Actinomycetota
| Actinomycetota | |
|---|---|
| Actinomyces israelii. | |
| Klasifikasi ilmiah | |
| Domain: | Bacteria |
| Kerajaan: | Bacillati |
| Filum: | Actinomycetota Goodfellow 2021[1][2] |
| Genus tipe | |
| Actinomyces Harz 1877 (Approved Lists 1980) | |
| Kelas | |
| Sinonim | |
| |
Actinomycetota dulu disebut Actinobacteria, atau Actinomycetes adalah filum bakteri yang beranggotakan bakteri Gram positif. Bakteri ini pernah diklasifikasi sebagai fungi (jamur, Mycota) karena ada anggotanya yang membentuk berkas-berkas mirip hifa serta menghasilkan antibiotik. Ketika diketahui memiliki sejumlah ciri bakteri (ukurannya kecil dan dapat diserang virus bakteriofag), kelompok ini pernah dianggap bukan fungi maupun bakteri. Baru setelah pengujian DNA dimungkinkan, kelompok ini diketahui sebagai bakteri.
Karakteristik
[sunting | sunting sumber]Anggota Actinobacteria kebanyakan aerob, tetapi beberapa, seperti Actinomyces israelii, dapat tumbuh dalam kondisi anaerob. Tidak seperti Firmicutes, kelompok utama lain bakteri Gram positif, Actinobacteria memiliki DNA dengan GC-content yang tinggi (sekitar 75%) dan beberapa jenis Actinobacteria memproduksi spora eksternal.[4]
Pembentukan spora pada actinomycetes memungkinkan sel bertahan dalam kondisi lingkungan yang buruk. Selain itu, sifat berfilamen dan kemampuan untuk membentuk spora mendukung mikroba ini untuk beradaptasi dan bersaing dengan mikroba lain yang terdapat di daerah rizosfer.[5]
Secara struktural, actinomycetes mampu membentuk miselia vegetatif dan aerial.[5] Miselium tidak selalu stabil dan dapat pecah menjadi fragmen berbentuk batang atau coccus.[6] Bakteri ini juga membentuk struktur reproduksi berupa konidia atau sporangia. Kemampuan ini menyebabkan penampakan koloninya menyerupai jamur.[4] Meskipun demikian, profil genetik dan seluler actinomycetes adalah karakteristik bakteri, seperti kromosom yang dibungkus dengan nukleoid prokariotik.[7] Struktur dinding selnya yang kaku terbentuk dari senyawa kompleks seperti polisakarida, peptidoglikan, asam teikoat, dan teichuronic.[5]
Habitat
[sunting | sunting sumber]Actinomycetes tersebar di berbagai wilayah, mulai dari daerah tropis hingga beriklim sedang. Mikroorganisme ini dapat ditemukan pada beragam habitat, termasuk lingkungan darat, air tawar, dan laut. Hal ini dikarenakan bakteri umumnya bersifat mesofilik, dengan suhu pertumbuhan optimal berkisar antara 25–30 °C. Namun, beberapa strain ditemukan tumbuh optimal pada suhu lebih tinggi (termofilik), yaitu sekitar 55–65 °C .[4]
Kebanyakan Actinobacteria ditemukan di tanah. Ketersediaan mikroba ini pada tanah mewakili lebih dari 30% dari seluruh populasi mikroba.[7] Sebagian yang lain tinggal di dalam tumbuhan dan hewan, termasuk beberapa patogen seberti Mycobacterium. Mereka memainkan peranan yang penting dalam dekomposisi materi organik seperti selulosa dan kitin. Aktivitas ini menambah cadangan hara di dalam tanah dan merupakan bagian penting dari pembentukan humus. Kemampuan Actinobacteria untuk hidup di lingkungan bernutrisi rendah dan untuk mengonsumsi lognoselulosa (lignin dan selulosa, zat-zat penyusun kayu, biasanya sukar dicerna kebanyakan bakteri tanah) menyebabkan Actinobacteria mendominasi kawasan bebatuan karst. Pemberian pupuk kandang yang kaya selulosa akan meningkatkan populasi Aktinobakteri di tanah. Pemupukan amonium atau nitrat yang terus-menerus menekan populasi karena Aktinobakteri tidak suka pH di bawah 6; sebaliknya, pengapuran untuk menaikkan pH juga menaikkan populasinya.
