Malaysia dan Thailand biasanya bekerja sama dalam berbagai bidang seperti perdagangan dan investasi, keamanan, pendidikan dan pelatihan vokasional, pemuda dan olahraga, pariwisata, konektivitas dan pengembangan sosio-ekonomi di kawasan perbatasan.[3]
Saat ini, hubungan Thai-Melayu dianggap mengasam karena para separatis Pattani beretnis Melayu di tiga provinsi selatan Thailand. Terdapat klaim dari politikus tertentu di Thailand bahwa beberapa partai di Malaysia mengambil sebuah kepentingan dalam sebab perlawanan mereka pada perang tersebut, yang disangkal oleh pemerintah Malaysia.[4] Meskipun demikian, Malaysia telah membantu perbincangan perdamaian antara pemerintah Thai dan separatis.[5]
