Ralstonia eutropha: Perbedaan antara revisi

← Revisi sebelumnya Revisi selanjutnya →

Konten dihapus Konten ditambahkan

Sebaris

Revisi per 7 April 2014 15.09

Ralstonia eutropha (disingkat R. eutropha), yang kini dikenal sebagai Cupriavidus necator, adalah sebuah bakteri Gram negatif yang tergolong dalam kelas beta-proteobakteria. Bakteri ini merupakan organisme model untuk mempelajari metabolisme polihidroksi alkanoat.

Deskripsi dan Taksonomi

R. eutropha termasuk dalam kelas betaproteobacteria dan telah beberapa kali mengalami pergantian nama. Pada awalnya R. eutropha disebut sebagai Alcaligenes eutrophus, kini bakteri tersebut ditetapkan dengan nama Cupriavidus necator^[1].

R. eutropha merupakan bakteri Gram negatif berbentuk batang dengan flagella yang berbentuk peritrikus. R. eutropha mempunyai aktivitas katalase dan oksidase. Bakteri ini tahan terhadap berbagai ion logam dan mampu menggunakan beberapa asam amino sebagai sumber karbon dan nitrogen tunggal. Konten basa Guanin dan Sitosin pada bakteri dalam genus Cupriavidus adallah sekitar 63 sampai 69 mol%. R. eutropha adalah jenis bakteri yang umum ditemukan di tanah ^[2].

Kemampuan Metabolisme

R. eutropha adalah termasuk bakteri litoautotrof yang mampu mengoksidasi gas hidrogen^[3]. Bakteri ini dapat hidup sebagai autotrof maupun heterotrof^[3]. Oleh bakteri ini, baik gas hidrogen maupun molekul organik dapat digunakan sebagai sumber energi^[3]. Sebagai autotrof, bakteri ini dapat mengikat karbon dioksida melalui jalur pentosa-fosfat, dan sebagai heterotrof, molekul organik dapat dilebur melalui siklus Krebs^[4]. Terlebih lagi, R. eutropha memiliki kemampuan untuk memecah senyawa aromatik, hal ini memberikan potensi kepada R. eutropha dalam aplikasi bioremediasi^[5]. Terlebih lagi, untuk mempelajari metabolisme R. eutropha secara mendalam, genom R. eutropha galur H16 telah diurutkan (di-Sequence) secara menyeluruh^[3]. Ukuran genom bakteri tersebut adalah sebesar 7.4 juta pasang basa^[3]. Genom terdiri dari dua kromosom dan satu megaplasmid^[3].

Referensi

^ (Inggris)Ramos JL, Levesque LC. (2006). Pseudomonas: Volume 4: Molecular Biology of Emerging Issues. Springer. ISBN 0306483785, 9780306483783.
^ (Inggris)Vandamme P, Coenye T. (2004). "Taxonomy of the genus Cupriavidus: a tale of lost and found". International journal of systematic and evolutionary microbiology. 54 (6): 2285–2289. doi:10.1099/ijs.0.63247-0. Diakses tanggal 6 April 2014.
^ ^a ^b ^c ^d ^e ^f (Inggris)Pohlmann A; et al. (2006). "Genome sequence of the bioplastic-producing "Knallgas" bacterium Ralstonia eutropha H16". Nature biotechnology. 24 (10): 1257–1262. doi:10.1038/nbt1244. Diakses tanggal 6 April 2014.
^ (Inggris)Cramm R (2009). "Genomic view of energy metabolism in Ralstonia eutropha H16". Journal of molecular microbiology and biotechnology. 16 (1-2): 38–52. doi:10.1159/000142893. Diakses tanggal 6 April 2014.
^ (Inggris)Lykidis A; et al. (2010). "The complete multipartite genome sequence of Cupriavidus necator JMP134, a versatile pollutant degrader". PloS one. 5 (3): e9729. doi:10.1371/journal.pone.0009729. Diakses tanggal 6 April 2014.

[A-1] (Inggris)Ramos JL, Levesque LC. (2006). Pseudomonas: Volume 4: Molecular Biology of Emerging Issues. Springer. ISBN 0306483785, 9780306483783.

[B-2] (Inggris)Vandamme P, Coenye T. (2004). "Taxonomy of the genus Cupriavidus: a tale of lost and found". International journal of systematic and evolutionary microbiology. 54 (6): 2285–2289. doi:10.1099/ijs.0.63247-0. Diakses tanggal 6 April 2014.

[C-3] ^ ^a ^b ^c ^d ^e ^f (Inggris)Pohlmann A; et al. (2006). "Genome sequence of the bioplastic-producing "Knallgas" bacterium Ralstonia eutropha H16". Nature biotechnology. 24 (10): 1257–1262. doi:10.1038/nbt1244. Diakses tanggal 6 April 2014.

[D-4] (Inggris)Cramm R (2009). "Genomic view of energy metabolism in Ralstonia eutropha H16". Journal of molecular microbiology and biotechnology. 16 (1-2): 38–52. doi:10.1159/000142893. Diakses tanggal 6 April 2014.

