2/N2/H2O) akibat adanya debit listrik.

Molvision®

Logo Molvision®

Bersama dengan mahasiswa S3 dia,Hung Tran Tung, Prof Rode mengembangkan software visualisasi Molvision yang praktis dan fleksibel dan mampu secara interaktif menganalisis data simulasi dinamis. Pada tahun 2003 Dr Tran dianugerahi penghargaan European Innovation Award atas pengembangan program ini.

Publikasi Pilihan

• Hofer, Thomas; Pribil, Andreas; Randolf, Bernhard; Rode, Bernd M. (2005); "Structure and dynamics of solvated Sn(II) in aqueous solution - an ab initio QM/MM MD approach", J. Am. Chem. Soc. 2005, 127(41), p. 14231-14238. DOI:10.1021/ja052700f.
• Tongraar, A.; Liedl, K. R.; Rode, Bernd M. (1997);"Solvation of Ca2+ In Water Studied By Born-Oppenheimer Ab-Initio QM/MM Dynamics"; J. Phys. Chem. A 1997, 101(35), p. 6299-6309,DOI: 10.1021/jp970963t.
• Rode, Bernd M.; Schwenk, Christian F., Tongraar, Anan (2004); "Structure and Dynamics of Hydrated Ions - New Insights through Quantum Cechanical Simulation"; J. Mol. Liq. 2004, 110(1-3), p. 105-122. DOI: 10.1016/j.molliq.2003.09.016.
• Rode, Bernd M.; Schwenk, Christian; Hofer, Thomas; Randolf, Bernhard (2005); "Coordination and ligand exchange dynamics of solvated metal ions"; Coord. Chem. Rev. 2005, 249(24), p. 2993-3006. DOI: doi:10.1016/j.ccr.2005.03.032.
• Rode, Bernd M.; Hofer, Thomas (2006); "How to Access Structure and Dynamics of Solutions: The Capabilities of Computational Methods", Pure Appl. Chem. 2006, 78(3), p. 525-539. DOI: 10.1351/pac200678030525.
• Rode, Bernd M.; Hofer, Thomas; Randolf, Bernhard; Schwenk, Christian; Xenides, Demetrios; Vchirawongkwin, Viwat(2006); "Ab initio Quantum Mechanical Charge Field (QMCF) Molecular Dynamics - A QM/MM - MD Procedure for Accurate Simulations of Ions and Complexes"; Theor. Chem. Acc. 2006, 115(2-3), p. 77-85. DOI: 10.1007/s00214-005-0049-1.
• Hofer, Thomas S.; Randolf, Bernhard R.; Rode, Bernd M. (2008); "Molecular Dynamics Simulation Methods including Quantum Effects"; In: Solvation Effects on Molecules and Biomolecules, Canuto, Sylvio (Eds.), ISBN 978-1-4020-8269-6, Springer, Heidelberg 2008, p. 247-278.
• Rode,Bernd M.; Hofer, Thomas S.; Pribil, Andreas B.; Randolf, Bernhard R. (2010); "Simulations of Liquids and Solutions Based on Quantum Mechanical Forces"; In: Theoretical and Computational Inorganic Chemistry, van Eldik, Rudi; Harvey, Jeremy (Eds.), ISBN 978-0-12-380874-5, Elsevier, Amsterdam 2010,p. 143-175.
• Hofer, Thomas S.; Pribil, Andreas B.; Randolf, Bernhard R.; Rode, Bernd M.; "Ab Initio Quantum Mechanical Charge Field Molecular Dynamics - A Nonparametrized First-Principle Approach to Liquids and Solutions"; In: Advances in Quantum Chemistry, Sabin, John R.; Brändas, Erkki (Eds.), ISBN 978-0-12-380898-1, Elsevier, Amsterdam 2010, 213-246.
• Lutz, Oliver M. D.; Messner, Christoph B.; Hofer, Thomas S.; Glätzle, Matthias; Huck, Christian W.; Bonn, Günther K.; Rode, Bernd M.; "Combined Ab Initio Computational and Infrared Spectroscopic Study of the cis- and trans-Bis(glycinato)copper(II) Complexes in Aqueous Environment"; J. Phys. Chem. Lett. 2013, 4, p. 1502-1506. DOI: 10.1021/jz400288c.
• Jakschitz, Thomas; Fitz, Daniel; Rode, Bernd Michael (2012); "The origin of first peptides on earth: from amino acids to homochiral biomolecules"; In: Genesis - In The Beginning, Joseph Seckbach (Edp.), ISBN 978-94-007-2940-7, Springer, Dordrecht 2012, p. 469-489.
• Schwendinger, M. G.; Rode, Bend M.(1998); "Possible Role of Copper and Sodium Chloride in Prebiotic Evolution of Peptides"; Anal. Sci. 1989, 5(4), p. 411-414. DOI: 10.2116/analsci.5.411.
• Schwendinger, M. G.; Rode, Bend M. (1990); "Copper-Catalyzed Amino Acid Condensation in Water - A Simple Possible Way of Prebiotic Peptide Fromation"; Origins Life Evol. Biosphere 1990, 20(5), p. 401-410. DOI: 10.1007/BF01808134.
• Rode, Bernd M.; Plankensteiner, Kristof (2013); "Prebiotic Peptides",; In: Handbook of Biologically Active Peptides, Second Edition, Abba J. Kastin (Eds.), ISBN 978-0-12-385095-9, Elsevier, Amsterdam 2013, p. 1899-1903.
• Jakschitz, Thomas A.; Rode, Bernd M. (2012); "Chemical Evolution from simple inorganic compounds to chiral peptides"; Chem. Soc. Rev. 2012, 41(16), p. 5484-5489. DOI: 10.1039/C2CS35073D.
• Fitz, Daniel; Jakschitz, Thomas; Rode, Bernd M. (2011); "Salt-Induced Peptide Formation in Chemical Evolution: Building Blocks Before RNA - Potential of Peptide Splicing Reactions"; In: Origins of Life: The Primal Self-Organization, Egel, Richard; Lankenau, Dirk-Henner; Mulkidjanian, Armen Y. (Eds.), ISBN 978-3-642-21624-4, Springer, Heidelberg, Berlin 2011, p. 109-127.
• Fitz, Daniel; Reiner, Hannes; Rode, Bernd M. (2007); "Chemical evolution toward the origin of life"; Pure Appl. Chem. 2007, 79(12), p. 2101–2117. DOI: 10.1351/pac200779122101.
• Plankensteiner, Kristof; Reiner, Hannes; Schranz, Benjamin; Rode, Bernd M. (2004); "Prebiotic formation of amino acids in a neutral atmosphere by electric discharge"; Angew. Chem., Int. Ed. 2004, 43, p. 1886-1888. DOI: 10.1002/anie.200353135.