Peran ekonomis
[sunting | sunting sumber]Beberapa aktinobakteri menyebabkan gangguan kesehatan pada manusia, hewan, dan tumbuhan. Streptomyces ada yang menyebabkan penyakit skabies (kudis) pada umbi kentang. S. griceus menghasilkan antibiotik streptomisin. Jenis-jenis Frankia membentuk simbiosis mutualisme dengan akar tumbuhan sehingga membantu pertumbuhan tanaman. Beberapa aktinobakteria menghasilkan geosmin, suatu senyawa organik yang bertanggung jawab atas bau tanah/lumpur pada tambak atau perairan diam lainnya.
Filogeni
[sunting | sunting sumber]Filogeni didasarkan pada LTP rilis 123 berdasarkan RNA ribosomal 16s oleh 'The All-Species Living Tree' Project.[8]
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Referensi
[sunting | sunting sumber]- ↑ Oren A, Garrity GM (2021). "Valid publication of the names of forty-two phyla of prokaryotes". Int J Syst Evol Microbiol. 71 (10): 5056. doi:10.1099/ijsem.0.005056. PMID 34694987. S2CID 239887308.
- ↑ Kesalahan pengutipan: Tanda
<ref>tidak sah; tidak ditemukan teks untuk ref bernamaLPSN - ↑ Goodfellow M (2012). "Phylum XXVI. Actinobacteria phyl. nov.". Dalam Goodfellow M, Kämpfer P, Trujillo ME, Suzuki K, Ludwig W, Whitman WB (ed.). Bergey's Manual of Systematic Bacteriology. Vol. 5 (Edisi 2nd). New York, NY: Springer. hlm. 33–34.
- 1 2 3 Das, Pompi; Singh, Sushil Kumar; Singh, Pooja; Zeyad, Mohammad Tarique; Aamir, Mohd; Upadhyay, Ram S. (2021). Actinomycetes as biostimulants and their application in agricultural practices. Elsevier. hlm. 267–282. ISBN 978-0-12-822122-8.
- 1 2 3 Torres-Rodriguez, Juan A.; Reyes-Pérez, Juan J.; Quiñones-Aguilar, Evangelina E.; Hernandez-Montiel, Luis G. (2022-11-23). "Actinomycete Potential as Biocontrol Agent of Phytopathogenic Fungi: Mechanisms, Source, and Applications". Plants. 11 (23): 3201. doi:10.3390/plants11233201. ISSN 2223-7747. Pemeliharaan CS1: DOI bebas tanpa ditandai (link)
- ↑ Meenakshi, S.; Hiremath, Jyothi; Meenakshi, M.H.; Shivaveerakumar, S. (2024-03-01). "Actinomycetes: Isolation, Cultivation and its Active Biomolecules". Journal of Pure and Applied Microbiology. 18 (1): 118–143. doi:10.22207/jpam.18.1.48. ISSN 0973-7510.
- 1 2 Silva, Guilherme da Cruz; Kitano, Isabella Takahashi; Ribeiro, Iron Amoreli de Figueiredo; Lacava, Paulo Teixeira (2022-02-21). "The Potential Use of Actinomycetes as Microbial Inoculants and Biopesticides in Agriculture". Frontiers in Soil Science. 2. doi:10.3389/fsoil.2022.833181. ISSN 2673-8619. Pemeliharaan CS1: DOI bebas tanpa ditandai (link)
- ↑ 'The All-Species Living Tree' Project."16S rRNA-based LTP release 123 (full tree)" (PDF). Silva Comprehensive Ribosomal RNA Database. Diarsipkan dari asli (PDF) tanggal 2019-06-07. Diakses tanggal 2016-03-20.