[E-5] (Inggris)Lykidis A; et al. (2010). "The complete multipartite genome sequence of Cupriavidus necator JMP134, a versatile pollutant degrader". PloS one. 5 (3): e9729. doi:10.1371/journal.pone.0009729. Diakses tanggal 6 April 2014.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

@@ Baris 27: / Baris 27: @@
  | url = http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/15545472
  | format =
- | accessdate =
+ | accessdate = 6 April 2014
  }}
 </ref>.
 ==Kemampuan Metabolisme==
+''R. eutropha'' adalah termasuk bakteri [[litoautotrof]] yang mampu meng[[oksidasi]] gas [[hidrogen]]<ref name="C">{{en}}{{cite journal
-''R. eutropha'' adalah bakteri [[litoautotrof]] yang mampu meng[[oksidasi]] gas [[hidrogen]]. Bakteri ini dapat hidup sebagai [[autotrof]] maupun [[heterotrof]].  Oleh bakteri ini, baik gas hidrogen maupun [[molekul organik]] dapat digunakan sebagai sumber [[energi]].  Sebagai autotrof, bakteri ini dapat mengikat [[karbon dioksida]] melalui [[jalur pentosa-fosfat]], dan sebagai heterotrof, molekul organik dapat dilebur melalui [[siklus Krebs]]. Terlebih lagi, ''R. eutropha'' memiliki kemampuan untuk memecah senyawa [[aromatik]], hal ini memberikan potensi kepada ''R. eutropha'' dalam aplikasi [[bioremediasi]].
+ | author = Pohlmann A, ''et al''.
-Terlebih lagi, untuk mempelajari metabolisme ''R. eutropha'' secara mendalam,  [[genom]] ''R. eutropha'' [[galur]] H16 telah diurutkan (di-[[Sequence]]) secara menyeluruh.  Ukuran genom bakteri tersebut adalah sebesar 7.4 juta pasang basa. Genom terdiri dari dua [[kromosom]] dan satu [[megaplasmid]].
+ | year = 2006
+ | month = April
+ | title = Genome sequence of the bioplastic-producing "Knallgas" bacterium Ralstonia eutropha H16
+ | journal = Nature biotechnology
+ | volume = 24
+ | issue = 10
+ | pages = 1257-1262
+ | doi =10.1038/nbt1244
+ | id =
+ | url = http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/16964242
+ | format =
+ | accessdate = 6 April 2014
+ }}
+</ref>. Bakteri ini dapat hidup sebagai [[autotrof]] maupun [[heterotrof]]<ref name="C"/>.  Oleh bakteri ini, baik gas hidrogen maupun [[molekul organik]] dapat digunakan sebagai sumber [[energi]]<ref name="C"/>.  Sebagai autotrof, bakteri ini dapat mengikat [[karbon dioksida]] melalui [[jalur pentosa-fosfat]], dan sebagai heterotrof, molekul organik dapat dilebur melalui [[siklus Krebs]]<ref name="D">{{en}}{{cite journal
+ | author = Cramm R
+ | year = 2009
+ | month = Oktober
+ | title = Genomic view of energy metabolism in ''Ralstonia eutropha'' H16.
+ | journal = Journal of molecular microbiology and biotechnology
+ | volume = 16
+ | issue = 1-2
+ | pages = 38-52
+ | doi =10.1159/000142893
+ | id =
+ | url = http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/18957861
+ | format =
+ | accessdate = 6 April 2014
+ }}
+</ref>. Terlebih lagi, ''R. eutropha'' memiliki kemampuan untuk memecah senyawa [[aromatik]], hal ini memberikan potensi kepada ''R. eutropha'' dalam aplikasi [[bioremediasi]]<ref name="E">{{en}}{{cite journal
+ | author = Lykidis A, ''et al''.
+ | year = 2010
+ | month = February
+ | title = The complete multipartite genome sequence of Cupriavidus necator JMP134, a versatile pollutant degrader
+ | journal = PloS one
+ | volume = 5
+ | issue = 3
+ | pages = e9729
+ | doi =10.1371/journal.pone.0009729
+ | id =
+ | url =http://www.pubmedcentral.nih.gov/articlerender.fcgi?artid=2842291&tool=pmcentrez&rendertype=abstract
+ | format =
+ | accessdate = 6 April 2014
+ }}
+</ref>.
+Terlebih lagi, untuk mempelajari metabolisme ''R. eutropha'' secara mendalam,  [[genom]] ''R. eutropha'' [[galur]] H16 telah diurutkan (di-''[[Sequence]]'') secara menyeluruh<ref name="C"/>.  Ukuran genom bakteri tersebut adalah sebesar 7.4 juta pasang basa<ref name="C"/>. Genom terdiri dari dua [[kromosom]] dan satu [[megaplasmid]]<ref name="C"/>.