RNA non-penyandi
RNA non-penyandi, RNA non-pengkode atau RNA non-kode (bahasa Inggris: non-coding RNA, ncRNA) adalah molekul RNA fungsional yang tidak ditranslasikan menjadi sebuah protein. Urutan DNA yang menjadi tempat RNA non-penyandi fungsional yang ditranskripsikan kerap dikenal sebagai sebuah gen RNA. Jenis-jenis RNA non-penyandi yang sering ditemui dan penting secara fungsional mencakup RNA transfer (tRNA) dan RNA ribosom (rRNA), beserta juga RNA-RNA kecil seperti RNA-mikro, siRNA, piRNA, snoRNA, snRNA, exRNA, scaRNA dan RNA non-penyandi panjang seperti Xist dan HOTAIR.
Jumlah RNA non-kode di dalam genom manusia masih belum diketahui; namun studi-studi bioinformatika dan transkriptomik terkini menyarankan bahwa terdapat ribuan transkrip-transkrip non-penyandi.[1][2][3][4][5][6] Banyak dari ncRNA yang baru diidentifikasi memiliki fungsi yang belum diketahui, bila ada.[7] Tidak ada konsensus mengenai seberapa banyak transkripsi non-penyandi yang fungsional: beberapa ahli yakin bahwa kebanyakan ncRNA adalah "RNA sampah" yang non-fungsional, transkripsi palsu,[8][9] sementara ahli-ahli lainnya menduga bahwa banyak transkrip non-penyandi memiliki fungsi yang belum ditemukan.[10][11]
Referensi
[sunting | sunting sumber]- ^ Cheng J, Kapranov P, Drenkow J, Dike S, Brubaker S, Patel S, et al. (May 2005). "Transcriptional maps of 10 human chromosomes at 5-nucleotide resolution". Science. 308 (5725): 1149–1154. Bibcode:2005Sci...308.1149C. doi:10.1126/science.1108625. PMID 15790807. S2CID 13047538.
- ^ Thind AS, Monga I, Thakur PK, Kumari P, Dindhoria K, Krzak M, et al. (November 2021). "Demystifying emerging bulk RNA-Seq applications: the application and utility of bioinformatic methodology". Briefings in Bioinformatics. 22 (6). doi:10.1093/bib/bbab259. PMID 34329375.
- ^ Washietl S, Pedersen JS, Korbel JO, Stocsits C, Gruber AR, Hackermüller J, et al. (June 2007). "Structured RNAs in the ENCODE selected regions of the human genome". Genome Research. 17 (6): 852–864. doi:10.1101/gr.5650707. PMC 1891344. PMID 17568003.
- ^ Morris KV, ed. (2012). Non-coding RNAs and Epigenetic Regulation of Gene Expression: Drivers of Natural Selection. Caister Academic Press. ISBN 978-1-904455-94-3.
- ^ Shahrouki P, Larsson E (2012). "The non-coding oncogene: a case of missing DNA evidence?". Frontiers in Genetics. 3: 170. doi:10.3389/fgene.2012.00170. PMC 3439828. PMID 22988449.
- ^ van Bakel H, Nislow C, Blencowe BJ, Hughes TR (May 2010). Eddy SR (ed.). "Most "dark matter" transcripts are associated with known genes". PLOS Biology. 8 (5): e1000371. doi:10.1371/journal.pbio.1000371. PMC 2872640. PMID 20502517.
- ^ Hüttenhofer A, Schattner P, Polacek N (May 2005). "Non-coding RNAs: hope or hype?". Trends in Genetics. 21 (5): 289–297. doi:10.1016/j.tig.2005.03.007. PMID 15851066.
- ^ Brosius J (May 2005). "Waste not, want not--transcript excess in multicellular eukaryotes". Trends in Genetics. 21 (5): 287–288. doi:10.1016/j.tig.2005.02.014. PMID 15851065.
- ^ Palazzo AF, Lee ES (2015). "Non-coding RNA: what is functional and what is junk?". Frontiers in Genetics. 6: 2. doi:10.3389/fgene.2015.00002. PMC 4306305. PMID 25674102.
- ^ Mattick J, Amaral P (2022). RNA, The Epicenter of Genetic Information : A New Understanding of Molecular Biology. CRC Press. ISBN 9780367623920.
- ^ Lee H, Zhang Z, Krause HM (December 2019). "Long Noncoding RNAs and Repetitive Elements: Junk or Intimate Evolutionary Partners?". Trends in Genetics. 35 (12): 892–902. doi:10.1016/j.tig.2019.09.006. PMID 31662190. S2CID 204975291.