Publikasi Bersama Dosen Kimia UGM

• Pranowo, H. D., & Rode, B. M. (1999). Solvation of Cu2+ in liquid ammonia: Monte Carlo simulation including three-body corrections. The Journal of Physical Chemistry A, 103(21), 4298-4302.
• Pranowo, H. D., Bambang Setiaji, A. H., & Rode, B. M. (1999). cu+ in liquid ammonia and in water: intermolecular potential function and monte carlo simulation. The Journal of Physical Chemistry A, 103(50), 11115-11120.
• Pranowo, H. D., & Rode, B. M. (2001). Preferential Cu< sup> 2+ solvation in aqueous ammonia solution of various concentrations. Chemical Physics, 263(1), 1-6.
• Pranowo, H. D., & Rode, B. M. (2000). Simulation of preferential Cu2+ solvation in aqueous ammonia solution by means of Monte Carlo method including three-body correction terms. Journal of Chemical Physics, 112(9), 4212-4215.
• Armunanto, R., Schwenk, C. F., & Rode, B. M. (2003). Structure and dynamics of hydrated Ag (I): Ab initio quantum mechanical-molecular mechanical molecular dynamics simulation. The Journal of Physical Chemistry A, 107(17), 3132-3138.
• Armunanto, R., Schwenk, C. F., Tran, H. T., & Rode, B. M. (2004). Structure and dynamics of Au+ ion in aqueous solution: ab initio QM/MM MD simulations. Journal of the American Chemical Society, 126(8), 2582-2587.
• Armunanto, R., Schwenk, C. F., Bambang Setiaji, A. H., & Rode, B. M. (2003). Classical and QM/MM molecular dynamics simulations of Co2+ in water. Chemical physics, 295(1), 63-70
• Armunanto, R., Schwenk, C. F., & Rode, B. M. (2004). Gold (I) in liquid ammonia: ab initio QM/MM molecular dynamics simulation. Journal of the American Chemical Society, 126(32), 9934-9935.
• Armunanto, R., Schwenk, C. F., Randolf, B. R., & Rode, B. M. (2004). Ag (I) ion in liquid ammonia. Chemical physics letters, 388(4), 395-399.
• Armunanto, R., Schwenk, C. F., Randolf, B. R., & Rode, B. M. (2004). Structure and dynamics of Co2+ in liquid ammonia: ab initio QM/MM molecular dynamics simulation. Chemical physics, 305(1), 135-140.

Pranala luar

• Institute of General, Inorganic and Theoretical Chemistry, University of Innsbruck: CV Prof. Bernd Michael Rode
• Curriculum Vita - Prof. Bernd Michael Rode, on the Website of the Theoretical Chemistry Genealogy Project, University of Hannvoer
• Homepage - Austrian South East Asian University Partnership Networks (ASEA-UNINET)
• Theoretical Chemistry Genealogy Project
• MOLVISION - Visualization of Chemical Systems
• APA - Austrian Press Agency: "Hochleistungscomputer für indonesische Partneruniversität", published on April, 2nd 2014. Retrieved on May, 23rd 2014
• Website of Dr. Heinz Fischer, President of Austria: "Wissenschaftstag" in Ho-Chi-Minh-Stadt, dem früheren Saigon" Diarsipkan 2015-09-23 di Wayback Machine. published by Austrian Press Agency (APA), on May, 31st 2012, retrieved on June, 19th 2014.